MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM100

Total Repeats: 637

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017942	ACA	2	6	105619	105624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017942	ACG	2	6	106233	106238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017942	GCC	2	6	106256	106261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017942	ACTC	2	8	106269	106276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_017942	GGTG	2	8	106289	106296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017942	CAG	2	6	107407	107412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017942	CA	3	6	107610	107615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017942	TGC	2	6	107650	107655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017942	ACC	2	6	107738	107743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017942	GTCG	2	8	107763	107770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_017942	CTC	2	6	107771	107776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_017942	CTG	2	6	107789	107794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017942	GCT	2	6	107853	107858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017942	TA	3	6	107869	107874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017942	CGA	2	6	107906	107911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017942	CCA	2	6	107960	107965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017942	GAC	2	6	107966	107971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017942	CGG	2	6	109412	109417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017942	GT	3	6	109438	109443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017942	CGAA	2	8	112686	112693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_017942	CGGT	2	8	112726	112733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
522	NC_017942	GCCGC	2	10	112753	112762	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
523	NC_017942	GAG	2	6	112779	112784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017942	TCG	2	6	112795	112800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017942	GTC	2	6	113189	113194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017942	CGGC	2	8	115602	115609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_017942	ACTC	2	8	115619	115626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_017942	TCT	2	6	115631	115636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017942	TGG	2	6	115641	115646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017942	CT	3	6	116328	116333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017942	TCT	2	6	116354	116359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017942	GTT	2	6	116410	116415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017942	GGT	2	6	116450	116455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017942	TCA	2	6	116743	116748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017942	TCG	2	6	116755	116760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017942	GTTC	2	8	116761	116768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017942	TTG	2	6	116774	116779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017942	CTA	2	6	116787	116792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017942	AGC	2	6	116797	116802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017942	CTA	2	6	116850	116855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017942	TTG	2	6	116858	116863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017942	AGA	2	6	118756	118761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017942	GCC	2	6	119511	119516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017942	TGC	2	6	120951	120956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017942	ATA	2	6	120970	120975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017942	TAG	2	6	122292	122297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017942	AATG	2	8	122302	122309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017942	TA	3	6	122337	122342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017942	TGG	2	6	122346	122351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017942	AAT	2	6	122379	122384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017942	AGC	2	6	122444	122449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017942	GTAG	2	8	122460	122467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017942	CT	4	8	122483	122490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017942	CA	3	6	122506	122511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_017942	CAC	2	6	122516	122521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017942	CT	3	6	122571	122576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_017942	A	6	6	122600	122605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017942	TCA	2	6	122669	122674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017942	GGTT	2	8	122679	122686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017942	CAAT	2	8	124023	124030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_017942	GCA	2	6	124151	124156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017942	CAA	2	6	124163	124168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017942	CGA	2	6	124253	124258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017942	TC	3	6	124298	124303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017942	CGCT	2	8	124388	124395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_017942	TG	3	6	124417	124422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017942	AT	3	6	124541	124546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017942	GGA	2	6	124588	124593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017942	CGC	2	6	124615	124620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017942	AATC	2	8	124695	124702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017942	TC	3	6	124709	124714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017942	GT	3	6	124751	124756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017942	CTCG	2	8	125185	125192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017942	GA	3	6	125237	125242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017942	CT	3	6	125315	125320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_017942	TTC	2	6	125367	125372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017942	AT	3	6	125382	125387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017942	TTC	2	6	125404	125409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017942	ATC	2	6	125420	125425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017942	CAGC	2	8	125431	125438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017942	GCT	2	6	125549	125554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017942	CTT	2	6	125572	125577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017942	TCG	2	6	125631	125636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017942	TGAAC	2	10	125701	125710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
585	NC_017942	ACG	2	6	125724	125729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017942	AG	3	6	125735	125740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017942	TGAGA	2	10	125766	125775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017942	ATT	2	6	125885	125890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017942	GAA	2	6	125897	125902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017942	TTG	2	6	126063	126068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017942	TAT	2	6	126103	126108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017942	T	6	6	126114	126119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017942	TTG	2	6	126142	126147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017942	CTT	2	6	126170	126175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017942	TTA	2	6	126199	126204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017942	CAC	2	6	126379	126384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_017942	CAG	2	6	126436	126441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017942	GAT	2	6	126456	126461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017942	GGA	2	6	126733	126738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017942	ATA	2	6	126907	126912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017942	ACA	2	6	126930	126935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017942	ATATA	2	10	126973	126982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017942	ATA	2	6	127026	127031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017942	CCA	2	6	127234	127239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017942	CAT	2	6	127270	127275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017942	GCC	2	6	127373	127378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_017942	AGTC	2	8	127403	127410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_017942	GCT	2	6	127416	127421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017942	CCCAC	2	10	127432	127441	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
610	NC_017942	TCG	2	6	127506	127511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017942	TCC	2	6	127552	127557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_017942	ACAA	2	8	127580	127587	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_017942	GCC	2	6	127611	127616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017942	TCC	2	6	127625	127630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_017942	AT	3	6	127654	127659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017942	CAGG	2	8	127952	127959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_017942	GTCCTT	2	12	128092	128103	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017942	GGTT	2	8	128139	128146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017942	ATC	2	6	128187	128192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017942	CACTT	2	10	128203	128212	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
621	NC_017942	CTG	2	6	128289	128294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017942	CGT	2	6	128320	128325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017942	GTA	2	6	128510	128515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017942	CTT	2	6	128553	128558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017942	TTA	2	6	128566	128571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017942	AGT	4	12	128593	128604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017942	TAG	2	6	128606	128611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017942	AGAA	2	8	128612	128619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017942	GAT	2	6	128772	128777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017942	GGTGTG	2	12	128889	128900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017942	TGTGG	2	10	128949	128958	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017942	GT	3	6	128959	128964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017942	CCGT	2	8	129039	129046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_017942	CCT	2	6	129083	129088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_017942	CTT	2	6	129102	129107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017942	TC	3	6	129119	129124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_017942	GCT	2	6	129135	129140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous 12Next >