MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 4116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	GGT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017355	TAT	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017355	TGG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017355	ATGC	2	8	4272	4279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017355	TGG	2	6	4288	4293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017355	GTG	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017355	ACC	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017355	GGT	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017355	A	7	7	4570	4576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017355	T	8	8	4590	4597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017355	ATT	2	6	4803	4808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017355	T	8	8	4821	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017355	A	6	6	4833	4838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017355	A	7	7	4849	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017355	TGT	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017355	TTTTA	2	10	4913	4922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017355	TC	3	6	4958	4963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017355	A	8	8	4991	4998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017355	A	8	8	5007	5014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017355	A	6	6	5025	5030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017355	A	6	6	7016	7021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017355	GA	6	12	7055	7066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017355	T	7	7	7076	7082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017355	TGT	2	6	7204	7209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017355	A	8	8	7213	7220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017355	T	6	6	7222	7227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017355	G	6	6	7258	7263	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017355	TGT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017355	TAA	3	9	9022	9030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017355	ATAA	2	8	9413	9420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017355	TAA	2	6	9503	9508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017355	ATT	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017355	T	6	6	9599	9604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017355	ATTC	2	8	9616	9623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017355	GAA	2	6	9651	9656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017355	GCTTT	2	10	13334	13343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017355	T	6	6	13341	13346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017355	AC	3	6	13364	13369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017355	T	7	7	13403	13409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017355	ATA	2	6	13413	13418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017355	TTAA	2	8	13432	13439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017355	AGTT	2	8	16380	16387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017355	CA	3	6	16441	16446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017355	CTG	2	6	16462	16467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017355	A	6	6	16596	16601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017355	A	6	6	18035	18040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017355	AAACAC	2	12	18070	18081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017355	AC	3	6	22465	22470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017355	ATCA	2	8	22479	22486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017355	TTTCTT	2	12	22678	22689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017355	A	6	6	22728	22733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017355	AAG	2	6	22748	22753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017355	CTT	2	6	24887	24892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017355	GTAT	2	8	24922	24929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017355	ATACC	2	10	24937	24946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017355	ATTA	2	8	24989	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017355	A	14	14	25014	25027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017355	GTT	2	6	25089	25094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017355	A	6	6	25112	25117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017355	T	6	6	25137	25142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017355	TGT	2	6	25147	25152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017355	TAC	2	6	25365	25370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017355	A	6	6	26714	26719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017355	T	6	6	26749	26754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017355	A	7	7	26792	26798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017355	TA	3	6	26812	26817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017355	T	6	6	28152	28157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017355	A	7	7	28184	28190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017355	T	6	6	29758	29763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017355	GGTT	2	8	29845	29852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017355	TAA	2	6	38486	38491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017355	A	6	6	38496	38501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017355	AG	3	6	38506	38511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017355	ATT	2	6	42100	42105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017355	T	6	6	42167	42172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017355	ATC	2	6	42173	42178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017355	T	6	6	42187	42192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017355	CCA	2	6	42200	42205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017355	CTATT	2	10	42212	42221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017355	GATT	2	8	42239	42246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017355	TA	3	6	48032	48037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017355	A	6	6	48048	48053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017355	TTA	2	6	48087	48092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017355	TGA	2	6	48154	48159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017355	TTAA	2	8	48168	48175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017355	TTTA	2	8	53296	53303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017355	T	6	6	53367	53372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017355	TAAT	2	8	53396	53403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017355	TTGT	2	8	53475	53482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017355	AACGA	2	10	53552	53561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017355	TTAAA	2	10	53564	53573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017355	ACAAA	2	10	53593	53602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017355	AGG	2	6	53845	53850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017355	TAAGA	2	10	53912	53921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017355	GTG	2	6	53938	53943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017355	A	7	7	53971	53977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017355	C	7	7	54013	54019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_017355	AAT	2	6	54020	54025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017355	AAT	2	6	54038	54043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017355	A	6	6	54077	54082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017355	AGA	2	6	54085	54090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017355	AGA	2	6	54097	54102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017355	TC	3	6	54123	54128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017355	T	6	6	54143	54148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017355	A	6	6	54149	54154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017355	CAAG	2	8	56227	56234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017355	TTC	2	6	56244	56249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017355	AAT	2	6	56261	56266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017355	CTT	2	6	56271	56276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017355	TGA	2	6	56290	56295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017355	A	6	6	56355	56360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017355	GATGTG	2	12	56384	56395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017355	ATA	2	6	56433	56438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017355	AAAG	2	8	56525	56532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017355	AGA	2	6	56593	56598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017355	TGCT	2	8	56711	56718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017355	CT	3	6	56717	56722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017355	TAG	2	6	56775	56780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017355	T	7	7	56918	56924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017355	CAA	2	6	57064	57069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017355	TATCC	2	10	57102	57111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017355	A	6	6	57138	57143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017355	AG	4	8	57146	57153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017355	A	6	6	57204	57209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017355	AGCG	2	8	57238	57245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017355	TTA	2	6	57319	57324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017355	GAC	2	6	57349	57354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017355	A	6	6	57377	57382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017355	TTG	2	6	57466	57471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017355	GAAA	2	8	57507	57514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017355	T	6	6	57636	57641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017355	AGA	2	6	57675	57680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017355	AGAT	2	8	57800	57807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017355	CTT	2	6	57822	57827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017355	AGG	2	6	57894	57899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017355	GAT	2	6	57988	57993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017355	CATT	2	8	57998	58005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017355	G	6	6	58082	58087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017355	AG	3	6	58133	58138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017355	AAG	2	6	58216	58221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017355	CCAACA	2	12	58345	58356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017355	AGA	2	6	58396	58401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017355	GAA	2	6	58406	58411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017355	TGC	2	6	58427	58432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017355	GAC	2	6	58469	58474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017355	ACA	2	6	59079	59084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017355	AGA	2	6	59379	59384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017355	CAAA	2	8	59388	59395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017355	AAG	2	6	59432	59437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017355	CG	3	6	59475	59480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017355	A	7	7	59953	59959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017355	TGA	2	6	59967	59972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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