MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 4739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	GGT	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017382	TAT	2	6	4173	4178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017382	A	6	6	4207	4212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017382	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017382	ATGC	2	8	4314	4321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017382	TGG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017382	GTG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017382	ACC	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017382	GGT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017382	A	7	7	4612	4618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017382	T	8	8	4632	4639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017382	AAT	2	6	4653	4658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017382	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017382	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017382	T	6	6	4864	4869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017382	A	6	6	4874	4879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017382	A	6	6	4890	4895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017382	TGT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017382	TTTTA	2	10	4948	4957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017382	C	6	6	4994	4999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_017382	AAAG	2	8	5002	5009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017382	A	9	9	5015	5023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017382	A	8	8	5032	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017382	A	6	6	7116	7121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017382	GA	9	18	7155	7172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017382	T	7	7	7182	7188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017382	TGT	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017382	A	15	15	7317	7331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017382	T	6	6	7334	7339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017382	G	6	6	7370	7375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017382	TTG	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017382	TAA	3	9	9135	9143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017382	ATAA	2	8	9526	9533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017382	ATA	3	9	9615	9623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017382	ATT	2	6	9635	9640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017382	G	6	6	9692	9697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017382	T	6	6	9713	9718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017382	ATTC	2	8	9730	9737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017382	T	6	6	12581	12586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017382	AGG	2	6	12587	12592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017382	GCTTT	2	10	13445	13454	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017382	T	6	6	13452	13457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017382	AG	3	6	13499	13504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017382	T	7	7	13514	13520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017382	ATA	2	6	13524	13529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017382	TTAA	2	8	13543	13550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017382	AGTT	2	8	16489	16496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017382	CA	3	6	16550	16555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017382	CTG	2	6	16571	16576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017382	GAT	2	6	16638	16643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017382	A	7	7	16705	16711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017382	A	6	6	18145	18150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017382	AAACAC	2	12	18185	18196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017382	ATCA	2	8	22594	22601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017382	ATTT	2	8	22638	22645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017382	GCATG	2	10	22678	22687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017382	TTTCTT	2	12	22742	22753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017382	AAAAG	2	10	22810	22819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017382	AAG	2	6	22828	22833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017382	T	6	6	24978	24983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017382	CTT	2	6	24990	24995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017382	GATT	2	8	25003	25010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017382	ATTA	2	8	25099	25106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017382	A	14	14	25124	25137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017382	GTT	2	6	25199	25204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017382	AAATC	2	10	25669	25678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017382	T	6	6	25698	25703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017382	ATT	2	6	25747	25752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017382	GCTT	2	8	25753	25760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017382	ACA	2	6	25776	25781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017382	TC	3	6	29156	29161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017382	AAATT	2	10	29868	29877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017382	T	6	6	29898	29903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017382	TCTT	2	8	29908	29915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017382	AAT	2	6	29926	29931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017382	TATT	2	8	30065	30072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017382	CAT	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017382	ATT	2	6	30097	30102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017382	ATA	2	6	30153	30158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017382	AGTTT	2	10	30162	30171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017382	AGCG	2	8	30729	30736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017382	T	6	6	30763	30768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017382	T	7	7	30822	30828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017382	TAA	2	6	40129	40134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017382	T	6	6	40167	40172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017382	AAAT	2	8	40234	40241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017382	TTC	2	6	40296	40301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017382	GTT	2	6	40311	40316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017382	T	6	6	40356	40361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017382	ATA	2	6	40368	40373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017382	TTGT	2	8	40446	40453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017382	TTCG	2	8	40506	40513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017382	A	6	6	40534	40539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017382	TAT	2	6	40544	40549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017382	A	7	7	40589	40595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017382	T	7	7	40598	40604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017382	AGA	2	6	40608	40613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017382	TGAC	2	8	40673	40680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017382	T	7	7	40684	40690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017382	TAA	2	6	40742	40747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017382	CAG	2	6	40789	40794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017382	CATG	2	8	40801	40808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017382	ATA	2	6	40818	40823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017382	ATC	2	6	40835	40840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017382	A	6	6	40876	40881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017382	CA	3	6	40885	40890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017382	GGT	2	6	43572	43577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017382	AG	3	6	43588	43593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017382	CTT	2	6	48363	48368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017382	TTA	2	6	49654	49659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017382	TTA	2	6	54196	54201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017382	CTT	2	6	54271	54276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017382	A	6	6	54342	54347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017382	AGCC	2	8	54357	54364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017382	TA	3	6	54402	54407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017382	A	6	6	54555	54560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017382	TGA	2	6	54581	54586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017382	CT	3	6	54588	54593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017382	AATTG	2	10	54632	54641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017382	AGC	2	6	54665	54670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017382	AAG	2	6	54751	54756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017382	TAA	2	6	54779	54784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017382	GAA	2	6	54804	54809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017382	GCTC	2	8	54836	54843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017382	ACC	2	6	54880	54885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017382	A	6	6	54892	54897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017382	GAG	2	6	54914	54919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017382	T	6	6	54962	54967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017382	TGA	2	6	54977	54982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017382	AGA	2	6	54986	54991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017382	TCA	2	6	55177	55182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017382	T	6	6	55298	55303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017382	AGG	2	6	55465	55470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017382	A	6	6	55476	55481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017382	CGC	2	6	55547	55552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017382	A	6	6	55608	55613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017382	ATC	2	6	55629	55634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017382	A	7	7	55741	55747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017382	A	6	6	55781	55786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017382	GGC	2	6	55806	55811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017382	A	6	6	55836	55841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017382	AAC	2	6	55971	55976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017382	CT	3	6	56015	56020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017382	A	6	6	56080	56085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017382	AAC	2	6	56165	56170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017382	A	6	6	56176	56181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017382	TAT	2	6	56187	56192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017382	AG	3	6	56277	56282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017382	AGA	2	6	56350	56355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017382	AAAG	2	8	56418	56425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017382	GAT	2	6	56496	56501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017382	TTA	2	6	56612	56617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017382	A	6	6	56760	56765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017382	A	6	6	57054	57059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017382	TA	3	6	57184	57189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017382	CAT	2	6	57210	57215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017382	AAC	2	6	57236	57241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_017382	CAT	2	6	57381	57386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_017382	C	15	15	57505	57519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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176	NC_017382	A	6	6	59306	59311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017382	TAT	2	6	59321	59326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017382	AG	3	6	59671	59676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017382	ATC	2	6	59874	59879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_017382	ACC	2	6	93667	93672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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446	NC_017382	A	6	6	130023	130028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017382	ATTT	2	8	130078	130085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017382	TTAAT	2	10	130116	130125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017382	A	7	7	130158	130164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017382	TCAT	2	8	134768	134775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
452	NC_017382	A	6	6	137978	137983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_017382	A	7	7	139277	139283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017382	A	6	6	139324	139329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017382	CATT	2	8	139351	139358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_017382	AAAG	2	8	145350	145357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017382	ATA	3	9	146490	146498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017382	AATC	2	8	146584	146591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_017382	TGA	2	6	146633	146638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017382	TAT	2	6	146657	146662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_017382	TTG	2	6	147219	147224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017382	T	6	6	147259	147264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017382	TTG	2	6	147435	147440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_017382	TAA	2	6	148360	148365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_017382	T	6	6	148482	148487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017382	ACC	2	6	148602	148607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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491	NC_017382	ATT	2	6	148983	148988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_017382	A	7	7	151937	151943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017382	TAA	2	6	151947	151952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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