MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266 plasmid PL3

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017670	GAT	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017670	T	7	7	1182	1188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017670	TTA	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017670	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017670	A	6	6	1767	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017670	T	8	8	1804	1811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017670	T	6	6	1822	1827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017670	AGC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017670	A	6	6	1889	1894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017670	A	7	7	1913	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017670	TG	3	6	1940	1945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017670	T	6	6	1947	1952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017670	TCGT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017670	TAAA	2	8	2010	2017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017670	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017670	GATCT	2	10	2139	2148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017670	T	6	6	2159	2164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017670	TCT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017670	GAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017670	T	7	7	2239	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017670	TTTA	2	8	2248	2255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017670	TTGT	2	8	2269	2276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017670	TAACA	2	10	2303	2312	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017670	AGTTA	2	10	2355	2364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017670	ATA	2	6	2440	2445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017670	AG	3	6	2582	2587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017670	T	7	7	2616	2622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017670	A	6	6	2628	2633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017670	AAAG	2	8	2653	2660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017670	TTTTA	2	10	2674	2683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017670	A	7	7	2714	2720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017670	TTG	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017670	GGGGT	2	10	2791	2800	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017670	CAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017670	T	7	7	2852	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017670	TAA	2	6	2862	2867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017670	T	6	6	3116	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017670	TTGAT	2	10	3198	3207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017670	A	6	6	3220	3225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017670	TGG	2	6	3229	3234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017670	A	6	6	3239	3244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017670	GTTATG	2	12	3253	3264	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017670	TGA	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.