MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori XZ274 plasmid pXZ274

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017919	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017919	CAGGCT	2	12	135	146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017919	TAAA	2	8	174	181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017919	TTG	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017919	TAA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017919	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017919	GTA	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017919	A	6	6	2277	2282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017919	AAT	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017919	T	6	6	2715	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017919	ACC	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017919	TAA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017919	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017919	TA	3	6	2828	2833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017919	AAC	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017919	ATGG	2	8	5116	5123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017919	TAT	2	6	7102	7107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017919	TTAA	2	8	7216	7223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017919	A	7	7	7222	7228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017919	T	6	6	7267	7272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017919	TTA	2	6	7309	7314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017919	A	6	6	7927	7932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017919	CAA	3	9	7941	7949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017919	TTTAA	2	10	7962	7971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017919	CTACA	2	10	8027	8036	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017919	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017919	T	6	6	8107	8112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017919	CAA	2	6	8115	8120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017919	AAG	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017919	A	6	6	8160	8165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017919	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017919	T	7	7	10830	10836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017919	TGA	2	6	12170	12175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017919	ATATT	2	10	13020	13029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017919	ATT	3	9	13055	13063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017919	AAT	2	6	13064	13069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017919	TTC	2	6	13098	13103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017919	A	6	6	14220	14225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017919	A	6	6	14227	14232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017919	AAT	2	6	14250	14255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017919	TAAAAG	2	12	14283	14294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017919	CTTT	2	8	18909	18916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017919	T	6	6	18914	18919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017919	TTG	2	6	22394	22399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.