MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F30

Total Repeats: 3208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017365	T	6	6	1453509	1453514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017365	ATT	2	6	1453516	1453521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017365	TTA	2	6	1453522	1453527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017365	ACC	2	6	1453560	1453565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_017365	ATA	2	6	1453578	1453583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017365	TAG	2	6	1453613	1453618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017365	TGA	2	6	1456464	1456469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017365	TTA	2	6	1459440	1459445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017365	TTA	2	6	1459458	1459463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017365	TAATA	2	10	1459464	1459473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017365	C	6	6	1459474	1459479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3012	NC_017365	TTAG	2	8	1459493	1459500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017365	AAC	2	6	1462137	1462142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017365	TATTT	2	10	1462184	1462193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017365	T	6	6	1463555	1463560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017365	TAT	2	6	1463608	1463613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017365	AAT	2	6	1463621	1463626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017365	TAA	3	9	1463628	1463636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017365	A	6	6	1463668	1463673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017365	A	6	6	1466426	1466431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017365	TTA	2	6	1466438	1466443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017365	AGTTT	2	10	1466455	1466464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017365	GC	3	6	1466503	1466508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_017365	TAA	2	6	1467686	1467691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017365	AAAT	2	8	1467739	1467746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017365	GAAA	2	8	1469055	1469062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017365	TGAG	2	8	1469080	1469087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017365	A	6	6	1469127	1469132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017365	TGGGT	2	10	1469133	1469142	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017365	CCT	2	6	1470359	1470364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3032	NC_017365	T	7	7	1470476	1470482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017365	ATT	3	9	1470921	1470929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017365	T	6	6	1470928	1470933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017365	AT	3	6	1470947	1470952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017365	AT	3	6	1472235	1472240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017365	T	6	6	1472265	1472270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017365	T	6	6	1472355	1472360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017365	CTTG	2	8	1472386	1472393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_017365	A	6	6	1472482	1472487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017365	TAT	2	6	1472510	1472515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017365	T	7	7	1472529	1472535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017365	GTT	2	6	1472554	1472559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017365	A	7	7	1472560	1472566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017365	TAAA	2	8	1476245	1476252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3047	NC_017365	TTA	2	6	1478466	1478471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017365	T	7	7	1483405	1483411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3051	NC_017365	T	6	6	1487171	1487176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017365	TTTAT	2	10	1487188	1487197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017365	T	6	6	1487199	1487204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017365	TAA	2	6	1487208	1487213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_017365	GGT	2	6	1487275	1487280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_017365	TAA	2	6	1488787	1488792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017365	TAA	3	9	1488830	1488838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017365	AGT	2	6	1488847	1488852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3063	NC_017365	CG	3	6	1488897	1488902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_017365	A	7	7	1488927	1488933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017365	TGAA	2	8	1488935	1488942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017365	TTA	2	6	1490337	1490342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017365	TGAA	2	8	1490359	1490366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017365	TGAA	2	8	1490381	1490388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017365	TGAA	2	8	1490392	1490399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017365	ATA	2	6	1490450	1490455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_017365	A	6	6	1493751	1493756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017365	T	6	6	1493777	1493782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_017365	ATT	2	6	1493998	1494003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_017365	T	6	6	1500374	1500379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017365	CAT	2	6	1500901	1500906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_017365	TAA	2	6	1503575	1503580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017365	A	8	8	1503585	1503592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017365	TAA	2	6	1503595	1503600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017365	T	14	14	1503628	1503641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_017365	A	16	16	1506321	1506336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017365	A	6	6	1508899	1508904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017365	TA	3	6	1508934	1508939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3105	NC_017365	T	7	7	1508996	1509002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017365	AGG	2	6	1512793	1512798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_017365	A	6	6	1513242	1513247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017365	A	6	6	1513265	1513270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017365	GTGTT	2	10	1513298	1513307	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017365	G	6	6	1513312	1513317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017365	TTTTA	2	10	1513458	1513467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017365	AATCA	2	10	1515362	1515371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3114	NC_017365	A	7	7	1518109	1518115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017365	AG	3	6	1518119	1518124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_017365	A	6	6	1518210	1518215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017365	T	6	6	1518272	1518277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017365	TTGA	2	8	1520636	1520643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017365	AGTT	2	8	1520651	1520658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017365	A	6	6	1520681	1520686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3125	NC_017365	T	6	6	1522733	1522738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3129	NC_017365	AG	3	6	1539591	1539596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017365	TGT	2	6	1539599	1539604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017365	T	6	6	1539659	1539664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017365	A	7	7	1542279	1542285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017365	TGG	2	6	1542319	1542324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.