MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	CGT	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017943	TGC	3	9	1313	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017943	TCT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017943	GAT	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017943	AAT	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017943	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017943	AAT	2	6	1441	1446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017943	AAT	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017943	ACC	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017943	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017943	TTTAC	2	10	1657	1666	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017943	ACT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017943	GTT	2	6	1778	1783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017943	ATT	2	6	1805	1810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017943	AAT	2	6	3107	3112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017943	CTAC	2	8	3204	3211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017943	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017943	AAT	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017943	GTC	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017943	ATG	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017943	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017943	GTC	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017943	GCA	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017943	GA	3	6	3741	3746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017943	AT	3	6	3769	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017943	TTGA	2	8	3803	3810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017943	TCGC	2	8	4578	4585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017943	GTC	2	6	8041	8046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017943	AT	4	8	8052	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017943	T	6	6	10578	10583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017943	CGA	2	6	10588	10593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017943	GACG	2	8	10598	10605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017943	ACT	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017943	GGA	2	6	11410	11415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017943	CCT	2	6	11438	11443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017943	ACTT	2	8	12239	12246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017943	TC	3	6	12258	12263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017943	TAA	2	6	12289	12294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017943	AC	4	8	12306	12313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017943	GAA	2	6	12339	12344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017943	TTTC	2	8	12577	12584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017943	TTCGAG	2	12	12585	12596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017943	AGC	2	6	12674	12679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017943	ATG	2	6	15169	15174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017943	TTG	2	6	15177	15182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017943	A	7	7	15256	15262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017943	GAG	2	6	15282	15287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017943	TTGTG	2	10	15374	15383	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017943	CAT	2	6	15463	15468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017943	GA	3	6	15514	15519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017943	CGA	2	6	15523	15528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017943	TCTGGG	2	12	15624	15635	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017943	CGG	2	6	15716	15721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017943	GGAT	2	8	15767	15774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017943	GTC	2	6	15787	15792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017943	CGG	2	6	15838	15843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017943	ATT	2	6	15860	15865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017943	CAT	2	6	15892	15897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017943	CT	3	6	15932	15937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017943	GCC	2	6	15978	15983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017943	GCG	2	6	15996	16001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017943	GCAG	2	8	16016	16023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017943	GCC	2	6	16036	16041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017943	GTG	2	6	19083	19088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017943	GTG	2	6	20668	20673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017943	TAT	2	6	20676	20681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017943	AT	3	6	20737	20742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017943	CG	3	6	20756	20761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017943	GAC	2	6	20765	20770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017943	TAGC	2	8	20774	20781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017943	AT	3	6	20797	20802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017943	TTAAT	2	10	20812	20821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017943	G	6	6	20836	20841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017943	TAG	2	6	20884	20889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017943	CGAG	2	8	20930	20937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017943	CTA	2	6	20958	20963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017943	TGC	2	6	20974	20979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017943	CGG	2	6	21030	21035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017943	TGC	2	6	21136	21141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017943	AG	3	6	21155	21160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017943	TTC	2	6	21171	21176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017943	CCG	2	6	21250	21255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017943	CGA	2	6	21282	21287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017943	GTT	2	6	21369	21374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017943	TC	3	6	21484	21489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017943	TGGG	2	8	21588	21595	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017943	CCG	2	6	21611	21616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017943	GTTC	2	8	21629	21636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017943	AGG	2	6	21691	21696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017943	GTC	2	6	22093	22098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017943	ATA	2	6	22099	22104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017943	TTTAAA	2	12	22118	22129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017943	CAG	3	9	24368	24376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017943	TC	3	6	24855	24860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017943	TCC	2	6	24887	24892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017943	GCT	2	6	24984	24989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017943	TC	3	6	25007	25012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017943	GTT	2	6	25104	25109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017943	CTC	2	6	25141	25146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017943	TCG	2	6	25463	25468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017943	TACGG	2	10	25472	25481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017943	TG	3	6	25499	25504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017943	AAT	2	6	25560	25565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017943	AAG	2	6	25589	25594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017943	CAG	2	6	25671	25676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017943	TG	3	6	25703	25708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017943	TA	3	6	25710	25715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017943	TAT	2	6	25719	25724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017943	CCTG	2	8	25736	25743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017943	CT	3	6	25761	25766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017943	GC	3	6	25814	25819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017943	CAC	2	6	25844	25849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017943	TTC	2	6	27021	27026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017943	TA	3	6	27046	27051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017943	TCA	2	6	27060	27065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017943	TCGT	2	8	27164	27171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017943	ACT	2	6	29195	29200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017943	ACCC	2	8	29595	29602	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_017943	A	7	7	31354	31360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017943	TCA	2	6	33272	33277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017943	AT	4	8	33293	33300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017943	TCGTC	2	10	33371	33380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017943	CGT	2	6	33399	33404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017943	TCG	2	6	33406	33411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017943	TG	3	6	34783	34788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017943	GAC	2	6	34806	34811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017943	AC	3	6	34810	34815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017943	GCC	2	6	34842	34847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017943	TTA	2	6	34859	34864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017943	CTG	2	6	36045	36050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017943	TCC	2	6	37946	37951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017943	GTC	2	6	37962	37967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017943	CGT	2	6	37973	37978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017943	ATC	2	6	38068	38073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017943	AC	3	6	38077	38082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017943	AGT	2	6	38117	38122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017943	ACG	2	6	38134	38139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017943	CGA	2	6	38143	38148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017943	CGG	2	6	38235	38240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017943	GCTA	2	8	38248	38255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017943	TTGG	2	8	39712	39719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017943	TC	3	6	42968	42973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017943	TCCC	2	8	42987	42994	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017943	GAC	2	6	43003	43008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017943	TTA	2	6	43030	43035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017943	TG	3	6	43171	43176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017943	TG	3	6	44844	44849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_017943	GTC	2	6	164643	164648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_017943	TCG	2	6	173801	173806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_017943	CTA	2	6	178664	178669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_017943	AT	3	6	180701	180706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_017943	CGG	2	6	181110	181115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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