MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 5846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017452	AT	3	6	239884	239889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017452	TA	3	6	239903	239908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017452	CAT	2	6	239925	239930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017452	TCC	2	6	241187	241192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_017452	AAAAAG	2	12	247713	247724	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017452	A	6	6	247741	247746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017452	ATTA	2	8	249110	249117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017452	GCG	2	6	249144	249149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017452	A	6	6	249150	249155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017452	TC	3	6	250205	250210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017452	AT	3	6	250833	250838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017452	GTA	2	6	250840	250845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017452	ATTC	2	8	250861	250868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_017452	T	6	6	250906	250911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017452	AAT	2	6	250927	250932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017452	ATT	2	6	250950	250955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017452	TTA	2	6	250971	250976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017452	TAT	2	6	250984	250989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017452	GGA	2	6	251008	251013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017452	CCT	2	6	251065	251070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017452	TCC	2	6	251088	251093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017452	CTAA	2	8	251112	251119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_017452	GAA	2	6	251124	251129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017452	T	7	7	251134	251140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017452	A	7	7	251737	251743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017452	TAAAT	2	10	253136	253145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017452	TACTT	2	10	253152	253161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
528	NC_017452	CCT	2	6	253201	253206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017452	TAAA	2	8	253213	253220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017452	TAT	2	6	253262	253267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017452	GAA	2	6	253280	253285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017452	ATT	2	6	253315	253320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017452	TGA	2	6	253332	253337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017452	GAC	2	6	253342	253347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017452	T	6	6	253360	253365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017452	ACT	2	6	253391	253396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017452	T	6	6	253422	253427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017452	T	6	6	253429	253434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017452	ATCT	2	8	254127	254134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_017452	AAAAT	2	10	254139	254148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017452	TTA	2	6	254167	254172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017452	T	6	6	254617	254622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017452	TAAAA	2	10	254651	254660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017452	A	6	6	254657	254662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017452	TAA	2	6	255339	255344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017452	TA	3	6	255346	255351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017452	GCAA	2	8	255374	255381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_017452	GTT	2	6	255397	255402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017452	AG	3	6	256143	256148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017452	AGA	2	6	256165	256170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017452	CAA	2	6	256727	256732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017452	ATA	2	6	256738	256743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017452	A	6	6	256748	256753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017452	TGA	2	6	256756	256761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017452	A	6	6	256770	256775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017452	TTA	2	6	256793	256798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017452	T	6	6	256810	256815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017452	GATT	2	8	256816	256823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017452	ATAA	2	8	256831	256838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017452	TC	3	6	256847	256852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_017452	CCTAG	2	10	259278	259287	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
562	NC_017452	TTAA	2	8	259298	259305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017452	TAATT	2	10	260099	260108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017452	T	6	6	260114	260119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017452	TTTTA	2	10	260718	260727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017452	T	6	6	260742	260747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017452	GAA	2	6	260756	260761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017452	A	6	6	262409	262414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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570	NC_017452	TTC	2	6	262775	262780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017452	T	6	6	262813	262818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017452	ATTA	2	8	262844	262851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017452	CAAT	2	8	262868	262875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_017452	GAAG	2	8	265861	265868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017452	TTTA	2	8	268552	268559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017452	ATGA	2	8	268561	268568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017452	ATA	2	6	270138	270143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017452	A	6	6	271100	271105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017452	ACA	2	6	271212	271217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017452	TGT	2	6	271256	271261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017452	AAAT	2	8	271344	271351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017452	CCAA	2	8	271362	271369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_017452	GAA	2	6	271415	271420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017452	A	7	7	271429	271435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017452	ATC	2	6	271476	271481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_017452	TTAAAA	2	12	271607	271618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017452	T	6	6	272234	272239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017452	T	7	7	272242	272248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017452	ACAA	2	8	272284	272291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_017452	GTC	2	6	272310	272315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017452	TAA	2	6	272329	272334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017452	ATA	2	6	276102	276107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017452	TTC	2	6	276119	276124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017452	TAA	2	6	277425	277430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017452	ATT	2	6	277437	277442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017452	TGG	2	6	277447	277452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017452	TTA	2	6	277510	277515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017452	A	6	6	277527	277532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017452	T	7	7	277542	277548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017452	TTAT	2	8	277584	277591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017452	A	6	6	278371	278376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017452	CTT	2	6	278377	278382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017452	ACCTTA	2	12	278384	278395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017452	AAC	2	6	278426	278431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017452	TGG	2	6	278672	278677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017452	TCA	2	6	278708	278713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017452	AAC	2	6	278718	278723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017452	TCA	2	6	278988	278993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017452	AAC	2	6	278998	279003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017452	TCA	2	6	279268	279273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017452	AAC	2	6	279278	279283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017452	GTC	2	6	281676	281681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017452	T	7	7	281692	281698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017452	A	7	7	281726	281732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017452	CATAA	2	10	281787	281796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
617	NC_017452	AAT	2	6	284522	284527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017452	TAA	2	6	284592	284597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017452	ATTT	2	8	284603	284610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017452	T	6	6	284608	284613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017452	AAAT	2	8	285888	285895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017452	TAT	2	6	285902	285907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017452	AT	3	6	285930	285935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017452	TGT	2	6	285975	285980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017452	TAA	2	6	287226	287231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017452	A	7	7	287291	287297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017452	T	6	6	287298	287303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017452	T	6	6	287336	287341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017452	TAT	2	6	290358	290363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017452	TAT	2	6	290395	290400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017452	AAT	2	6	290408	290413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017452	TAA	2	6	291197	291202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017452	AGT	2	6	292575	292580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017452	CAA	2	6	292617	292622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017452	TTAA	2	8	292637	292644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017452	AGA	2	6	292652	292657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017452	TAA	2	6	292669	292674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017452	A	6	6	292673	292678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017452	AAAT	2	8	292700	292707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017452	AATAA	2	10	292723	292732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017452	AAAT	2	8	292747	292754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017452	TTA	2	6	293531	293536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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