MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 9045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017941	T	6	6	188031	188036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017941	AG	3	6	188047	188052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017941	GTTG	2	8	189879	189886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017941	TAA	2	6	189908	189913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017941	CGG	2	6	190391	190396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017941	GTG	2	6	190413	190418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017941	TG	3	6	190417	190422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017941	GTGA	2	8	191266	191273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017941	GTC	2	6	191300	191305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017941	GTC	2	6	191334	191339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017941	GGC	2	6	191368	191373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017941	GCT	2	6	192385	192390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017941	CTA	2	6	192449	192454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017941	TCG	2	6	194975	194980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017941	GGAA	2	8	195485	195492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017941	GGC	2	6	198373	198378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017941	TCTT	2	8	198387	198394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_017941	CT	3	6	198395	198400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017941	CCT	2	6	198419	198424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017941	GACG	2	8	198430	198437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_017941	TCGC	2	8	198445	198452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_017941	CGA	2	6	198454	198459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017941	TGT	2	6	199250	199255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017941	ACA	2	6	199308	199313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017941	CGC	2	6	200175	200180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_017941	TCTT	2	8	200188	200195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_017941	ACT	2	6	200219	200224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017941	CGTC	2	8	200231	200238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017941	TCG	2	6	201500	201505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017941	ACA	2	6	201531	201536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017941	ACAT	2	8	201541	201548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_017941	CACG	2	8	201910	201917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_017941	ACG	2	6	201970	201975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017941	GTTA	2	8	201978	201985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017941	ATG	2	6	202032	202037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017941	TTAT	2	8	202038	202045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017941	ATCAAT	2	12	202047	202058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_017941	ACT	2	6	202073	202078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017941	CTCGA	2	10	202849	202858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
540	NC_017941	CGT	2	6	202873	202878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017941	TAAT	2	8	202934	202941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017941	T	6	6	204077	204082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017941	CGC	2	6	204882	204887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017941	CATC	2	8	205085	205092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017941	CGA	2	6	205832	205837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017941	GATT	2	8	205916	205923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017941	CGAA	2	8	205975	205982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_017941	CGC	2	6	205985	205990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_017941	ATG	2	6	206004	206009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017941	CGG	2	6	206024	206029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017941	GAC	2	6	206588	206593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017941	CCG	2	6	206607	206612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_017941	TCGAA	2	10	206649	206658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
554	NC_017941	A	6	6	206667	206672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017941	AATC	2	8	208810	208817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017941	TTCGGG	2	12	208882	208893	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
557	NC_017941	CCCT	2	8	208902	208909	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
558	NC_017941	TCGCT	2	10	208924	208933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
559	NC_017941	GGCT	2	8	211011	211018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017941	CCG	2	6	211021	211026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_017941	TCA	5	15	211060	211074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017941	TC	3	6	211086	211091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_017941	CATGA	2	10	211840	211849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
564	NC_017941	GAC	2	6	211864	211869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017941	GAC	2	6	217674	217679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017941	AAC	2	6	217704	217709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017941	CAA	2	6	217738	217743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017941	CAA	2	6	217762	217767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017941	TTC	2	6	217795	217800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017941	TA	3	6	219157	219162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017941	GGC	2	6	219169	219174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017941	GAA	2	6	220732	220737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017941	CGT	2	6	220739	220744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017941	GTCG	2	8	220773	220780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_017941	CGG	2	6	220786	220791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017941	TTTG	2	8	221815	221822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017941	ACC	2	6	221833	221838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_017941	CACC	2	8	222385	222392	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
579	NC_017941	GAAGA	2	10	222436	222445	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017941	CGC	2	6	222446	222451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_017941	GGTTC	2	10	223214	223223	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
582	NC_017941	TGG	2	6	223290	223295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017941	GGT	2	6	223787	223792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017941	CGC	2	6	223922	223927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017941	TGG	2	6	223955	223960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017941	GTC	2	6	223964	223969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017941	GTC	2	6	223989	223994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017941	GTC	2	6	224014	224019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017941	GGT	2	6	224024	224029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017941	GTC	2	6	224040	224045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017941	CGC	2	6	224116	224121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_017941	CAG	2	6	224147	224152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017941	GCGG	2	8	224161	224168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
594	NC_017941	ATG	2	6	224196	224201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017941	TCG	2	6	224202	224207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017941	TGT	2	6	224219	224224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017941	TGA	2	6	224243	224248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017941	TC	3	6	224259	224264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_017941	GT	3	6	225173	225178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017941	TCT	2	6	226072	226077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017941	G	6	6	226078	226083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017941	TCG	2	6	227393	227398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017941	CCA	2	6	227423	227428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017941	TAGC	2	8	227439	227446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_017941	ACG	2	6	227462	227467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017941	CCGC	2	8	227483	227490	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
607	NC_017941	CTT	2	6	228672	228677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017941	G	6	6	229513	229518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017941	CGG	2	6	229521	229526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017941	ACA	2	6	229542	229547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017941	AACC	2	8	231765	231772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_017941	CTG	2	6	231826	231831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017941	TCG	2	6	231837	231842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017941	GGC	2	6	233283	233288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017941	CGC	2	6	233802	233807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_017941	CGT	2	6	233902	233907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017941	CTC	2	6	233977	233982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_017941	T	6	6	234016	234021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017941	GGC	2	6	234102	234107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017941	GTA	2	6	234142	234147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017941	GTC	2	6	234354	234359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017941	TC	3	6	235634	235639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_017941	CGA	3	9	236699	236707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017941	CGA	3	9	236723	236731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017941	TTC	2	6	236779	236784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017941	GTG	2	6	236804	236809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017941	GCC	2	6	236850	236855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017941	G	6	6	236875	236880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017941	GGA	2	6	238505	238510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017941	GAA	2	6	238514	238519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017941	TGGGA	2	10	238534	238543	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017941	GGCA	2	8	238560	238567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_017941	GAC	2	6	238587	238592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017941	AGGGGC	2	12	238601	238612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
635	NC_017941	CGT	2	6	238637	238642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017941	AC	3	6	238696	238701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_017941	AAC	2	6	238712	238717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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