MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 3645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017379	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017379	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017379	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017379	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017379	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017379	GTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017379	ACC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017379	GGT	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017379	A	7	7	4581	4587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017379	T	8	8	4601	4608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017379	AAT	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017379	A	6	6	4758	4763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017379	ATT	2	6	4792	4797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017379	T	7	7	4809	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017379	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017379	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017379	TGT	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017379	TTTTA	2	10	4899	4908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017379	TC	3	6	4944	4949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017379	C	6	6	4972	4977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_017379	A	9	9	4978	4986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017379	A	7	7	4995	5001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017379	A	6	6	5012	5017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017379	A	6	6	5041	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017379	A	6	6	6996	7001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017379	GA	9	18	7035	7052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017379	T	7	7	7062	7068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017379	TCA	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017379	TAA	3	9	9009	9017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017379	ATAA	2	8	9400	9407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017379	ATT	2	6	9509	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017379	TTA	2	6	9535	9540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017379	CAA	2	6	9577	9582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017379	T	6	6	9586	9591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017379	TATT	2	8	9599	9606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017379	ATTC	2	8	9614	9621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017379	ACA	2	6	9631	9636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017379	GAA	2	6	9649	9654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017379	GCTTT	2	10	13332	13341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017379	T	6	6	13339	13344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017379	CT	3	6	13377	13382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017379	T	7	7	13401	13407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017379	ATA	2	6	13411	13416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017379	TTAA	2	8	13430	13437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017379	AGTT	2	8	16376	16383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017379	CA	3	6	16437	16442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017379	CTG	2	6	16458	16463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017379	A	6	6	16592	16597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017379	AAACAC	2	12	18065	18076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017379	ATCA	2	8	22474	22481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017379	A	6	6	22535	22540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017379	CT	4	8	22541	22548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017379	TTAG	2	8	22678	22685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017379	CTTT	2	8	22693	22700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017379	AAG	2	6	22740	22745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017379	A	6	6	22761	22766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017379	ATGAA	2	10	24857	24866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017379	ATTA	2	8	24961	24968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017379	A	14	14	24987	25000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017379	GTT	2	6	25062	25067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017379	A	6	6	25084	25089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017379	TGT	2	6	25120	25125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017379	TTAA	2	8	25312	25319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017379	TAC	2	6	25343	25348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017379	A	6	6	26691	26696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017379	T	7	7	26704	26710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017379	T	6	6	26723	26728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017379	A	6	6	26766	26771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017379	TA	3	6	26785	26790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017379	T	6	6	28125	28130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017379	A	6	6	28157	28162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017379	CTC	2	6	29657	29662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017379	TCA	2	6	29688	29693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017379	T	6	6	29736	29741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017379	GGTT	2	8	29823	29830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017379	AGC	2	6	30256	30261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017379	TAA	2	6	38462	38467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017379	A	6	6	38472	38477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017379	AG	3	6	38482	38487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017379	TAGACT	2	12	42226	42237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017379	AG	3	6	42271	42276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017379	TAA	2	6	46555	46560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017379	T	6	6	49587	49592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017379	CT	3	6	49682	49687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017379	A	6	6	49705	49710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017379	GA	3	6	49759	49764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017379	CAT	2	6	49862	49867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017379	T	6	6	49931	49936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017379	TTA	2	6	49991	49996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017379	TC	3	6	51490	51495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017379	AAT	2	6	51581	51586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017379	AAG	2	6	51674	51679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017379	TTGA	2	8	51685	51692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017379	GTT	2	6	51700	51705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017379	T	6	6	51829	51834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017379	TTTA	2	8	57135	57142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017379	T	6	6	57206	57211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017379	TAAT	2	8	57235	57242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017379	TAA	3	9	57341	57349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017379	TTAAA	2	10	57404	57413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017379	ACAAA	2	10	57433	57442	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017379	AG	3	6	57664	57669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017379	G	7	7	57680	57686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017379	ACA	2	6	62700	62705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017379	GAT	2	6	62969	62974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017379	A	7	7	67520	67526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017379	A	7	7	67533	67539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017379	G	7	7	67540	67546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017379	TATCT	2	10	69769	69778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017379	CAAAA	2	10	70906	70915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017379	ACA	2	6	70922	70927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017379	TTG	2	6	70949	70954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017379	A	6	6	70990	70995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017379	A	8	8	71003	71010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017379	T	6	6	71019	71024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017379	A	6	6	71032	71037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017379	AG	3	6	71040	71045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017379	A	6	6	71048	71053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017379	ATT	3	9	73630	73638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017379	A	6	6	73739	73744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017379	AAT	2	6	73774	73779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017379	TTTTA	2	10	73855	73864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017379	TAGA	2	8	75719	75726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017379	TTACA	2	10	75740	75749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017379	CTT	2	6	76056	76061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017379	AAT	2	6	76069	76074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017379	TAT	2	6	76081	76086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017379	CTT	2	6	76091	76096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017379	T	6	6	76103	76108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017379	TTG	2	6	76112	76117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017379	TA	5	10	77366	77375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017379	A	6	6	77385	77390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017379	A	6	6	77418	77423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017379	T	6	6	77429	77434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017379	CT	3	6	77522	77527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017379	CATG	2	8	77541	77548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017379	A	6	6	77558	77563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017379	A	6	6	77603	77608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017379	T	7	7	77610	77616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017379	TCT	2	6	78459	78464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017379	TC	3	6	78481	78486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017379	T	6	6	78497	78502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017379	T	7	7	78504	78510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017379	GTG	2	6	78511	78516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017379	TTTGT	2	10	78517	78526	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017379	G	6	6	78533	78538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017379	AG	3	6	78555	78560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017379	T	6	6	78563	78568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017379	AAG	2	6	78577	78582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017379	T	6	6	78604	78609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017379	T	6	6	78618	78623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017379	T	6	6	78635	78640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017379	T	6	6	78690	78695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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