MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 4873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TTC	2	6	2459	2464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017742	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017742	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017742	AAT	2	6	4155	4160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017742	TGG	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017742	TGG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017742	GTG	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017742	ACC	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017742	GGT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017742	T	8	8	4606	4613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017742	GTTAGT	2	12	4768	4779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017742	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017742	TTA	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017742	T	6	6	4843	4848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017742	A	6	6	4868	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017742	TGT	2	6	4907	4912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017742	TCATT	2	10	4918	4927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017742	GTTT	2	8	4930	4937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017742	AAG	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017742	ACTA	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017742	A	6	6	5083	5088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017742	A	7	7	5121	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017742	AG	3	6	5139	5144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017742	A	6	6	5148	5153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017742	A	6	6	5162	5167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017742	TAA	2	6	5175	5180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017742	AG	3	6	5182	5187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017742	CAAAA	2	10	5204	5213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017742	C	7	7	5215	5221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_017742	A	7	7	5222	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017742	A	6	6	5239	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017742	A	6	6	5255	5260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017742	A	6	6	5271	5276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017742	A	6	6	5287	5292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017742	CAAA	2	8	5301	5308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017742	CAAAA	2	10	5314	5323	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017742	C	6	6	5325	5330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_017742	A	7	7	5331	5337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017742	A	6	6	5345	5350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017742	A	8	8	5353	5360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017742	AG	3	6	5375	5380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017742	A	6	6	7441	7446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017742	AGC	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017742	GA	8	16	7480	7495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017742	T	7	7	7505	7511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017742	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017742	T	11	11	7586	7596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017742	T	6	6	7627	7632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017742	TTTG	2	8	7638	7645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017742	GGT	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017742	TTTTA	2	10	7670	7679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017742	T	6	6	7718	7723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017742	C	6	6	7765	7770	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_017742	AAG	2	6	7771	7776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017742	TAA	3	9	9467	9475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017742	ATAA	2	8	9859	9866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017742	TTA	2	6	9889	9894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017742	ATTATA	2	12	9953	9964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017742	ATT	2	6	9968	9973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017742	TTA	2	6	9994	9999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017742	CAA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017742	TATT	2	8	10058	10065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017742	A	6	6	10096	10101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017742	T	8	8	12861	12868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017742	AGG	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017742	T	6	6	13779	13784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017742	GCTTT	2	10	13792	13801	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017742	T	6	6	13799	13804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017742	ACC	2	6	13823	13828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017742	T	7	7	13861	13867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017742	TTAA	2	8	13890	13897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017742	A	6	6	16831	16836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017742	CA	3	6	16878	16883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017742	CTG	2	6	16899	16904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017742	A	7	7	17042	17048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017742	A	7	7	18486	18492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017742	AAACAC	2	12	18521	18532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017742	T	6	6	20772	20777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017742	T	7	7	20785	20791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017742	ATCA	2	8	22963	22970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017742	T	6	6	23032	23037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017742	TGT	2	6	23073	23078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017742	TTA	2	6	23235	23240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017742	TTA	2	6	23326	23331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017742	A	6	6	23331	23336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017742	GCTT	2	8	23341	23348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017742	T	6	6	23365	23370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017742	A	6	6	23371	23376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017742	A	6	6	23419	23424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017742	TGG	2	6	23432	23437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017742	A	6	6	23438	23443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017742	A	6	6	23446	23451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017742	A	6	6	23506	23511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017742	A	6	6	23518	23523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017742	C	6	6	23531	23536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_017742	A	6	6	23537	23542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017742	GA	3	6	23543	23548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017742	A	6	6	23553	23558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017742	CTT	2	6	25675	25680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017742	GATT	2	8	25688	25695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017742	ATTA	2	8	25784	25791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017742	T	6	6	25796	25801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017742	A	12	12	25811	25822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017742	GTT	2	6	25884	25889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017742	A	6	6	25907	25912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017742	T	6	6	25918	25923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017742	GTT	2	6	25931	25936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017742	TTTG	2	8	25942	25949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017742	ATC	2	6	26002	26007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017742	CTT	2	6	26028	26033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017742	A	6	6	26035	26040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017742	ATT	2	6	26078	26083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017742	A	6	6	26084	26089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017742	ATC	2	6	26198	26203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017742	AGCCT	2	10	26222	26231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017742	A	6	6	27562	27567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017742	T	7	7	27597	27603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017742	A	6	6	27641	27646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017742	TA	3	6	27660	27665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017742	T	6	6	29000	29005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017742	A	7	7	29027	29033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017742	GGTT	2	8	32076	32083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017742	TAA	2	6	40723	40728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017742	A	6	6	40733	40738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017742	AG	3	6	40743	40748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017742	TAA	2	6	42189	42194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017742	CAAA	2	8	44383	44390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017742	ACC	2	6	44527	44532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017742	TTGCA	2	10	44535	44544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017742	AAT	2	6	44574	44579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017742	ATTGT	2	10	44586	44595	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017742	GTTT	2	8	44612	44619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017742	T	6	6	44972	44977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017742	TC	3	6	45013	45018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017742	TAG	2	6	45033	45038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017742	ACTTAG	2	12	45039	45050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017742	AG	3	6	45069	45074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017742	T	6	6	50648	50653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017742	TAC	2	6	50713	50718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017742	A	7	7	50736	50742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017742	TAGC	2	8	50770	50777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017742	TTTA	2	8	59649	59656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017742	T	6	6	59720	59725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017742	TAAT	2	8	59749	59756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017742	TAA	3	9	59855	59863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017742	AACGA	2	10	59900	59909	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017742	TTAAA	2	10	59912	59921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017742	ACAAA	2	10	59940	59949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017742	TTA	2	6	60173	60178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017742	G	6	6	60193	60198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017742	ATATA	2	10	60253	60262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017742	C	13	13	60357	60369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_017742	AAT	2	6	60370	60375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017742	AGA	2	6	60426	60431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017742	ATA	2	6	135280	135285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017742	GAT	2	6	135313	135318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017742	AGA	3	9	135355	135363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017742	TTG	2	6	135401	135406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017742	TAGC	2	8	136299	136306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
451	NC_017742	G	6	6	136322	136327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017742	CTTT	2	8	136328	136335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
453	NC_017742	CTT	2	6	136354	136359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_017742	CT	3	6	136375	136380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_017742	ACC	2	6	136427	136432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_017742	T	6	6	136435	136440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017742	T	8	8	136469	136476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_017742	A	6	6	136731	136736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_017742	TAC	2	6	136773	136778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_017742	ATTT	2	8	136858	136865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017742	T	6	6	136887	136892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017742	T	6	6	139605	139610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017742	GGT	2	6	139621	139626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_017742	TAA	2	6	139699	139704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_017742	TCT	2	6	141108	141113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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474	NC_017742	AAT	2	6	141230	141235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017742	TGA	2	6	141267	141272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_017742	A	6	6	141620	141625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017742	ATA	2	6	145053	145058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017742	T	6	6	145176	145181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_017742	ATT	2	6	145210	145215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_017742	T	6	6	146907	146912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_017742	A	6	6	156056	156061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_017742	A	6	6	156076	156081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_017742	A	7	7	156172	156178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_017742	A	6	6	156242	156247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_017742	TTG	2	6	156296	156301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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