MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 4101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017360	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017360	AAAGA	2	10	70	79	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017360	ATT	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017360	TATCG	2	10	112	121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017360	TGAA	2	8	131	138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017360	CTT	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017360	C	7	7	1226	1232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_017360	TAA	2	6	1799	1804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017360	T	6	6	1820	1825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017360	GTTTTA	2	12	12399	12410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017360	CCA	2	6	12427	12432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017360	TTTTA	2	10	13115	13124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017360	TAAAAA	2	12	13225	13236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017360	TTGA	2	8	13272	13279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017360	ATG	2	6	13608	13613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017360	TAAT	2	8	13679	13686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017360	GGAA	2	8	13694	13701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017360	C	6	6	13766	13771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_017360	A	6	6	13777	13782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017360	ATT	2	6	17938	17943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017360	T	6	6	17952	17957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017360	AAG	2	6	18783	18788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017360	CTC	2	6	18800	18805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017360	CTT	2	6	18851	18856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017360	TAT	2	6	18857	18862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017360	T	6	6	18866	18871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017360	ACA	2	6	18896	18901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017360	TAA	2	6	18955	18960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017360	CTTT	2	8	19294	19301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017360	TAG	2	6	19307	19312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017360	T	6	6	19400	19405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017360	AAAG	2	8	19575	19582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017360	TTGG	2	8	19597	19604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017360	TAT	2	6	19605	19610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017360	AT	3	6	19609	19614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017360	A	6	6	19833	19838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017360	GCTT	2	8	19843	19850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017360	ATT	2	6	19861	19866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017360	TAT	2	6	24127	24132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017360	AG	4	8	25214	25221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017360	ATG	2	6	25235	25240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017360	AT	3	6	25263	25268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017360	CAA	2	6	25316	25321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017360	TCAA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017360	TGA	2	6	26374	26379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017360	TTA	2	6	26382	26387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017360	AGT	2	6	26404	26409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017360	T	7	7	26409	26415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017360	TTA	2	6	26530	26535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017360	AG	3	6	26537	26542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017360	ATC	2	6	26647	26652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017360	AAAT	2	8	26660	26667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017360	TTTGAG	2	12	26673	26684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017360	T	6	6	26978	26983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017360	TAA	2	6	26991	26996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017360	A	6	6	27000	27005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017360	TTA	2	6	27011	27016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017360	AAG	2	6	27083	27088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017360	TAAA	2	8	27089	27096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017360	AAGA	2	8	27097	27104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017360	CAA	2	6	27130	27135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017360	AGG	2	6	27202	27207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017360	TG	4	8	27263	27270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017360	GA	3	6	27439	27444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017360	GT	3	6	27506	27511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017360	ATG	2	6	27531	27536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017360	CGT	2	6	27543	27548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017360	TCC	3	9	27557	27565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017360	CACGA	2	10	27657	27666	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017360	GAC	2	6	27670	27675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017360	GCA	2	6	27682	27687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017360	CA	3	6	27738	27743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017360	TTC	2	6	27763	27768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017360	GA	3	6	27891	27896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017360	CAA	2	6	27907	27912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017360	CATC	2	8	27917	27924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017360	CAG	2	6	28002	28007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017360	ACCT	2	8	28071	28078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017360	TAG	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017360	CTGA	2	8	28142	28149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017360	GCT	2	6	28218	28223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017360	TCT	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017360	TCC	2	6	28307	28312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017360	TGC	2	6	28322	28327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017360	CTG	2	6	28361	28366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017360	GT	3	6	28402	28407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017360	TTACC	2	10	28455	28464	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017360	ATC	2	6	28535	28540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017360	CGC	2	6	28661	28666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017360	CT	3	6	28721	28726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017360	T	6	6	28729	28734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017360	TAA	2	6	28754	28759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017360	ACA	3	9	28829	28837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017360	AGAA	2	8	28842	28849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017360	ATCA	2	8	28908	28915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017360	CAAT	2	8	28923	28930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017360	AAAGA	2	10	28968	28977	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017360	AAT	2	6	29023	29028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017360	ACCA	2	8	33042	33049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017360	CA	3	6	33048	33053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017360	AC	3	6	33054	33059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017360	T	6	6	37785	37790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017360	ATT	2	6	37817	37822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017360	AT	3	6	37876	37881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017360	A	6	6	37915	37920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017360	TAAGC	2	10	40226	40235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017360	A	6	6	40401	40406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017360	AGAC	2	8	40428	40435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017360	AAT	2	6	40479	40484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017360	GAT	2	6	40523	40528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017360	CAT	2	6	40622	40627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017360	CAAG	2	8	40825	40832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017360	AC	3	6	43370	43375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017360	T	8	8	43409	43416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017360	TTAA	2	8	43490	43497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017360	T	6	6	43504	43509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017360	AACA	2	8	43510	43517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017360	A	6	6	43536	43541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017360	AAAG	2	8	43556	43563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017360	A	7	7	43596	43602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017360	A	6	6	43609	43614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017360	AAC	2	6	43635	43640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017360	T	6	6	43985	43990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017360	TACC	2	8	48467	48474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017360	A	6	6	48482	48487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017360	ATT	2	6	48514	48519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017360	TGG	2	6	48526	48531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017360	TAA	2	6	48535	48540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017360	TAT	2	6	48550	48555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017360	CAA	2	6	49703	49708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017360	A	6	6	49710	49715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017360	TCC	2	6	50409	50414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017360	AT	3	6	53825	53830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017360	TC	3	6	53831	53836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017360	ATT	2	6	53942	53947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017360	ATGG	2	8	55690	55697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017360	T	6	6	56491	56496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017360	TATAT	2	10	56508	56517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017360	ATA	3	9	56552	56560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017360	T	6	6	56563	56568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017360	A	6	6	56582	56587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017360	TCAA	2	8	59283	59290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017360	CTT	2	6	59364	59369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017360	CTT	2	6	59379	59384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017360	GCT	2	6	59404	59409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017360	GTTT	2	8	59432	59439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017360	ATGAA	2	10	59465	59474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017360	T	6	6	59529	59534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017360	TAA	2	6	59575	59580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017360	ATTTT	2	10	59636	59645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017360	CAATTT	2	12	59646	59657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_017360	A	6	6	59711	59716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017360	TGG	2	6	59749	59754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017360	TTA	2	6	59858	59863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017360	T	6	6	59874	59879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017360	CAAA	2	8	59886	59893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_017360	C	9	9	59939	59947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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164	NC_017360	TAC	2	6	60335	60340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017360	ATT	2	6	60350	60355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017360	CAA	2	6	60391	60396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017360	ATT	2	6	60401	60406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017360	AAT	2	6	60423	60428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017360	T	6	6	60455	60460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017360	TAA	2	6	60464	60469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017360	T	6	6	60478	60483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_017360	T	6	6	60575	60580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017360	AATC	2	8	60583	60590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_017360	T	6	6	61325	61330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017360	TCT	2	6	61369	61374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_017360	ATT	2	6	90094	90099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_017360	TAA	3	9	100204	100212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_017360	TTA	2	6	103014	103019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_017360	TAA	2	6	118413	118418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017360	AGA	2	6	118457	118462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017360	GGT	2	6	118480	118485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017360	TAA	2	6	120029	120034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017360	CG	3	6	120097	120102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
281	NC_017360	A	7	7	120127	120133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017360	TGAA	2	8	120135	120142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017360	TTA	2	6	121537	121542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017360	TGAA	2	8	121559	121566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017360	TGAA	2	8	121581	121588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017360	TGAA	2	8	121592	121599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017360	ATA	2	6	121650	121655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017360	A	6	6	121670	121675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017360	TAA	2	6	124967	124972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017360	TGT	2	6	125039	125044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017360	TCA	2	6	125051	125056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017360	T	6	6	125161	125166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017360	TATAA	2	10	129746	129755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017360	CAT	2	6	133475	133480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017360	TCA	2	6	133516	133521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_017360	TAA	2	6	133527	133532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017360	T	7	7	133541	133547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017360	ATA	2	6	133639	133644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017360	TTG	2	6	133661	133666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017360	A	6	6	133707	133712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_017360	GTT	2	6	133819	133824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_017360	AC	3	6	140434	140439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
362	NC_017360	TTA	2	6	140520	140525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_017360	TGA	2	6	142176	142181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_017360	TGTCTT	2	12	156643	156654	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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427	NC_017360	A	6	6	156730	156735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017360	TAA	2	6	156749	156754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_017360	GAA	2	6	170075	170080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017360	AAAG	2	8	170090	170097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017360	ATT	2	6	173561	173566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017360	AG	3	6	173568	173573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_017360	T	7	7	173636	173642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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