MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 9971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015954	AAT	2	6	2814442	2814447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_015954	GCC	2	6	2814451	2814456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9503	NC_015954	GC	3	6	2814581	2814586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9504	NC_015954	AC	3	6	2814734	2814739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9505	NC_015954	T	6	6	2814752	2814757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_015954	CTAT	2	8	2814760	2814767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9507	NC_015954	CGT	2	6	2814810	2814815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_015954	G	7	7	2814816	2814822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_015954	GAT	2	6	2814915	2814920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_015954	GTG	2	6	2814951	2814956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_015954	TAAA	2	8	2815243	2815250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_015954	GAA	2	6	2815400	2815405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_015954	CAC	2	6	2815437	2815442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9514	NC_015954	ACG	2	6	2815456	2815461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_015954	CTG	2	6	2815504	2815509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9516	NC_015954	ACA	2	6	2815549	2815554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9517	NC_015954	GAG	2	6	2815555	2815560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_015954	GT	3	6	2815613	2815618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_015954	AGC	2	6	2815624	2815629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9520	NC_015954	CGG	2	6	2815658	2815663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_015954	TGA	2	6	2815758	2815763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_015954	TCGC	2	8	2815815	2815822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9523	NC_015954	GCC	2	6	2815871	2815876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9524	NC_015954	CGA	2	6	2815882	2815887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9525	NC_015954	CCA	2	6	2815908	2815913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9526	NC_015954	AAC	2	6	2815978	2815983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_015954	ACC	2	6	2816027	2816032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9528	NC_015954	AGG	2	6	2816094	2816099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_015954	ATG	2	6	2816110	2816115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_015954	AGTG	2	8	2816126	2816133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_015954	AGT	2	6	2816151	2816156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_015954	CAG	2	6	2816191	2816196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9533	NC_015954	ATC	2	6	2816267	2816272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_015954	CAA	2	6	2816299	2816304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9535	NC_015954	GTT	2	6	2816356	2816361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_015954	TAA	2	6	2816401	2816406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_015954	TGG	2	6	2816447	2816452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_015954	GTG	2	6	2816472	2816477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_015954	GTC	2	6	2816483	2816488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9540	NC_015954	TTCC	2	8	2816529	2816536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9541	NC_015954	TC	3	6	2816641	2816646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9542	NC_015954	AGA	2	6	2816667	2816672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_015954	GGA	2	6	2816774	2816779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9544	NC_015954	TAC	2	6	2816784	2816789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9545	NC_015954	CGG	2	6	2816797	2816802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9546	NC_015954	TCA	2	6	2816917	2816922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9547	NC_015954	GAC	2	6	2816942	2816947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9548	NC_015954	CGT	2	6	2817009	2817014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_015954	CCG	2	6	2817025	2817030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9550	NC_015954	GA	3	6	2817058	2817063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_015954	GGA	2	6	2817124	2817129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_015954	GCC	2	6	2817130	2817135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9553	NC_015954	TCGCA	2	10	2817170	2817179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9554	NC_015954	TCGC	2	8	2817688	2817695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9555	NC_015954	GGT	2	6	2818431	2818436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_015954	CGC	3	9	2819783	2819791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9557	NC_015954	CGCC	2	8	2819810	2819817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9558	NC_015954	CCG	2	6	2819851	2819856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9559	NC_015954	CGC	2	6	2819863	2819868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_015954	CACC	2	8	2821161	2821168	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9561	NC_015954	GGC	2	6	2822270	2822275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_015954	GA	3	6	2822277	2822282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_015954	GTC	2	6	2822912	2822917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9564	NC_015954	GCTC	2	8	2822932	2822939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9565	NC_015954	GCCC	2	8	2822967	2822974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9566	NC_015954	CGG	2	6	2822975	2822980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9567	NC_015954	TTG	2	6	2824893	2824898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_015954	AG	3	6	2824913	2824918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9569	NC_015954	GATA	2	8	2824964	2824971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9570	NC_015954	TCG	2	6	2825051	2825056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9571	NC_015954	GAT	2	6	2825067	2825072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_015954	AGA	2	6	2825116	2825121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9573	NC_015954	TCC	2	6	2825389	2825394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9574	NC_015954	GACC	2	8	2826242	2826249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9575	NC_015954	GCA	2	6	2826296	2826301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_015954	CCT	2	6	2826303	2826308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9577	NC_015954	ATCA	2	8	2826318	2826325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9578	NC_015954	AGT	2	6	2826329	2826334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_015954	TGC	2	6	2826354	2826359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9580	NC_015954	ATC	2	6	2826495	2826500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9581	NC_015954	TTG	2	6	2826570	2826575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_015954	TC	3	6	2826667	2826672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9583	NC_015954	AGA	2	6	2826693	2826698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_015954	TTG	2	6	2826795	2826800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_015954	CAC	2	6	2827370	2827375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9586	NC_015954	GA	3	6	2827420	2827425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_015954	GTT	2	6	2827433	2827438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9588	NC_015954	GTC	2	6	2827509	2827514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9589	NC_015954	GTC	2	6	2827580	2827585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9590	NC_015954	TGT	3	9	2827631	2827639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9591	NC_015954	TCT	2	6	2827643	2827648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9592	NC_015954	GCC	2	6	2827725	2827730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9593	NC_015954	GCG	2	6	2827731	2827736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9594	NC_015954	TCG	2	6	2827744	2827749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9595	NC_015954	GCG	2	6	2827762	2827767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9596	NC_015954	TGT	2	6	2827768	2827773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_015954	ACT	2	6	2827885	2827890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9598	NC_015954	TGGC	2	8	2827894	2827901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9599	NC_015954	ATC	2	6	2827955	2827960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9600	NC_015954	TCG	2	6	2827977	2827982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9601	NC_015954	CGA	2	6	2828064	2828069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9602	NC_015954	ACG	2	6	2828096	2828101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NC_015954	GCT	2	6	2828535	2828540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9604	NC_015954	GGC	2	6	2828570	2828575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9605	NC_015954	CCCGTT	2	12	2828585	2828596	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9606	NC_015954	ACC	2	6	2828605	2828610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9607	NC_015954	GA	3	6	2831927	2831932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_015954	CTG	2	6	2831991	2831996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9609	NC_015954	TCG	3	9	2832510	2832518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9610	NC_015954	GGA	2	6	2832519	2832524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_015954	GCG	3	9	2832588	2832596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9612	NC_015954	TC	3	6	2832614	2832619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9613	NC_015954	CCA	2	6	2832631	2832636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9614	NC_015954	GCG	2	6	2832695	2832700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9615	NC_015954	CAG	2	6	2832821	2832826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9616	NC_015954	CTC	2	6	2832866	2832871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9617	NC_015954	CTG	2	6	2832935	2832940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9618	NC_015954	TCA	2	6	2832951	2832956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9619	NC_015954	CG	3	6	2832974	2832979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9620	NC_015954	CGA	2	6	2832991	2832996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9621	NC_015954	GCC	2	6	2833017	2833022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9622	NC_015954	GCTG	2	8	2833045	2833052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9623	NC_015954	GT	3	6	2833055	2833060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_015954	GGCC	2	8	2834555	2834562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9625	NC_015954	AC	3	6	2834586	2834591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9626	NC_015954	GAA	2	6	2836299	2836304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9627	NC_015954	GTCGG	2	10	2836800	2836809	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9628	NC_015954	GGTC	2	8	2836868	2836875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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9630	NC_015954	CGC	2	6	2839460	2839465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.