MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 5268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015964	T	7	7	1061	1067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015964	TA	3	6	1100	1105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015964	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015964	TAT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015964	ATA	2	6	1175	1180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015964	ATTT	2	8	1200	1207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015964	GTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015964	CAACCT	2	12	4100	4111	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015964	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015964	CG	3	6	5678	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015964	ATC	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015964	GTG	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015964	TTC	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015964	CGG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015964	CAATG	2	10	5930	5939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015964	CAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015964	GATG	2	8	6058	6065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015964	TGC	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015964	T	6	6	6175	6180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015964	GCT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015964	GAG	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015964	AGT	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015964	TA	3	6	6394	6399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015964	ATT	2	6	6405	6410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015964	C	7	7	8162	8168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_015964	TC	3	6	8215	8220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015964	TCCCC	2	10	8250	8259	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_015964	C	6	6	8256	8261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_015964	G	6	6	8275	8280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015964	ATTAC	2	10	8286	8295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015964	CAAA	2	8	8385	8392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015964	TTA	2	6	8590	8595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015964	GTG	2	6	8614	8619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015964	ACATCA	2	12	8705	8716	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015964	A	6	6	8729	8734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015964	AAG	2	6	8756	8761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015964	TTG	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015964	GAA	2	6	8779	8784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015964	GC	3	6	8891	8896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015964	ATC	2	6	8919	8924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015964	GGC	2	6	8926	8931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015964	TTG	2	6	8987	8992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015964	TTG	2	6	9001	9006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015964	TAAA	2	8	9052	9059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015964	ATT	2	6	9860	9865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015964	CGTG	2	8	9969	9976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015964	GGT	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015964	ATC	2	6	10018	10023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015964	AATA	2	8	10195	10202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015964	GAC	2	6	10248	10253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015964	A	6	6	10418	10423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015964	TTG	2	6	10436	10441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015964	GTT	2	6	10442	10447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015964	ATT	2	6	11304	11309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015964	ATG	2	6	11357	11362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015964	T	6	6	11396	11401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015964	A	6	6	11405	11410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015964	T	6	6	12864	12869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015964	TTAG	2	8	12876	12883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015964	TCA	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015964	TAAC	2	8	13007	13014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015964	TAA	2	6	13035	13040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015964	TAT	2	6	15307	15312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015964	T	6	6	15507	15512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015964	ATA	2	6	15536	15541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015964	T	6	6	15589	15594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015964	A	6	6	15603	15608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015964	TAA	2	6	16245	16250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015964	T	6	6	16270	16275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015964	CGTG	2	8	16277	16284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015964	ACCG	2	8	16312	16319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015964	CTTT	2	8	17641	17648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015964	T	6	6	17646	17651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015964	A	7	7	18377	18383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015964	T	6	6	18411	18416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015964	TCT	2	6	19764	19769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015964	AGCG	2	8	19778	19785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015964	ATC	2	6	19832	19837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015964	CAT	2	6	19856	19861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015964	GCC	2	6	19875	19880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015964	AGA	2	6	20006	20011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015964	TTG	2	6	20072	20077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015964	AAC	2	6	20130	20135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015964	T	6	6	20141	20146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015964	T	6	6	20161	20166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015964	TGC	2	6	20196	20201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015964	TCT	3	9	20229	20237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015964	AAG	2	6	20250	20255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015964	T	6	6	20275	20280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015964	CAT	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015964	CCA	2	6	20325	20330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015964	AAT	2	6	20333	20338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015964	TAA	2	6	20348	20353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015964	AAAC	2	8	20359	20366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015964	ATT	2	6	20390	20395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015964	TTG	2	6	20414	20419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015964	AAT	2	6	20433	20438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015964	T	6	6	20440	20445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015964	GTT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015964	TTTA	2	8	20534	20541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015964	T	6	6	20552	20557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015964	TCT	2	6	20559	20564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015964	CAA	2	6	20582	20587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015964	CCA	2	6	20608	20613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015964	ATA	2	6	20628	20633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015964	ATT	2	6	20649	20654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015964	TAA	2	6	20779	20784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015964	ATA	2	6	20799	20804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015964	TTG	2	6	20808	20813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015964	CGT	2	6	20815	20820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015964	TGG	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015964	ACTTC	2	10	20876	20885	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015964	T	6	6	20887	20892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015964	CTT	2	6	20895	20900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015964	AAT	2	6	20903	20908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015964	TGA	2	6	21005	21010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015964	A	7	7	21092	21098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015964	T	6	6	21106	21111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015964	TCA	2	6	21706	21711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015964	TAAAA	2	10	24406	24415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015964	A	6	6	25182	25187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015964	A	6	6	25189	25194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015964	ATG	2	6	25226	25231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015964	GT	3	6	26660	26665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015964	AAT	2	6	26717	26722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015964	ACT	2	6	26766	26771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015964	TGT	2	6	26778	26783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015964	A	6	6	26814	26819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015964	AT	3	6	27490	27495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015964	A	6	6	27496	27501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015964	T	7	7	27520	27526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015964	A	6	6	27993	27998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015964	ATT	2	6	31058	31063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015964	AGAAAT	2	12	32112	32123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015964	A	6	6	32124	32129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015964	CTC	2	6	32723	32728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015964	TC	3	6	32727	32732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015964	TTA	2	6	33943	33948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015964	GAT	2	6	33960	33965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015964	CAA	2	6	33982	33987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015964	CTT	2	6	34079	34084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015964	A	6	6	34107	34112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015964	A	6	6	34119	34124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015964	A	6	6	34133	34138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015964	T	6	6	34146	34151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015964	CA	3	6	34158	34163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015964	ACC	2	6	35165	35170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_015964	ATT	2	6	35184	35189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_015964	A	6	6	38726	38731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015964	CAA	2	6	128219	128224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_015964	TCG	2	6	196176	196181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_015964	CTT	2	6	196213	196218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_015964	A	6	6	196305	196310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015964	T	6	6	196368	196373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015964	A	6	6	196388	196393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015964	TAA	2	6	196427	196432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_015964	AAT	2	6	198447	198452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_015964	TTTA	2	8	198502	198509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015964	A	6	6	200726	200731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015964	GTTC	2	8	200766	200773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
450	NC_015964	T	6	6	201228	201233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015964	ATTA	2	8	202661	202668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_015964	TAAT	2	8	202684	202691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015964	AAT	3	9	202700	202708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015964	T	6	6	202736	202741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015964	GCA	2	6	202784	202789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_015964	TAT	2	6	202826	202831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_015964	TTA	2	6	202838	202843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_015964	ATT	2	6	202852	202857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_015964	A	6	6	204145	204150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_015964	T	6	6	204169	204174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015964	CTA	2	6	205320	205325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_015964	T	6	6	206240	206245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_015964	TA	4	8	206251	206258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015964	A	6	6	206293	206298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_015964	A	6	6	206337	206342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_015964	TCA	2	6	206353	206358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_015964	ATG	2	6	207771	207776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_015964	TG	3	6	207775	207780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015964	TTATT	2	10	207786	207795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015964	TTG	2	6	207806	207811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_015964	TCA	2	6	207819	207824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_015964	T	7	7	207857	207863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_015964	A	6	6	207868	207873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015964	GAA	2	6	207875	207880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
478	NC_015964	A	6	6	207879	207884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_015964	A	6	6	207886	207891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_015964	A	6	6	207896	207901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015964	TTA	2	6	207920	207925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015964	ATG	2	6	209018	209023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015964	ATT	2	6	209851	209856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_015964	AATAAA	2	12	214935	214946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_015964	TAA	2	6	214954	214959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015964	T	6	6	215100	215105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_015964	AAT	2	6	216023	216028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_015964	TAA	2	6	217242	217247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_015964	TAAA	2	8	217257	217264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015964	TC	3	6	217558	217563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_015964	TTCC	2	8	218890	218897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_015964	AT	3	6	218901	218906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_015964	TCA	2	6	218972	218977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_015964	ATG	2	6	218997	219002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015964	AAAT	2	8	225171	225178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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