MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017451	TTAG	2	8	211938	211945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017451	A	8	8	212019	212026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017451	TAAA	2	8	212049	212056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017451	ACA	2	6	212089	212094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017451	AGT	2	6	212100	212105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017451	TAT	2	6	212108	212113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017451	AAT	2	6	212122	212127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017451	TGT	2	6	212128	212133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017451	ATT	2	6	212145	212150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017451	ATCT	2	8	212161	212168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_017451	T	6	6	212168	212173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017451	ATAA	2	8	215714	215721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017451	T	6	6	216399	216404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017451	TAA	2	6	218860	218865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017451	A	6	6	218864	218869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017451	GAAAA	2	10	218890	218899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017451	ATC	2	6	218958	218963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017451	AAG	2	6	218995	219000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017451	A	6	6	219019	219024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017451	ATA	2	6	219117	219122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017451	TA	3	6	219169	219174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017451	TAT	2	6	219180	219185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017451	T	6	6	219185	219190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017451	CA	3	6	220207	220212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017451	ACA	2	6	220257	220262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017451	T	6	6	220281	220286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017451	CA	3	6	220313	220318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_017451	T	6	6	220333	220338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017451	AAT	2	6	220345	220350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017451	T	6	6	221406	221411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017451	GAA	3	9	221414	221422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017451	A	6	6	222821	222826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017451	T	6	6	222881	222886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017451	AAT	2	6	223533	223538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017451	TAAT	2	8	223567	223574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017451	T	7	7	223618	223624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017451	A	6	6	223653	223658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017451	T	6	6	223667	223672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017451	ATGA	3	12	229893	229904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017451	AAC	2	6	229906	229911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017451	ATT	2	6	229932	229937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017451	A	6	6	229960	229965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017451	AAAAC	2	10	229996	230005	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
544	NC_017451	TGC	2	6	230025	230030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017451	A	7	7	231229	231235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017451	GGC	2	6	231238	231243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017451	T	6	6	231278	231283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017451	AAT	2	6	235530	235535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017451	TTG	2	6	238205	238210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017451	AGCA	2	8	238217	238224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017451	AAAAAG	2	12	240732	240743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017451	A	6	6	240760	240765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017451	ATTA	2	8	242093	242100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017451	GCG	2	6	242127	242132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017451	TC	3	6	243187	243192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_017451	AT	3	6	243815	243820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017451	GTA	2	6	243822	243827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017451	ATTC	2	8	243843	243850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_017451	T	6	6	243888	243893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017451	AAT	2	6	243909	243914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017451	ATT	2	6	243932	243937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017451	TTA	2	6	243953	243958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017451	TAT	2	6	243966	243971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017451	GGA	2	6	243990	243995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017451	CCT	2	6	244047	244052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017451	TCC	2	6	244070	244075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_017451	CTAA	2	8	244094	244101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017451	GAA	2	6	244106	244111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017451	T	7	7	244116	244122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017451	A	7	7	244721	244727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017451	TAAAT	2	10	246120	246129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017451	TACTT	2	10	246136	246145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
573	NC_017451	AATA	2	8	246160	246167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017451	CCT	2	6	246185	246190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_017451	TAAA	2	8	246197	246204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017451	TAT	2	6	246246	246251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017451	GAA	2	6	246264	246269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017451	ATT	2	6	246299	246304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017451	TGA	2	6	246316	246321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017451	GAC	2	6	246326	246331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017451	T	6	6	246344	246349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017451	ACT	2	6	246375	246380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017451	T	6	6	246406	246411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017451	T	6	6	246413	246418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017451	ATCT	2	8	247111	247118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017451	AAAAT	2	10	247123	247132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017451	TTA	2	6	247151	247156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017451	TAAAA	2	10	247635	247644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017451	A	6	6	247641	247646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017451	TA	3	6	248308	248313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017451	TAA	2	6	248323	248328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017451	TA	3	6	248330	248335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017451	AAG	2	6	248364	248369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017451	GTT	2	6	248381	248386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017451	AG	3	6	249127	249132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017451	AGA	2	6	249149	249154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017451	CAA	2	6	249711	249716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017451	ATA	2	6	249722	249727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017451	A	6	6	249732	249737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017451	TGA	2	6	249740	249745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017451	A	6	6	249754	249759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017451	TTA	2	6	249777	249782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017451	T	6	6	249794	249799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017451	GATT	2	8	249800	249807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017451	ATAA	2	8	249815	249822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017451	TC	3	6	249831	249836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_017451	TAATT	2	10	252932	252941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017451	T	6	6	252947	252952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017451	TTTTA	2	10	253551	253560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017451	T	6	6	253575	253580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017451	A	6	6	255242	255247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017451	T	6	6	255270	255275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017451	T	6	6	255646	255651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017451	ATTA	2	8	255677	255684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017451	CAAT	2	8	255701	255708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_017451	T	6	6	256637	256642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017451	GAAG	2	8	258694	258701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017451	ATC	2	6	258731	258736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017451	AATC	2	8	258755	258762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_017451	GT	3	6	258811	258816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017451	TTA	2	6	258830	258835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017451	TA	3	6	258870	258875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017451	A	6	6	258905	258910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017451	ATC	2	6	258961	258966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017451	TAATT	2	10	258981	258990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017451	ATT	2	6	258995	259000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017451	ATT	2	6	259021	259026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017451	GAT	2	6	259041	259046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017451	T	6	6	259066	259071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017451	A	6	6	259117	259122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017451	A	6	6	259138	259143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017451	T	7	7	259147	259153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017451	TAGA	2	8	259178	259185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017451	AT	3	6	259210	259215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017451	GAT	2	6	259249	259254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017451	TAAA	2	8	260296	260303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017451	CCA	2	6	260306	260311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_017451	TGG	2	6	260318	260323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017451	T	7	7	260328	260334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017451	TA	3	6	260785	260790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017451	AAT	2	6	260810	260815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_017451	A	6	6	260882	260887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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