MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 9971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015954	GCTC	2	8	1123452	1123459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_015954	GTC	2	6	1123461	1123466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_015954	AGC	2	6	1123476	1123481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_015954	TCGCG	2	10	1123506	1123515	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3505	NC_015954	GCG	2	6	1124854	1124859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_015954	AGC	2	6	1124867	1124872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_015954	GCG	2	6	1124892	1124897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_015954	CGC	2	6	1124905	1124910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_015954	G	6	6	1124913	1124918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015954	CCCT	2	8	1127229	1127236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3511	NC_015954	GTC	2	6	1127274	1127279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_015954	AGC	2	6	1127283	1127288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_015954	CGC	2	6	1127313	1127318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_015954	GCC	2	6	1127338	1127343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_015954	CGG	2	6	1127366	1127371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_015954	CGCT	2	8	1127377	1127384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_015954	CGGG	2	8	1128520	1128527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_015954	GTCGT	2	10	1128635	1128644	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3519	NC_015954	TCC	2	6	1128647	1128652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_015954	TCG	2	6	1128692	1128697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_015954	CAG	2	6	1128723	1128728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_015954	GGC	2	6	1128771	1128776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_015954	CTG	2	6	1128864	1128869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015954	GAG	2	6	1128874	1128879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015954	CG	3	6	1128904	1128909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_015954	TCG	2	6	1128995	1129000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015954	CCG	2	6	1129080	1129085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_015954	AGG	2	6	1129088	1129093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015954	GCCC	2	8	1129110	1129117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3530	NC_015954	ACG	2	6	1129130	1129135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_015954	TCG	3	9	1129193	1129201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_015954	CCG	2	6	1129218	1129223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_015954	CAGT	2	8	1129224	1129231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_015954	CCG	2	6	1129236	1129241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_015954	AG	3	6	1129254	1129259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_015954	GCCCG	2	10	1129318	1129327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3537	NC_015954	GC	4	8	1129745	1129752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_015954	ATC	2	6	1133871	1133876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015954	TA	3	6	1134964	1134969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015954	TA	3	6	1134974	1134979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_015954	CTA	2	6	1135124	1135129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_015954	TA	3	6	1135128	1135133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015954	TCTG	2	8	1135152	1135159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_015954	CCT	2	6	1135163	1135168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_015954	CAC	2	6	1136275	1136280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_015954	TATG	2	8	1136511	1136518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_015954	GCC	3	9	1136521	1136529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_015954	ACT	2	6	1136553	1136558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_015954	ACCT	2	8	1136575	1136582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_015954	GAA	2	6	1136611	1136616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015954	CGAC	2	8	1136626	1136633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_015954	GGA	2	6	1136636	1136641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015954	CA	3	6	1136684	1136689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_015954	GCGA	2	8	1137109	1137116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_015954	GGT	2	6	1137144	1137149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_015954	CGAA	2	8	1137159	1137166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_015954	AC	3	6	1137210	1137215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_015954	GAGC	2	8	1137226	1137233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_015954	TG	3	6	1137261	1137266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_015954	CAC	2	6	1137323	1137328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_015954	CTCG	2	8	1137418	1137425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_015954	TCC	2	6	1137426	1137431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_015954	CT	3	6	1137443	1137448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_015954	GCT	2	6	1137483	1137488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015954	GTC	2	6	1137661	1137666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_015954	GAG	2	6	1137698	1137703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015954	CGGTG	2	10	1137719	1137728	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3568	NC_015954	TCC	2	6	1137733	1137738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_015954	C	6	6	1137906	1137911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3570	NC_015954	ACG	2	6	1137927	1137932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_015954	CGAC	2	8	1139867	1139874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_015954	GCCG	2	8	1143321	1143328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_015954	CGG	2	6	1143878	1143883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_015954	GCGGG	2	10	1143897	1143906	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3575	NC_015954	CTG	2	6	1144031	1144036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_015954	CCA	2	6	1144065	1144070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_015954	ACG	2	6	1144118	1144123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_015954	CGG	2	6	1144191	1144196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_015954	CCCG	2	8	1144236	1144243	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3580	NC_015954	TAA	2	6	1144256	1144261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_015954	GACC	2	8	1144335	1144342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_015954	CGG	2	6	1145464	1145469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_015954	GCTG	2	8	1145482	1145489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_015954	GTT	2	6	1145533	1145538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015954	CGCT	2	8	1145670	1145677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_015954	TGG	2	6	1145684	1145689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_015954	ACGC	2	8	1145713	1145720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_015954	GCC	2	6	1145764	1145769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_015954	CGG	2	6	1145829	1145834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015954	GGT	2	6	1145855	1145860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_015954	CCG	2	6	1147764	1147769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_015954	GCGG	2	8	1152233	1152240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_015954	GTC	2	6	1152745	1152750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015954	GGGC	2	8	1152751	1152758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_015954	GCCG	2	8	1152799	1152806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_015954	GGC	2	6	1154041	1154046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015954	CGA	2	6	1158459	1158464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015954	GGAC	2	8	1158492	1158499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_015954	GCG	2	6	1158547	1158552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_015954	ACC	2	6	1158577	1158582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015954	CGG	2	6	1158610	1158615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_015954	GTA	2	6	1163114	1163119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015954	GGC	2	6	1163122	1163127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_015954	CCT	2	6	1163437	1163442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_015954	CGG	2	6	1163448	1163453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015954	CCCG	2	8	1163461	1163468	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3607	NC_015954	CT	3	6	1165577	1165582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_015954	CGG	2	6	1165588	1165593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_015954	CGT	2	6	1165624	1165629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015954	GC	3	6	1166029	1166034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_015954	CGG	2	6	1166037	1166042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_015954	GGC	2	6	1166057	1166062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_015954	TTC	2	6	1166070	1166075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_015954	CCGG	2	8	1166125	1166132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_015954	GAC	2	6	1166183	1166188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_015954	GCG	2	6	1166212	1166217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015954	TTGG	2	8	1166223	1166230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015954	GC	3	6	1168525	1168530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_015954	TCGC	2	8	1168533	1168540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_015954	GCT	2	6	1168541	1168546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_015954	CCG	2	6	1168573	1168578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_015954	CCA	2	6	1168599	1168604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_015954	GCCA	2	8	1168632	1168639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_015954	CCG	2	6	1168661	1168666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_015954	GGC	2	6	1168672	1168677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_015954	G	8	8	1168687	1168694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_015954	A	6	6	1168698	1168703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_015954	GGC	2	6	1168727	1168732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_015954	GTC	2	6	1168746	1168751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_015954	GGC	2	6	1168762	1168767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_015954	GTC	2	6	1168782	1168787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_015954	GTC	2	6	1168818	1168823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3757	NC_015954	CCT	2	6	1196898	1196903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3762	NC_015954	TCC	2	6	1197461	1197466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3763	NC_015954	CCG	2	6	1197488	1197493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3882	NC_015954	CAG	2	6	1211577	1211582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3885	NC_015954	CGCTT	2	10	1213203	1213212	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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