MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 4930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017371	A	6	6	443424	443429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017371	T	6	6	443436	443441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017371	TCC	2	6	445024	445029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_017371	TTA	2	6	445917	445922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017371	TCAA	2	8	445951	445958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017371	A	6	6	447447	447452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017371	A	6	6	447475	447480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017371	CAAT	2	8	448354	448361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_017371	TTGTT	2	10	448394	448403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017371	TAT	2	6	448460	448465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017371	AT	3	6	448471	448476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017371	ATA	2	6	448482	448487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017371	TCGC	2	8	448547	448554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_017371	AAC	2	6	450790	450795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017371	A	7	7	452271	452277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017371	CCT	2	6	453714	453719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_017371	TAAAAA	2	12	453725	453736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017371	ATAAA	2	10	453757	453766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017371	ATTT	2	8	453770	453777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017371	TAAA	2	8	453778	453785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017371	TTA	2	6	453820	453825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017371	A	6	6	453848	453853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017371	TTA	2	6	453870	453875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017371	TTGG	2	8	453902	453909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017371	T	6	6	453926	453931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017371	TAT	2	6	453940	453945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017371	AATC	2	8	453948	453955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_017371	TGA	2	6	459221	459226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017371	ATC	2	6	461285	461290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017371	GTTT	2	8	461305	461312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017371	TA	3	6	461321	461326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017371	T	6	6	461349	461354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017371	CACC	2	8	461397	461404	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1034	NC_017371	GC	3	6	461413	461418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_017371	GTT	2	6	467512	467517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017371	TAAAAA	2	12	467527	467538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017371	TCA	2	6	469448	469453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017371	TAACA	2	10	474308	474317	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_017371	ACA	2	6	475686	475691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017371	AAT	2	6	475698	475703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017371	TAA	2	6	475707	475712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017371	TAT	2	6	475729	475734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017371	CAAACG	2	12	475758	475769	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017371	AAAC	2	8	475825	475832	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_017371	A	6	6	475844	475849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017371	T	6	6	475852	475857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017371	TTTGA	2	10	475888	475897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017371	GAA	2	6	475899	475904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017371	CTT	2	6	476493	476498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017371	T	6	6	476549	476554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017371	AAAC	2	8	476619	476626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_017371	TAAA	2	8	476693	476700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017371	A	6	6	477459	477464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017371	T	6	6	478947	478952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017371	A	6	6	478982	478987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017371	AAC	2	6	479053	479058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017371	TAT	2	6	479078	479083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017371	TAA	3	9	480516	480524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017371	T	6	6	480568	480573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017371	ATT	2	6	480599	480604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017371	AGC	2	6	481795	481800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017371	T	6	6	481875	481880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017371	GCAC	2	8	481946	481953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017371	GAA	3	9	482032	482040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017371	ACC	2	6	482050	482055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017371	TAC	2	6	482074	482079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017371	TAG	2	6	482093	482098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017371	AAC	2	6	482099	482104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017371	T	6	6	482144	482149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017371	CATG	2	8	482181	482188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_017371	T	6	6	482316	482321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017371	CT	3	6	482425	482430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_017371	T	6	6	482455	482460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017371	TTA	3	9	482503	482511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_017371	A	6	6	482666	482671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017371	CTT	3	9	482711	482719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017371	T	6	6	482718	482723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017371	CAA	2	6	482724	482729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017371	AAAAT	2	10	482768	482777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017371	ACC	2	6	482783	482788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_017371	T	6	6	482789	482794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017371	A	6	6	482814	482819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_017371	A	7	7	482885	482891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017371	A	6	6	483017	483022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_017371	T	7	7	483080	483086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_017371	A	7	7	483302	483308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017371	CCAT	2	8	487555	487562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_017371	A	6	6	487627	487632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_017371	TATT	2	8	488908	488915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017371	T	6	6	488948	488953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_017371	AAT	2	6	489014	489019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017371	AGA	2	6	489026	489031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017371	GAA	2	6	489035	489040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017371	GTTT	2	8	489041	489048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017371	TAG	2	6	489069	489074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_017371	T	6	6	489134	489139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017371	AAG	2	6	489175	489180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017371	T	6	6	489193	489198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017371	CAA	2	6	489404	489409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017371	T	6	6	489446	489451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017371	TAA	2	6	489475	489480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017371	ATA	2	6	489505	489510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017371	TAAA	2	8	489516	489523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017371	ATA	2	6	489531	489536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017371	GGT	2	6	489547	489552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017371	T	6	6	489574	489579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017371	AGCGTG	2	12	489591	489602	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1123	NC_017371	AG	3	6	489616	489621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017371	CAAC	2	8	489700	489707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_017371	T	7	7	490695	490701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017371	ATT	2	6	490751	490756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017371	AAATTT	2	12	490833	490844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017371	ATT	2	6	490905	490910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017371	T	7	7	492572	492578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017371	TTTTA	2	10	492583	492592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017371	TAT	2	6	494105	494110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017371	AGA	2	6	494180	494185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017371	AGCG	2	8	494225	494232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_017371	GA	3	6	494750	494755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017371	ACA	2	6	494815	494820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017371	TCA	2	6	498412	498417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_017371	ATTG	2	8	498464	498471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017371	A	6	6	498473	498478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_017371	TAT	2	6	498502	498507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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