MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 2874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015955	TGG	2	6	270435	270440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015955	CTT	2	6	270441	270446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015955	ATT	2	6	270543	270548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015955	AT	3	6	270599	270604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015955	TAC	2	6	270617	270622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015955	AC	3	6	270650	270655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015955	CGC	2	6	271489	271494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_015955	CCG	2	6	271535	271540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_015955	CA	3	6	282840	282845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_015955	ACC	2	6	282890	282895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_015955	TGA	2	6	282963	282968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015955	AGT	2	6	282996	283001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015955	AG	3	6	283113	283118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015955	GGGA	2	8	283144	283151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015955	ACG	2	6	284972	284977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015955	TCC	2	6	285019	285024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_015955	GC	3	6	285111	285116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_015955	GCG	2	6	285127	285132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015955	GC	3	6	286916	286921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_015955	GCG	2	6	286923	286928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015955	CCA	2	6	287014	287019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_015955	GTGG	2	8	287025	287032	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015955	GCCC	2	8	287076	287083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1024	NC_015955	CGC	2	6	287088	287093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_015955	GCC	2	6	287095	287100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_015955	TCGC	2	8	287108	287115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_015955	GACC	2	8	287116	287123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_015955	CCGC	2	8	287151	287158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_015955	G	6	6	287209	287214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015955	GCG	2	6	287219	287224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015955	GCT	2	6	287227	287232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015955	TTG	2	6	288074	288079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015955	TC	3	6	288081	288086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_015955	GTT	2	6	288115	288120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015955	CAT	2	6	288193	288198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015955	TA	3	6	288203	288208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015955	GCA	2	6	288291	288296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_015955	CCA	3	9	288297	288305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_015955	TCC	2	6	288571	288576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_015955	CCT	2	6	288581	288586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_015955	TTC	2	6	288639	288644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015955	GAC	2	6	288669	288674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015955	TAC	2	6	288675	288680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015955	CGA	2	6	288709	288714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015955	CAG	2	6	288717	288722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015955	ACG	2	6	288736	288741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015955	TTC	2	6	288756	288761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015955	GGC	2	6	288773	288778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015955	AGG	2	6	288784	288789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015955	ACG	2	6	288852	288857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015955	GCC	2	6	288996	289001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_015955	ACG	2	6	289014	289019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015955	CGA	2	6	289024	289029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015955	CCA	2	6	289042	289047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_015955	CGA	2	6	289063	289068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015955	CGC	2	6	289099	289104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_015955	ACG	2	6	289139	289144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015955	CGGC	2	8	289146	289153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_015955	CAG	2	6	289247	289252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015955	CCG	2	6	289291	289296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_015955	GCT	2	6	289318	289323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015955	ACG	3	9	289347	289355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015955	GGTC	2	8	289407	289414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_015955	GCA	2	6	289505	289510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015955	GCG	2	6	289548	289553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015955	CGC	2	6	289568	289573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_015955	TCG	2	6	289623	289628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015955	GCT	2	6	289639	289644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015955	ACGGC	2	10	289676	289685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_015955	GAC	2	6	289703	289708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015955	GAG	2	6	289727	289732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015955	GCC	2	6	289775	289780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_015955	GTG	2	6	289781	289786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015955	AGTG	2	8	289800	289807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015955	TCGC	2	8	289846	289853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_015955	CTT	2	6	289885	289890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015955	GCC	2	6	289903	289908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_015955	GCG	3	9	289936	289944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015955	CAGC	2	8	289949	289956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_015955	GGCT	2	8	289969	289976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_015955	CGC	2	6	290005	290010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_015955	TCGC	2	8	290026	290033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_015955	GTG	2	6	290053	290058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015955	TCG	2	6	290099	290104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015955	CTG	2	6	290117	290122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015955	TAG	2	6	290934	290939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015955	AGTG	2	8	291024	291031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015955	G	6	6	291033	291038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015955	GTA	2	6	291041	291046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015955	AGG	2	6	291051	291056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015955	TCA	2	6	291062	291067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015955	GTG	2	6	291102	291107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015955	CTC	2	6	292792	292797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_015955	GAC	2	6	292808	292813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_015955	GTC	2	6	292859	292864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015955	GA	3	6	292900	292905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015955	TAT	2	6	293870	293875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015955	CAAA	2	8	293887	293894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_015955	GTC	2	6	293935	293940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015955	GTG	2	6	293944	293949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015955	TGC	2	6	293952	293957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015955	CCT	2	6	293970	293975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_015955	CT	3	6	294028	294033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_015955	TCGC	2	8	294108	294115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_015955	GCC	2	6	294165	294170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_015955	ACG	2	6	294190	294195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015955	GCG	3	9	294198	294206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015955	AGT	2	6	294219	294224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015955	GGCT	2	8	294231	294238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_015955	CGC	2	6	294267	294272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015955	TCGC	2	8	294288	294295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_015955	GACC	2	8	294296	294303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_015955	CTGC	3	12	294312	294323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_015955	GCGG	2	8	294328	294335	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_015955	G	6	6	294383	294388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015955	GCG	2	6	294393	294398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015955	GCT	2	6	294401	294406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015955	C	6	6	294409	294414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1119	NC_015955	CGCT	2	8	294432	294439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015955	CGGG	2	8	294441	294448	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_015955	CG	3	6	294453	294458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_015955	GCGA	2	8	294500	294507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_015955	GC	3	6	294510	294515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_015955	GTCG	2	8	294526	294533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_015955	GTC	2	6	294536	294541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015955	TGAGT	2	10	294600	294609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015955	CGGAG	2	10	295512	295521	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_015955	T	6	6	295527	295532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015955	GT	3	6	295537	295542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015955	CAC	2	6	295563	295568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_015955	GCT	2	6	295582	295587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015955	TAC	2	6	295633	295638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015955	GA	3	6	295697	295702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015955	GA	3	6	297150	297155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015955	GGA	2	6	297156	297161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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