MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 9971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015954	CGA	2	6	993308	993313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_015954	ACAG	2	8	993324	993331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_015954	CGC	2	6	993818	993823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_015954	CGT	2	6	993841	993846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_015954	GGC	2	6	994277	994282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015954	GAG	2	6	994314	994319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015954	CAG	2	6	994346	994351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_015954	GT	3	6	994852	994857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015954	GTC	2	6	994918	994923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_015954	TGCAA	3	15	994927	994941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_015954	AAC	2	6	998592	998597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_015954	GCA	2	6	1002475	1002480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015954	TCCG	2	8	1002508	1002515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_015954	GC	3	6	1002569	1002574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_015954	ACC	2	6	1002619	1002624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_015954	CTG	2	6	1002655	1002660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015954	CGT	2	6	1002765	1002770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015954	TCG	2	6	1002800	1002805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015954	ACG	2	6	1002806	1002811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015954	TCG	2	6	1002815	1002820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015954	CTG	2	6	1002825	1002830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_015954	GCCA	2	8	1002868	1002875	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_015954	AGT	2	6	1002945	1002950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015954	CG	3	6	1002957	1002962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_015954	CGG	2	6	1002973	1002978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015954	CCGGG	2	10	1003021	1003030	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3027	NC_015954	GCC	2	6	1004169	1004174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_015954	GATG	2	8	1004210	1004217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015954	CGA	2	6	1004270	1004275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015954	CACGA	2	10	1004307	1004316	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3031	NC_015954	GGA	2	6	1004366	1004371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015954	CGA	3	9	1004468	1004476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015954	CGG	2	6	1004528	1004533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015954	CGG	2	6	1004546	1004551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_015954	GACG	2	8	1004561	1004568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_015954	CGT	2	6	1004664	1004669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015954	ACG	2	6	1004702	1004707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015954	CGT	3	9	1004730	1004738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015954	GGC	2	6	1004823	1004828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_015954	CGA	2	6	1004873	1004878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_015954	CGC	2	6	1004950	1004955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_015954	AGTT	2	8	1004970	1004977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015954	ACTC	2	8	1005001	1005008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_015954	TCG	2	6	1005016	1005021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015954	GA	3	6	1005058	1005063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015954	AC	3	6	1006265	1006270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_015954	TCG	2	6	1009851	1009856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_015954	TCG	2	6	1009906	1009911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_015954	GCC	2	6	1011221	1011226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_015954	GA	4	8	1012076	1012083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015954	GAC	2	6	1012094	1012099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015954	ACG	2	6	1012911	1012916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015954	GTT	2	6	1012924	1012929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015954	GAC	2	6	1012957	1012962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015954	GGC	2	6	1012997	1013002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015954	TGG	2	6	1013026	1013031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015954	CGG	2	6	1013037	1013042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_015954	GTGC	2	8	1013149	1013156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_015954	CGC	2	6	1013172	1013177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_015954	CCGA	2	8	1013194	1013201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_015954	CGGA	2	8	1013208	1013215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_015954	GAG	2	6	1013269	1013274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015954	CAG	2	6	1013424	1013429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015954	CGC	2	6	1013448	1013453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_015954	TCGG	2	8	1013462	1013469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_015954	CTT	2	6	1013543	1013548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015954	TCG	2	6	1013575	1013580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015954	TGG	2	6	1013588	1013593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015954	TTC	2	6	1013594	1013599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_015954	GTTG	2	8	1015629	1015636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015954	CTT	2	6	1015645	1015650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_015954	GAT	2	6	1015681	1015686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015954	CAG	2	6	1015830	1015835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_015954	TCC	2	6	1015846	1015851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_015954	CGC	3	9	1015857	1015865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_015954	GCGA	2	8	1015927	1015934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_015954	CAA	2	6	1016058	1016063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015954	CA	3	6	1016072	1016077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_015954	GGT	2	6	1021121	1021126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015954	TCG	2	6	1021185	1021190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_015954	GAGCG	2	10	1021248	1021257	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3082	NC_015954	CGAA	2	8	1021307	1021314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_015954	GAG	2	6	1021318	1021323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015954	CCA	2	6	1021474	1021479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_015954	GTC	2	6	1021522	1021527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_015954	CGG	2	6	1021638	1021643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_015954	TG	3	6	1022391	1022396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015954	CGA	2	6	1022492	1022497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015954	AAC	2	6	1022549	1022554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_015954	GGC	2	6	1022573	1022578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015954	AAC	2	6	1023716	1023721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_015954	GAG	2	6	1025785	1025790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015954	GAC	2	6	1025800	1025805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_015954	T	6	6	1026075	1026080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015954	ACCG	2	8	1026128	1026135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_015954	AGGG	2	8	1026152	1026159	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015954	GTT	2	6	1026178	1026183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015954	TAC	2	6	1026204	1026209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015954	GTA	2	6	1026227	1026232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015954	CAC	2	6	1026240	1026245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_015954	TCA	2	6	1026293	1026298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015954	ACG	2	6	1026323	1026328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015954	AAG	2	6	1026331	1026336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015954	ACC	2	6	1026391	1026396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_015954	CGAA	2	8	1026459	1026466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_015954	GAC	2	6	1026580	1026585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_015954	CAA	2	6	1026594	1026599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015954	GCGG	2	8	1028862	1028869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_015954	GGAA	2	8	1030072	1030079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015954	GC	3	6	1030083	1030088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_015954	GGC	2	6	1034774	1034779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015954	TAA	3	9	1034814	1034822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015954	T	6	6	1034823	1034828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015954	AAT	2	6	1034829	1034834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015954	AGC	2	6	1034897	1034902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015954	GGC	2	6	1034908	1034913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_015954	G	6	6	1034973	1034978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015954	TGG	2	6	1034996	1035001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015954	ACG	2	6	1035053	1035058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_015954	TCG	2	6	1035080	1035085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015954	CAG	2	6	1035101	1035106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015954	GAG	2	6	1035136	1035141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015954	CAA	2	6	1035142	1035147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_015954	GCC	2	6	1035221	1035226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_015954	GGC	2	6	1035245	1035250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015954	GCC	2	6	1035302	1035307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_015954	TCGT	2	8	1035339	1035346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_015954	GCG	3	9	1035374	1035382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015954	ACG	2	6	1037464	1037469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015954	ACC	2	6	1037473	1037478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_015954	GGT	2	6	1039108	1039113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3135	NC_015954	CG	3	6	1041015	1041020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3262	NC_015954	TCG	2	6	1067527	1067532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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