MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 5846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017452	T	6	6	1893	1898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017452	A	6	6	1902	1907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017452	ATT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017452	TA	3	6	2006	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017452	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017452	AAC	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017452	ATTCT	2	10	2033	2042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017452	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017452	TAAG	2	8	2458	2465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017452	TGA	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017452	TA	3	6	3122	3127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017452	TAAA	2	8	3137	3144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017452	CTT	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017452	TGA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017452	AGA	2	6	6545	6550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017452	AAAAG	2	10	6555	6564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017452	T	7	7	6585	6591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017452	ATT	2	6	6628	6633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017452	T	6	6	8374	8379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017452	ATA	2	6	8380	8385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017452	CG	3	6	8405	8410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017452	AATG	2	8	9170	9177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017452	AAT	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017452	TCTA	2	8	9208	9215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017452	T	8	8	9224	9231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017452	ATA	2	6	9536	9541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017452	T	7	7	10291	10297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017452	GTT	2	6	10307	10312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017452	TAT	2	6	10333	10338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017452	AATT	2	8	10366	10373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017452	T	6	6	12497	12502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017452	T	7	7	12548	12554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017452	ATA	2	6	12555	12560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017452	AAG	2	6	12561	12566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017452	ATT	2	6	14903	14908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017452	T	7	7	14914	14920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017452	CTTTC	2	10	14925	14934	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017452	T	6	6	14960	14965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017452	TTTA	2	8	14985	14992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017452	CTTT	2	8	17478	17485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017452	T	6	6	17522	17527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017452	TAA	2	6	18263	18268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017452	TAA	2	6	18984	18989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017452	T	6	6	20041	20046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017452	GAG	2	6	20050	20055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017452	TAT	2	6	20069	20074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017452	AAT	2	6	20081	20086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017452	TATTT	2	10	20101	20110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017452	CTTT	2	8	20112	20119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017452	ATC	2	6	20132	20137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017452	A	6	6	20150	20155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017452	TAAA	2	8	20157	20164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017452	AGG	2	6	20171	20176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017452	TTA	2	6	21115	21120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017452	TTA	2	6	21146	21151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017452	A	8	8	21156	21163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017452	A	7	7	21212	21218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017452	T	7	7	21261	21267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017452	ATTT	2	8	23282	23289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017452	TCT	2	6	23302	23307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017452	T	7	7	24571	24577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017452	ATT	2	6	24592	24597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017452	AAT	2	6	24626	24631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017452	CTAAT	2	10	26118	26127	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017452	ATA	2	6	26166	26171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017452	AAG	2	6	27411	27416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017452	TTA	2	6	29819	29824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017452	ATT	2	6	29864	29869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017452	TAAA	2	8	31365	31372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017452	TTG	2	6	31400	31405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017452	TAG	2	6	31422	31427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017452	TTTA	2	8	31455	31462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017452	A	7	7	31546	31552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017452	ATCA	25	100	31584	31683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017452	ATA	2	6	31697	31702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017452	TACT	2	8	31718	31725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017452	TTA	2	6	31759	31764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017452	GT	3	6	31773	31778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017452	GAT	2	6	31813	31818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017452	AATG	2	8	31858	31865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017452	TAT	2	6	31899	31904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017452	T	6	6	31917	31922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017452	AAAC	2	8	31942	31949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017452	TAT	2	6	32019	32024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017452	TGA	2	6	32076	32081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017452	TTG	2	6	32084	32089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017452	TAA	2	6	32109	32114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017452	GTTGAT	2	12	32119	32130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017452	A	7	7	32316	32322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017452	AAC	3	9	32330	32338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017452	TAT	2	6	32413	32418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017452	TGGT	2	8	33313	33320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017452	GTT	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017452	TTA	3	9	35096	35104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017452	TCTT	2	8	35141	35148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017452	A	6	6	35211	35216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017452	ATT	2	6	35220	35225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017452	AGA	2	6	35462	35467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017452	TCT	2	6	35500	35505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017452	T	6	6	35505	35510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017452	A	7	7	35544	35550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017452	TGG	2	6	35609	35614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017452	ATAAA	2	10	37065	37074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017452	T	7	7	37093	37099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017452	AT	3	6	37109	37114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017452	TAA	2	6	37130	37135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017452	A	6	6	37134	37139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017452	TAG	2	6	37152	37157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017452	T	6	6	37205	37210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017452	TAA	2	6	38898	38903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017452	CTT	2	6	39205	39210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017452	TA	3	6	39233	39238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017452	AGG	2	6	39239	39244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017452	T	8	8	39246	39253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017452	A	6	6	39270	39275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017452	T	6	6	39305	39310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017452	TAA	2	6	39335	39340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017452	AAAATA	2	12	39684	39695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017452	TGG	2	6	39700	39705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017452	ATAA	2	8	41831	41838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017452	GAAGA	2	10	41868	41877	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017452	GTT	2	6	42482	42487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017452	T	6	6	43158	43163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017452	CAAAT	2	10	43186	43195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017452	AT	3	6	43216	43221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017452	GAT	2	6	43271	43276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017452	ATT	2	6	43953	43958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017452	GATA	2	8	44821	44828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017452	A	7	7	44843	44849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017452	T	6	6	44884	44889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017452	TCA	2	6	44903	44908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017452	T	6	6	44911	44916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017452	CTT	2	6	44917	44922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017452	TAAC	2	8	44947	44954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017452	A	7	7	46406	46412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017452	AATA	2	8	46445	46452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017452	T	7	7	46475	46481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017452	TTG	2	6	46511	46516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017452	CTAA	2	8	46542	46549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017452	AAGTAA	2	12	46588	46599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017452	T	6	6	46653	46658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017452	AAGAT	2	10	48615	48624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017452	T	6	6	48624	48629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017452	GTG	2	6	50453	50458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017452	TTTAA	2	10	50804	50813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017452	ATTTT	2	10	50826	50835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017452	TAA	2	6	50867	50872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017452	TAA	2	6	50996	51001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017452	A	6	6	52047	52052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017452	ACA	2	6	52648	52653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017452	TTC	2	6	53920	53925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017452	GGGAA	2	10	54010	54019	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017452	TTGA	2	8	54339	54346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017452	AATTTT	2	12	55223	55234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017452	TGG	2	6	56444	56449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017452	CAT	2	6	56462	56467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017452	TTC	2	6	56477	56482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017452	T	7	7	57650	57656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017452	TTA	2	6	59329	59334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017452	AAT	2	6	59381	59386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017452	ATT	2	6	59415	59420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017452	TACAA	2	10	59510	59519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_017452	TTAAC	2	10	61955	61964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017452	A	6	6	63264	63269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017452	ATT	2	6	63286	63291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017452	TTA	2	6	64169	64174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017452	T	8	8	65364	65371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017452	TA	3	6	65383	65388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_017452	GATT	2	8	65456	65463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017452	AATC	2	8	65467	65474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_017452	GTT	2	6	65553	65558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_017452	T	6	6	74165	74170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017452	TATTT	2	10	77573	77582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017452	A	6	6	77615	77620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017452	AT	3	6	77639	77644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017452	TAAA	2	8	78271	78278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017452	A	7	7	78280	78286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017452	T	7	7	78304	78310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017452	T	6	6	80317	80322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017452	A	6	6	84310	84315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_017452	A	6	6	87270	87275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_017452	TAT	2	6	111665	111670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_017452	A	7	7	111824	111830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017452	TTTTC	2	10	111920	111929	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_017452	A	7	7	113725	113731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017452	T	6	6	113752	113757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017452	TAT	2	6	115015	115020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017452	TAA	2	6	115699	115704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017452	TAA	2	6	115739	115744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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