MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 5846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017452	A	7	7	377638	377644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017452	A	6	6	377646	377651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017452	ATACC	2	10	377685	377694	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_017452	TGT	2	6	377711	377716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017452	ATC	2	6	377767	377772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017452	CCTG	2	8	377809	377816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_017452	TCATA	2	10	377861	377870	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_017452	A	6	6	377964	377969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017452	AAT	2	6	377982	377987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017452	TAC	2	6	377989	377994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017452	ATC	2	6	378019	378024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017452	ATA	2	6	378096	378101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017452	TAA	2	6	378107	378112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017452	T	6	6	378142	378147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017452	ATT	2	6	378152	378157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017452	AAT	2	6	378162	378167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017452	TGT	2	6	378213	378218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017452	ACA	2	6	378663	378668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017452	A	6	6	378668	378673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017452	CACTT	2	10	378676	378685	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_017452	TAA	2	6	381232	381237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017452	TAA	2	6	381301	381306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017452	A	6	6	381386	381391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017452	TTG	2	6	381402	381407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017452	AT	3	6	381424	381429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017452	A	6	6	381433	381438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017452	T	7	7	381456	381462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017452	TGT	2	6	381503	381508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017452	AGG	2	6	385140	385145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017452	T	6	6	386801	386806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017452	TTG	2	6	386815	386820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017452	CATT	2	8	386864	386871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_017452	GGA	2	6	386906	386911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017452	TAA	2	6	388321	388326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017452	ATG	2	6	388327	388332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017452	TAAA	2	8	388378	388385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017452	TGA	2	6	389313	389318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017452	AAAG	2	8	389320	389327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017452	T	7	7	389353	389359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017452	AAT	2	6	389392	389397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017452	AAAC	2	8	389445	389452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_017452	CTT	2	6	389550	389555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017452	T	6	6	389705	389710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017452	CAT	2	6	389757	389762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017452	GAA	2	6	389769	389774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017452	ATG	2	6	389792	389797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017452	TAC	2	6	389861	389866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017452	CTG	2	6	389902	389907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017452	AAT	2	6	389933	389938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017452	GTG	2	6	389950	389955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017452	GCC	2	6	389966	389971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017452	A	6	6	390138	390143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017452	CCA	2	6	390144	390149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017452	TAA	2	6	390205	390210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017452	TAA	2	6	390220	390225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017452	ATG	2	6	390240	390245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017452	CTG	2	6	390391	390396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017452	T	7	7	390442	390448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017452	ATA	2	6	390459	390464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017452	T	6	6	390541	390546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017452	GCA	2	6	390582	390587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017452	TTAG	2	8	390609	390616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017452	CAA	2	6	390631	390636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017452	A	6	6	390747	390752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017452	AGA	2	6	390861	390866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017452	AAT	2	6	390897	390902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017452	TAA	2	6	391054	391059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017452	TTTCT	2	10	391079	391088	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_017452	GTA	2	6	391798	391803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017452	TGT	2	6	392251	392256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017452	CTC	2	6	393682	393687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_017452	T	6	6	393723	393728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017452	TTTG	2	8	395528	395535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017452	TAAG	2	8	395540	395547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017452	ATG	2	6	395549	395554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017452	GAAA	2	8	395598	395605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017452	GAAAT	2	10	395626	395635	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017452	TTG	2	6	395637	395642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017452	T	6	6	396610	396615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017452	AAT	2	6	396686	396691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017452	TTA	2	6	401546	401551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017452	AAG	2	6	401564	401569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017452	TC	3	6	401625	401630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_017452	ATT	2	6	401636	401641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017452	T	6	6	401686	401691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017452	TAT	2	6	401720	401725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017452	ATT	2	6	401729	401734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017452	TCCT	2	8	402658	402665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_017452	TTAAG	2	10	402668	402677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017452	TATT	2	8	404419	404426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017452	T	6	6	404489	404494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017452	T	7	7	405189	405195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017452	CA	3	6	405251	405256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_017452	ACG	2	6	405257	405262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017452	TGT	2	6	405266	405271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017452	T	6	6	405276	405281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017452	CGT	2	6	405295	405300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017452	T	6	6	405303	405308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017452	TG	3	6	405335	405340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017452	TTG	2	6	405346	405351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017452	TCA	2	6	405412	405417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017452	T	6	6	405422	405427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017452	AGT	2	6	405429	405434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017452	TTTA	2	8	405438	405445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017452	TTGAA	2	10	405475	405484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017452	GGC	2	6	405514	405519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017452	GCTT	2	8	405558	405565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_017452	ACG	2	6	405628	405633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017452	TAT	2	6	405656	405661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017452	TGG	2	6	405729	405734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017452	GCA	2	6	405827	405832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017452	G	6	6	405852	405857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017452	TGAA	2	8	405881	405888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017452	AGA	2	6	405969	405974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017452	CAG	2	6	405995	406000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017452	AGGG	2	8	406139	406146	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017452	GGA	2	6	406186	406191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017452	CGAAGG	2	12	406196	406207	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1119	NC_017452	GGGGTT	2	12	406306	406317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017452	GAA	2	6	406447	406452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017452	AAG	2	6	406475	406480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017452	TGC	2	6	406523	406528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017452	GTC	2	6	406535	406540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017452	TTG	2	6	406596	406601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017452	GGA	2	6	406648	406653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017452	TCA	2	6	406673	406678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017452	AC	3	6	406699	406704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017452	GAAGC	2	10	406729	406738	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_017452	AC	3	6	406868	406873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017452	CCT	2	6	407009	407014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_017452	GA	3	6	407025	407030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017452	CA	3	6	407042	407047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_017452	CGG	2	6	407186	407191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017452	TTA	2	6	407237	407242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017452	A	6	6	407262	407267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_017452	AAAAC	2	10	407360	407369	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1416	NC_017452	A	6	6	493193	493198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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