MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 4416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	T	7	7	2412	2418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017362	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017362	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017362	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017362	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017362	TGG	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017362	GTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017362	ACC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017362	GGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017362	T	8	8	4596	4603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017362	AAT	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017362	GAAAC	2	10	4646	4655	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017362	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017362	A	6	6	4771	4776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017362	T	7	7	4823	4829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017362	A	6	6	4834	4839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017362	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017362	GTTTT	2	10	4860	4869	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017362	TGT	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017362	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017362	A	6	6	4974	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017362	A	9	9	4988	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017362	A	6	6	5007	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017362	A	6	6	5023	5028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017362	T	7	7	7294	7300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017362	A	6	6	7317	7322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017362	GA	15	30	7356	7385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017362	T	7	7	7395	7401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017362	TAAG	2	8	7451	7458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017362	GTTTTT	2	12	7489	7500	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017362	T	8	8	7496	7503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017362	T	6	6	7535	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017362	TTTG	2	8	7546	7553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017362	GGT	2	6	7554	7559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017362	GTT	2	6	7565	7570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017362	T	6	6	7616	7621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017362	C	7	7	7660	7666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_017362	A	6	6	7667	7672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017362	G	6	6	7686	7691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017362	TAA	3	9	9393	9401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017362	ATAA	2	8	9785	9792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017362	TTA	2	6	9815	9820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017362	ACTATA	2	12	9879	9890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017362	ATT	2	6	9894	9899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017362	TA	3	6	9909	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017362	A	6	6	9947	9952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017362	TTA	2	6	9959	9964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017362	TATT	2	8	9985	9992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017362	A	6	6	10023	10028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017362	GAA	2	6	10037	10042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017362	AGG	2	6	12859	12864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017362	GCTTT	2	10	13718	13727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017362	T	6	6	13725	13730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017362	T	7	7	13787	13793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017362	ATA	2	6	13797	13802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017362	TTAA	2	8	13816	13823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017362	CA	3	6	16804	16809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017362	CTG	2	6	16825	16830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017362	A	7	7	16959	16965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017362	A	6	6	18399	18404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017362	AAACAC	2	12	18439	18450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017362	ATCA	2	8	22860	22867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017362	T	6	6	22928	22933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017362	GGT	2	6	22937	22942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017362	T	6	6	23204	23209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017362	GC	3	6	23220	23225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017362	CTTG	2	8	23250	23257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017362	GGT	2	6	23258	23263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017362	TTTA	2	8	23293	23300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017362	A	6	6	23307	23312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017362	T	6	6	23325	23330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017362	A	6	6	23350	23355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017362	TTTG	2	8	23357	23364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017362	A	6	6	23369	23374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017362	A	6	6	23377	23382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017362	A	6	6	23437	23442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017362	CCATG	2	10	23599	23608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017362	GC	3	6	23611	23616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017362	CTCTT	2	10	23629	23638	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017362	ATT	2	6	23717	23722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017362	TGA	2	6	23830	23835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017362	TAT	2	6	23905	23910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017362	CCA	2	6	23951	23956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017362	TGG	2	6	24022	24027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017362	GCG	2	6	24033	24038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017362	GTA	2	6	24119	24124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017362	CAC	2	6	24170	24175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017362	AG	3	6	24206	24211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017362	GCT	2	6	24213	24218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017362	CG	3	6	24291	24296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017362	T	6	6	24339	24344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017362	TC	3	6	24358	24363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017362	CAC	2	6	24506	24511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017362	GGC	2	6	24638	24643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017362	AT	3	6	24749	24754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017362	ACT	2	6	24773	24778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017362	CAC	2	6	24781	24786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017362	CAC	2	6	24790	24795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017362	ATT	2	6	24797	24802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017362	T	6	6	24873	24878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017362	TCT	2	6	24888	24893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017362	ATT	3	9	24896	24904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017362	T	7	7	24912	24918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017362	GCT	2	6	24976	24981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017362	GAT	2	6	24997	25002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017362	ATA	2	6	25043	25048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017362	TAG	2	6	25071	25076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017362	TCCC	2	8	25095	25102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_017362	GT	3	6	25116	25121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017362	TGC	2	6	25149	25154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017362	CTG	2	6	25209	25214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017362	TTC	2	6	25277	25282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017362	CGG	2	6	25329	25334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017362	TAA	2	6	25341	25346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017362	A	6	6	25492	25497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017362	T	6	6	25558	25563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017362	TTA	2	6	25581	25586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017362	GATT	2	8	25597	25604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017362	GT	3	6	25626	25631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017362	TAAG	2	8	25635	25642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017362	ATTA	2	8	25693	25700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017362	A	15	15	25718	25732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017362	TGT	2	6	25864	25869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017362	T	6	6	25878	25883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017362	A	6	6	25886	25891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017362	TCGC	2	8	26036	26043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017362	A	6	6	27462	27467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017362	T	6	6	27497	27502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017362	A	6	6	27540	27545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017362	TA	3	6	27559	27564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017362	T	6	6	28900	28905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017362	A	6	6	28927	28932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017362	GGTT	2	8	32021	32028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017362	TGA	2	6	36627	36632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017362	TTCT	2	8	36654	36661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017362	TTC	2	6	36803	36808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017362	GC	3	6	36816	36821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017362	TTA	2	6	36833	36838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017362	T	6	6	36848	36853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017362	A	6	6	36874	36879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017362	CTTT	2	8	36983	36990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017362	TG	3	6	37060	37065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017362	T	7	7	37068	37074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017362	T	8	8	37092	37099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017362	TTTG	2	8	37106	37113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017362	TG	3	6	37145	37150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017362	GGA	2	6	37198	37203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017362	A	7	7	37223	37229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017362	T	6	6	37256	37261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017362	GTT	2	6	37262	37267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017362	TGG	2	6	37348	37353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017362	T	6	6	37394	37399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017362	CCA	2	6	37453	37458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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448	NC_017362	A	6	6	109098	109103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017362	TGA	2	6	109144	109149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017362	AAGC	2	8	109159	109166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
451	NC_017362	CCGC	2	8	109182	109189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
452	NC_017362	AAG	2	6	109194	109199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017362	CTTT	2	8	111083	111090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_017362	AAAT	2	8	111093	111100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017362	TGA	2	6	112514	112519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017362	TAA	2	6	112549	112554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017362	ATTT	2	8	112625	112632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017362	T	6	6	112651	112656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017362	AATT	2	8	112661	112668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_017362	A	7	7	112705	112711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017362	A	6	6	115596	115601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017362	GT	3	6	117217	117222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017362	TCAT	2	8	117299	117306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
464	NC_017362	TTA	2	6	120516	120521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017362	A	6	6	120539	120544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017362	A	6	6	121701	121706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017362	GTA	2	6	121735	121740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017362	TA	4	8	121739	121746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017362	CCAAT	2	10	121794	121803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
470	NC_017362	AAT	3	9	121880	121888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017362	AGA	2	6	121929	121934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017362	T	9	9	123230	123238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017362	A	6	6	123240	123245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017362	ATA	2	6	125805	125810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017362	TAA	2	6	125863	125868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_017362	TAA	2	6	125902	125907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_017362	GGT	2	6	125938	125943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017362	A	6	6	126085	126090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_017362	GAA	2	6	126117	126122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017362	AAAG	2	8	128845	128852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017362	GTTTTA	2	12	129229	129240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017362	A	7	7	129245	129251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017362	AAAG	2	8	129341	129348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017362	TAG	2	6	129357	129362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
485	NC_017362	GAAG	2	8	129398	129405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017362	ATT	2	6	130468	130473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017362	AAT	2	6	130480	130485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017362	AATC	2	8	130575	130582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
489	NC_017362	GAT	2	6	130584	130589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
490	NC_017362	ATTT	2	8	130593	130600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017362	T	6	6	130598	130603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_017362	T	7	7	131075	131081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_017362	CTTG	2	8	131191	131198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_017362	GTGG	2	8	131199	131206	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
495	NC_017362	TTG	2	6	131210	131215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
496	NC_017362	T	6	6	131251	131256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_017362	T	6	6	131284	131289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017362	AAT	2	6	131312	131317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_017362	GGT	2	6	131371	131376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017362	T	6	6	131376	131381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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