MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 4001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017739	CTG	2	6	1444267	1444272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017739	GT	3	6	1444308	1444313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017739	TTACC	2	10	1444361	1444370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3504	NC_017739	ATC	2	6	1444441	1444446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017739	CGC	2	6	1444567	1444572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_017739	T	6	6	1444635	1444640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017739	TAA	2	6	1444660	1444665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017739	ACA	3	9	1444735	1444743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017739	ATA	2	6	1444836	1444841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017739	CAAT	2	8	1444842	1444849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_017739	ACA	2	6	1445924	1445929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017739	A	7	7	1453737	1453743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017739	AT	3	6	1453789	1453794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017739	A	6	6	1453828	1453833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017739	AT	3	6	1456227	1456232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017739	AAT	2	6	1456470	1456475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017739	AG	3	6	1456516	1456521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017739	CAAG	2	8	1456578	1456585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_017739	T	8	8	1459166	1459173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017739	TTAA	2	8	1459247	1459254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017739	T	6	6	1459261	1459266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017739	AACA	2	8	1459267	1459274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_017739	A	6	6	1459293	1459298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017739	T	6	6	1459302	1459307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017739	A	6	6	1459324	1459329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017739	A	6	6	1459355	1459360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017739	A	6	6	1459367	1459372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017739	TAA	2	6	1459395	1459400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017739	T	6	6	1459746	1459751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017739	A	6	6	1464242	1464247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017739	ATT	2	6	1464274	1464279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017739	TGG	2	6	1464286	1464291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017739	TAA	2	6	1464295	1464300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017739	TAT	2	6	1464310	1464315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017739	TTG	2	6	1465549	1465554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017739	TCC	2	6	1466163	1466168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_017739	TC	3	6	1469585	1469590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_017739	TGTT	2	8	1469622	1469629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017739	GATT	2	8	1469692	1469699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017739	T	6	6	1472247	1472252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017739	TTTATA	2	12	1472262	1472273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017739	ATA	3	9	1472309	1472317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017739	T	6	6	1472320	1472325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017739	A	6	6	1472339	1472344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017739	TCAA	2	8	1475040	1475047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3547	NC_017739	CTTTT	2	10	1488864	1488873	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3549	NC_017739	T	6	6	1493132	1493137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017739	ATAAA	2	10	1496036	1496045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017739	GTT	2	6	1497786	1497791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3553	NC_017739	T	6	6	1501056	1501061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017739	TTATT	2	10	1501077	1501086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017739	A	6	6	1502219	1502224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017739	TAA	2	6	1503342	1503347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3558	NC_017739	GAAA	2	8	1504430	1504437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017739	AT	3	6	1504450	1504455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017739	GAA	2	6	1504466	1504471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3563	NC_017739	ATA	2	6	1505909	1505914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017739	TAG	2	6	1505944	1505949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3566	NC_017739	TTA	2	6	1511753	1511758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017739	TTA	2	6	1511771	1511776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017739	TAATA	2	10	1511777	1511786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017739	C	6	6	1511787	1511792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3571	NC_017739	TGG	2	6	1511854	1511859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_017739	A	6	6	1518688	1518693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3585	NC_017739	A	6	6	1521318	1521323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_017739	AAT	2	6	1521414	1521419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_017739	T	8	8	1525459	1525466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017739	AAC	2	6	1525492	1525497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3601	NC_017739	T	6	6	1529259	1529264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017739	TAAA	2	8	1529297	1529304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017739	T	8	8	1529327	1529334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017739	TCA	2	6	1529351	1529356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017739	TGTAT	2	10	1529366	1529375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017739	C	6	6	1529552	1529557	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3607	NC_017739	TAGC	2	8	1529778	1529785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_017739	AAT	2	6	1529871	1529876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017739	ATC	2	6	1529914	1529919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3611	NC_017739	TGA	2	6	1530033	1530038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3613	NC_017739	TTA	2	6	1530080	1530085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3615	NC_017739	TAA	2	6	1530172	1530177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3617	NC_017739	T	6	6	1530282	1530287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017739	T	7	7	1530321	1530327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017739	GATAA	2	10	1532264	1532273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017739	T	6	6	1534073	1534078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017739	T	6	6	1534084	1534089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017739	T	6	6	1534112	1534117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017739	TAA	2	6	1534121	1534126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017739	GCTTG	2	10	1534136	1534145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3625	NC_017739	AGA	2	6	1534165	1534170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3634	NC_017739	TGAA	2	8	1537272	1537279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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