MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 4930

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< Previous12 3 4 5 6 7 8 9 10 Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017371	TTC	2	6	2459	2464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017371	GGT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017371	TAT	2	6	4132	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017371	A	6	6	4166	4171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017371	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017371	TGG	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017371	GTG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017371	ACC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017371	GGT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017371	T	8	8	4604	4611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017371	AAC	2	6	4684	4689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017371	TAA	2	6	4809	4814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017371	T	7	7	4835	4841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017371	A	6	6	4846	4851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017371	A	6	6	4862	4867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017371	TGT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017371	TCATT	2	10	4912	4921	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017371	GTTTT	2	10	4924	4933	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017371	C	6	6	4998	5003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_017371	AAG	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017371	TAAC	2	8	5032	5039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017371	ACTA	2	8	5052	5059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017371	ATC	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017371	T	6	6	5083	5088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017371	A	7	7	5103	5109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017371	A	9	9	5284	5292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017371	A	6	6	5316	5321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017371	A	6	6	5332	5337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017371	A	6	6	5346	5351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017371	A	8	8	5356	5363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017371	AAAG	2	8	5373	5380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017371	A	7	7	5413	5419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017371	A	6	6	5429	5434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017371	A	7	7	5461	5467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017371	T	16	16	7579	7594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017371	GTTT	2	8	7637	7644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017371	GGT	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017371	TAA	2	6	9484	9489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017371	ATAA	2	8	9877	9884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017371	TTA	2	6	9907	9912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017371	ATTATA	2	12	9971	9982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017371	ATT	2	6	9986	9991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017371	TATT	2	8	10066	10073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017371	A	6	6	10104	10109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017371	GAA	2	6	10117	10122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017371	AGG	2	6	12943	12948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017371	GCTTT	2	10	13800	13809	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017371	T	6	6	13807	13812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017371	ACC	2	6	13831	13836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017371	T	7	7	13869	13875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017371	A	6	6	16839	16844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017371	CA	3	6	16886	16891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017371	CTG	2	6	16907	16912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017371	A	7	7	17050	17056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017371	AAACAC	2	12	18529	18540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017371	T	6	6	20782	20787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017371	T	6	6	20796	20801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017371	ATCA	2	8	22973	22980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017371	T	6	6	23040	23045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017371	GGT	2	6	23048	23053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017371	TGT	2	6	23080	23085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017371	TCA	2	6	23092	23097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017371	AAAG	2	8	23151	23158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017371	TAT	2	6	23176	23181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017371	TTA	2	6	23237	23242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017371	GGT	2	6	23287	23292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017371	TTTA	2	8	23356	23363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017371	A	6	6	23370	23375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017371	T	6	6	23388	23393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017371	A	6	6	23413	23418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017371	TGG	2	6	23426	23431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017371	A	6	6	23432	23437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017371	A	6	6	23501	23506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017371	A	6	6	23520	23525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017371	A	6	6	23536	23541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017371	TTA	2	6	25663	25668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017371	GT	3	6	25704	25709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017371	A	18	18	25796	25813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017371	GTT	2	6	25875	25880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017371	A	6	6	25898	25903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017371	ATC	2	6	26183	26188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017371	TTA	2	6	26195	26200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017371	A	6	6	27547	27552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017371	TTTTA	2	10	27581	27590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017371	A	7	7	27626	27632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017371	TA	3	6	27646	27651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017371	GGTT	2	8	32100	32107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017371	TAA	2	6	40750	40755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017371	A	6	6	40760	40765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017371	AG	3	6	40770	40775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017371	TAA	2	6	42215	42220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017371	AATA	2	8	42230	42237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017371	CAAA	2	8	44413	44420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017371	ACC	2	6	44560	44565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017371	GCTT	2	8	44566	44573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017371	T	8	8	45178	45185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017371	CT	3	6	45207	45212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017371	TC	3	6	45225	45230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017371	AGACTT	2	12	45249	45260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017371	AG	3	6	45281	45286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017371	T	6	6	50861	50866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017371	TAC	2	6	50926	50931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017371	TCA	2	6	50969	50974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017371	CAT	2	6	51014	51019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017371	TTAGC	2	10	51094	51103	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017371	CAT	2	6	51139	51144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017371	T	6	6	51208	51213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017371	AAG	2	6	53204	53209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017371	TTGA	2	8	53215	53222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017371	GTT	2	6	53230	53235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017371	T	6	6	53359	53364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017371	TAC	2	6	53424	53429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017371	GATAA	2	10	53453	53462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017371	TAGC	2	8	53479	53486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017371	TTA	2	6	53498	53503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017371	TTTA	2	8	62354	62361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017371	T	6	6	62425	62430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017371	GTG	2	6	62451	62456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017371	AACGA	2	10	62606	62615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017371	TTAAA	2	10	62618	62627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017371	ACAAA	2	10	62646	62655	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017371	TTA	2	6	62879	62884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017371	A	6	6	62894	62899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017371	ATATA	2	10	62963	62972	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017371	A	6	6	63125	63130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017371	GAT	2	6	63134	63139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017371	TC	3	6	63171	63176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017371	CCA	2	6	63246	63251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017371	ACC	2	6	63284	63289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017371	GAA	2	6	63299	63304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017371	AAAG	2	8	63326	63333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017371	AAAG	2	8	63368	63375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017371	AAAG	2	8	63410	63417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017371	CTAA	2	8	63461	63468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017371	CTAA	2	8	63489	63496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017371	CTAA	2	8	63517	63524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017371	A	7	7	63527	63533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017371	TC	3	6	64049	64054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017371	AGA	2	6	64062	64067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017371	AGA	2	6	64092	64097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017371	GTT	2	6	64110	64115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017371	A	6	6	64121	64126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017371	CAAT	2	8	64166	64173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017371	A	7	7	64180	64186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017371	ACC	2	6	64239	64244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017371	GAAAAC	2	12	64266	64277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017371	ACTG	2	8	64382	64389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017371	A	7	7	64390	64396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017371	ACC	2	6	64407	64412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017371	AGCG	2	8	64477	64484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017371	CAAC	2	8	64541	64548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017371	A	7	7	64585	64591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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