MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 5846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017452	TGT	2	6	511456	511461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017452	T	6	6	511472	511477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017452	A	7	7	512777	512783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017452	T	6	6	512803	512808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017452	ATT	2	6	512814	512819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017452	AAT	2	6	512875	512880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017452	TTG	2	6	512902	512907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017452	TAAG	2	8	512908	512915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017452	CTT	2	6	512937	512942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017452	ATA	2	6	513123	513128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017452	TCTTT	2	10	513172	513181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1512	NC_017452	GTT	2	6	513197	513202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017452	T	6	6	513211	513216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017452	TATT	2	8	514674	514681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017452	TTG	2	6	516310	516315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017452	GTA	2	6	516316	516321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017452	A	7	7	516334	516340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017452	TA	3	6	516354	516359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017452	TTTTCA	2	12	516395	516406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1520	NC_017452	A	6	6	516429	516434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017452	AAC	2	6	518409	518414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017452	TAA	2	6	518438	518443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017452	AACA	2	8	518467	518474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_017452	CAATT	2	10	518501	518510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1525	NC_017452	AGC	2	6	518549	518554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017452	TCG	2	6	518563	518568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017452	CAAC	2	8	518610	518617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_017452	CTTTT	2	10	518651	518660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_017452	ATG	2	6	518677	518682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017452	ATC	2	6	518694	518699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017452	A	6	6	520909	520914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017452	AAAC	2	8	520926	520933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_017452	A	6	6	520939	520944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017452	T	8	8	520959	520966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017452	TTA	2	6	520988	520993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017452	ACG	2	6	521017	521022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017452	GC	3	6	521099	521104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_017452	AAC	2	6	521119	521124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017452	TGG	2	6	521131	521136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017452	ATCTT	2	10	521208	521217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_017452	AT	3	6	521327	521332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017452	TG	3	6	521342	521347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017452	TTG	2	6	521353	521358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017452	T	6	6	521379	521384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017452	TCA	2	6	521420	521425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017452	T	6	6	521430	521435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017452	AGT	2	6	521437	521442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017452	TTTA	2	8	521445	521452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017452	TTGAA	2	10	521482	521491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017452	GGC	2	6	521521	521526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017452	GCTT	2	8	521565	521572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_017452	ACG	2	6	521635	521640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017452	TAT	2	6	521663	521668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017452	TGG	2	6	521736	521741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017452	GCA	2	6	521834	521839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017452	G	6	6	521859	521864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017452	TGAA	2	8	521888	521895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017452	AGA	2	6	521976	521981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017452	CAG	2	6	522002	522007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017452	AGGG	2	8	522146	522153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017452	GGA	2	6	522193	522198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017452	CGAAGG	2	12	522203	522214	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1563	NC_017452	GGGGTT	2	12	522313	522324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017452	GAA	2	6	522454	522459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017452	AAG	2	6	522482	522487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017452	TGC	2	6	522530	522535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017452	GTC	2	6	522542	522547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_017452	TTG	2	6	522603	522608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017452	GGA	2	6	522655	522660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017452	TCA	2	6	522680	522685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017452	AC	3	6	522706	522711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_017452	GAAGC	2	10	522736	522745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1573	NC_017452	AC	3	6	522875	522880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_017452	CCT	2	6	523016	523021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_017452	GA	3	6	523032	523037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017452	CA	3	6	523049	523054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_017452	AGA	2	6	523084	523089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017452	GGT	2	6	523117	523122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017452	GGT	2	6	523152	523157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017452	CAC	2	6	523175	523180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_017452	GAGT	2	8	523186	523193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017452	GTGTA	2	10	523204	523213	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017452	TAA	2	6	523220	523225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017452	TTA	2	6	523245	523250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017452	ATG	2	6	523255	523260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017452	GCCT	2	8	523290	523297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_017452	AGG	2	6	523305	523310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017452	CCA	2	6	523335	523340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_017452	ATC	2	6	523344	523349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_017452	TAA	2	6	523376	523381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017452	TTATT	2	10	523420	523429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017452	TTTAAA	2	12	523442	523453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017452	TTTA	2	8	523470	523477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017452	GAT	2	6	523480	523485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017452	A	6	6	523514	523519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017452	GA	3	6	523550	523555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017452	AGGCA	2	10	523566	523575	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_017452	AAC	2	6	523614	523619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_017452	TTGA	2	8	523639	523646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017452	TGAA	2	8	523670	523677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017452	GAA	2	6	523793	523798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017452	GAA	2	6	523882	523887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017452	CTA	2	6	523889	523894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017452	CAA	2	6	523896	523901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_017452	TTG	2	6	523915	523920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017452	GCG	2	6	523990	523995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017452	AGCGAA	2	12	523996	524007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1608	NC_017452	GAG	2	6	524035	524040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017452	GAA	2	6	524147	524152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017452	G	6	6	524153	524158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017452	TCC	2	6	524163	524168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_017452	GTAC	2	8	524267	524274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_017452	TGA	2	6	524313	524318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017452	AGCGA	2	10	524350	524359	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_017452	ACC	2	6	524365	524370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_017452	AAG	2	6	524374	524379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017452	AGT	2	6	524499	524504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017452	GGA	2	6	524572	524577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017452	AC	3	6	524789	524794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017452	CGTC	2	8	524807	524814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_017452	AAC	2	6	524826	524831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_017452	AGC	2	6	524916	524921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017452	CAT	2	6	524922	524927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017452	AAAG	2	8	524930	524937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017452	AGTCG	2	10	524952	524961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1626	NC_017452	AAC	2	6	525043	525048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017452	GTT	2	6	525076	525081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017452	GAT	2	6	525121	525126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017452	GAA	2	6	525167	525172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017452	TAGGT	2	10	525391	525400	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017452	AG	3	6	525473	525478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017452	ATG	2	6	525479	525484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017452	GGT	2	6	525579	525584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017452	GA	3	6	525609	525614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_017452	TTA	2	6	525737	525742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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