MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 4068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017354	TAG	3	9	1356249	1356257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017354	CAG	2	6	1356367	1356372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017354	GT	3	6	1356384	1356389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017354	AAC	2	6	1356415	1356420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017354	CTC	2	6	1356471	1356476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_017354	ACG	2	6	1356518	1356523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017354	CA	3	6	1356705	1356710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_017354	ACC	2	6	1356713	1356718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_017354	GGCT	2	8	1356771	1356778	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_017354	AGG	2	6	1356849	1356854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017354	CCA	2	6	1356876	1356881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_017354	CCTG	2	8	1356890	1356897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_017354	GGT	2	6	1356936	1356941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017354	GTA	2	6	1357033	1357038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017354	AGG	2	6	1357073	1357078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017354	GCC	2	6	1357206	1357211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_017354	TTCAA	2	10	1357224	1357233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3518	NC_017354	GGGA	2	8	1357345	1357352	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017354	CTCAT	2	10	1357454	1357463	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3520	NC_017354	GAC	2	6	1357488	1357493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_017354	ACG	2	6	1357523	1357528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017354	AGCT	2	8	1357643	1357650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_017354	C	6	6	1357668	1357673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3524	NC_017354	GAC	2	6	1357765	1357770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017354	CGG	2	6	1357796	1357801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_017354	AT	3	6	1357813	1357818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017354	CTTT	2	8	1358000	1358007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_017354	GCT	2	6	1358016	1358021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_017354	CCT	2	6	1358032	1358037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_017354	GTT	2	6	1358039	1358044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017354	CA	3	6	1358053	1358058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_017354	GTT	2	6	1358107	1358112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017354	GATT	2	8	1358124	1358131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017354	CACC	2	8	1358136	1358143	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3535	NC_017354	AGC	2	6	1358205	1358210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017354	TAT	2	6	1358240	1358245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017354	AT	3	6	1358265	1358270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017354	GTTT	2	8	1358296	1358303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017354	TCC	2	6	1358361	1358366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_017354	GCA	2	6	1358424	1358429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017354	AGT	2	6	1358659	1358664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017354	TCGC	2	8	1358874	1358881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_017354	ACT	2	6	1358883	1358888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017354	TCACT	2	10	1358933	1358942	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3545	NC_017354	CT	3	6	1358950	1358955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_017354	CT	3	6	1359070	1359075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_017354	TTC	2	6	1359178	1359183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_017354	TACTT	2	10	1359231	1359240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3549	NC_017354	AGA	2	6	1359329	1359334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017354	T	6	6	1359358	1359363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017354	CTT	2	6	1359407	1359412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017354	AACTTG	2	12	1359422	1359433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3553	NC_017354	GAAA	2	8	1359567	1359574	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017354	G	6	6	1359605	1359610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017354	TAAAT	2	10	1359627	1359636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017354	CAT	2	6	1359698	1359703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_017354	CAT	2	6	1359723	1359728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017354	T	7	7	1359773	1359779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017354	TCAA	2	8	1359825	1359832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_017354	TTG	2	6	1359844	1359849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017354	TAT	2	6	1359892	1359897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017354	TAT	2	6	1359916	1359921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017354	T	6	6	1359948	1359953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017354	GA	3	6	1360017	1360022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017354	TTG	2	6	1360512	1360517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017354	CAA	2	6	1362385	1362390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3570	NC_017354	C	8	8	1363386	1363393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3571	NC_017354	T	8	8	1363408	1363415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017354	T	6	6	1363433	1363438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017354	TC	4	8	1363441	1363448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3576	NC_017354	TTA	2	6	1364033	1364038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_017354	TGA	2	6	1364247	1364252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3585	NC_017354	TTTC	2	8	1366481	1366488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3589	NC_017354	TGTTTA	2	12	1366634	1366645	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_017354	CAA	2	6	1366969	1366974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_017354	TTTA	2	8	1367006	1367013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017354	GA	9	18	1367149	1367166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3599	NC_017354	AAG	2	6	1367203	1367208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017354	GATA	2	8	1367291	1367298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017354	CA	3	6	1367363	1367368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017354	CTA	2	6	1367399	1367404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_017354	CAAAC	2	10	1367561	1367570	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3604	NC_017354	AGC	2	6	1367598	1367603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017354	TAT	2	6	1367646	1367651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017354	ACG	2	6	1367653	1367658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3608	NC_017354	AAAC	2	8	1367867	1367874	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_017354	GAT	2	6	1367886	1367891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017354	AG	3	6	1367942	1367947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017354	TTGT	2	8	1367992	1367999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017354	ATA	2	6	1368029	1368034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017354	GTTTTA	2	12	1374470	1374481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017354	CCA	2	6	1374498	1374503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_017354	TTTTA	2	10	1375186	1375195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017354	TAAAAA	2	12	1375295	1375306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017354	G	7	7	1375321	1375327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017354	TTGA	2	8	1375343	1375350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017354	AAGCCA	2	12	1375447	1375458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017354	AAATT	2	10	1375699	1375708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017354	GGAA	2	8	1375764	1375771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017354	T	6	6	1375784	1375789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017354	A	6	6	1375825	1375830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017354	T	6	6	1380000	1380005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3627	NC_017354	CTT	2	6	1380899	1380904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_017354	TAT	2	6	1380905	1380910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017354	T	6	6	1380914	1380919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017354	TAA	2	6	1381003	1381008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_017354	GGC	2	6	1381316	1381321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3801	NC_017354	T	6	6	1410526	1410531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3894	NC_017354	A	6	6	1468554	1468559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3895	NC_017354	T	6	6	1468602	1468607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3896	NC_017354	TTTG	2	8	1468613	1468620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_017354	T	6	6	1468659	1468664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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