MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 3765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017358	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017358	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017358	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017358	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017358	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017358	GTG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017358	ACC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017358	GGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017358	ACG	2	6	4490	4495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017358	A	7	7	4580	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017358	T	8	8	4600	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017358	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017358	GAAAC	2	10	4650	4659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017358	TAAA	2	8	4690	4697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017358	CA	3	6	4908	4913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017358	G	6	6	4969	4974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017358	TAC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017358	A	6	6	5045	5050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017358	A	7	7	5116	5122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017358	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017358	TAAAA	2	10	5252	5261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017358	ATAAA	2	10	5271	5280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017358	T	6	6	5282	5287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017358	TTA	2	6	5328	5333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017358	CAAA	2	8	5391	5398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017358	TCA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017358	ATA	2	6	7095	7100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017358	ATAA	2	8	7484	7491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017358	TAA	2	6	7574	7579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017358	ATT	2	6	7593	7598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017358	CAA	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017358	T	6	6	7670	7675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017358	ATTC	2	8	7687	7694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017358	ACA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017358	GAA	2	6	7722	7727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017358	T	6	6	10474	10479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017358	A	6	6	10514	10519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017358	T	6	6	10541	10546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017358	AGG	2	6	10547	10552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017358	GCTTT	2	10	11405	11414	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017358	T	6	6	11412	11417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017358	T	7	7	11474	11480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017358	ATA	2	6	11484	11489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017358	TTAA	2	8	11503	11510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017358	AGTT	2	8	14451	14458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017358	CA	3	6	14512	14517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017358	CTG	2	6	14533	14538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017358	A	6	6	14668	14673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017358	C	6	6	16112	16117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_017358	AAACAC	2	12	16142	16153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017358	ATCA	2	8	20551	20558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017358	CTCC	2	8	20618	20625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017358	CTT	2	6	22962	22967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017358	GTAT	2	8	22997	23004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017358	ATACC	2	10	23012	23021	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017358	ATTA	2	8	23064	23071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017358	A	13	13	23089	23101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017358	GTT	2	6	23163	23168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017358	TGT	2	6	23219	23224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017358	TGT	2	6	23230	23235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017358	CTT	2	6	23244	23249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017358	AG	3	6	23261	23266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017358	T	6	6	23281	23286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017358	ATC	2	6	23347	23352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017358	TGG	2	6	23360	23365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017358	A	6	6	24789	24794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017358	T	6	6	24824	24829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017358	A	6	6	24867	24872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017358	TA	3	6	24886	24891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017358	T	6	6	26226	26231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017358	A	6	6	26258	26263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017358	TCA	2	6	27807	27812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017358	T	6	6	27855	27860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017358	GGTT	2	8	27943	27950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017358	T	8	8	33615	33622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017358	TTA	2	6	33624	33629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017358	A	7	7	33674	33680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017358	TAA	2	6	36583	36588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017358	A	6	6	36593	36598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017358	AG	3	6	36603	36608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017358	ATT	2	6	40201	40206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017358	GC	3	6	40247	40252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017358	T	6	6	40268	40273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017358	ATC	2	6	40274	40279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017358	T	7	7	40288	40294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017358	TAGACT	2	12	40353	40364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017358	AG	3	6	40391	40396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017358	T	6	6	47710	47715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017358	CT	3	6	47805	47810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017358	A	6	6	47828	47833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017358	TGA	2	6	47844	47849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017358	GA	3	6	47885	47890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017358	T	6	6	48057	48062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017358	AAG	2	6	50054	50059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017358	TTGA	2	8	50065	50072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017358	GTT	2	6	50080	50085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017358	T	6	6	50209	50214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017358	TTTA	2	8	55514	55521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017358	GCGG	2	8	55552	55559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017358	T	6	6	55585	55590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017358	TAAT	2	8	55614	55621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017358	TTGT	2	8	55692	55699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017358	TAA	3	9	55720	55728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017358	TTAAA	2	10	55783	55792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017358	A	6	6	55802	55807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017358	ACAAA	2	10	55812	55821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017358	G	7	7	56073	56079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017358	GTG	2	6	56175	56180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017358	A	7	7	56208	56214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017358	C	7	7	56244	56250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_017358	AAT	2	6	56256	56261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017358	GAA	2	6	56262	56267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017358	AAT	2	6	56274	56279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017358	A	6	6	56322	56327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017358	AGA	2	6	56330	56335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017358	TC	3	6	56368	56373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017358	TCT	2	6	56400	56405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017358	A	8	8	56437	56444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017358	GAA	2	6	56445	56450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017358	AGA	2	6	56468	56473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017358	CAA	2	6	56477	56482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017358	AGA	2	6	56489	56494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017358	GATC	2	8	56549	56556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017358	CAT	2	6	56588	56593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017358	CTT	2	6	56659	56664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017358	ATG	2	6	56665	56670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017358	A	6	6	56737	56742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017358	TAA	2	6	56786	56791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017358	A	6	6	56833	56838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017358	AGC	2	6	56872	56877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017358	GAAAAA	2	12	56904	56915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017358	GAA	2	6	56951	56956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017358	TCA	2	6	57046	57051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017358	AGA	2	6	57199	57204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017358	TTA	3	9	57206	57214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017358	TACT	2	8	57236	57243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017358	TTG	2	6	58036	58041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017358	GAT	2	6	58051	58056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017358	AG	3	6	58089	58094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017358	CGC	2	6	58172	58177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017358	TTGC	2	8	58263	58270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017358	C	6	6	58287	58292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_017358	GC	3	6	58364	58369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017358	TTTA	2	8	58462	58469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017358	AGA	2	6	58503	58508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017358	CAA	2	6	58549	58554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017358	T	7	7	58625	58631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017358	TAT	2	6	58666	58671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017358	A	6	6	58676	58681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017358	TAA	2	6	58740	58745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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