MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 9971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015954	GC	3	6	2202487	2202492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7502	NC_015954	CA	3	6	2203847	2203852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7503	NC_015954	GTG	2	6	2205474	2205479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_015954	CG	3	6	2205600	2205605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_015954	TGC	2	6	2205948	2205953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_015954	GGCG	2	8	2205957	2205964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7507	NC_015954	CG	3	6	2205973	2205978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7508	NC_015954	ACG	2	6	2205986	2205991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_015954	TGAG	2	8	2206012	2206019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_015954	GGT	2	6	2206033	2206038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_015954	GCT	2	6	2206064	2206069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_015954	CTC	2	6	2206075	2206080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7513	NC_015954	CGCT	2	8	2206105	2206112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7514	NC_015954	TCGC	2	8	2206113	2206120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7515	NC_015954	CGG	2	6	2207055	2207060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_015954	CCA	2	6	2208353	2208358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_015954	ACGG	2	8	2208377	2208384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7518	NC_015954	TCA	2	6	2208429	2208434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_015954	CA	3	6	2208433	2208438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7520	NC_015954	CTG	2	6	2208466	2208471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_015954	CTG	2	6	2208484	2208489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_015954	CT	3	6	2208512	2208517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7523	NC_015954	CAG	2	6	2208590	2208595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_015954	C	6	6	2208650	2208655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7525	NC_015954	CTT	2	6	2208670	2208675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_015954	CAT	2	6	2208719	2208724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_015954	TCA	2	6	2208789	2208794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_015954	CTT	2	6	2208799	2208804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_015954	GGT	2	6	2208834	2208839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_015954	TCT	2	6	2208873	2208878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_015954	GA	3	6	2208905	2208910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_015954	TGA	2	6	2208937	2208942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_015954	TCA	2	6	2209282	2209287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_015954	ATC	2	6	2209343	2209348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_015954	GCG	2	6	2209385	2209390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_015954	CA	3	6	2210779	2210784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7537	NC_015954	TA	3	6	2210883	2210888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_015954	AG	3	6	2211639	2211644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_015954	ATC	2	6	2211655	2211660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_015954	TGC	2	6	2213787	2213792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_015954	CTC	2	6	2213808	2213813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7542	NC_015954	CA	3	6	2213906	2213911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7543	NC_015954	CGG	2	6	2214946	2214951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_015954	AGC	2	6	2214967	2214972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_015954	CGA	2	6	2214981	2214986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_015954	GC	3	6	2215005	2215010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7547	NC_015954	GTT	2	6	2218626	2218631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_015954	GGTG	2	8	2218632	2218639	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_015954	G	6	6	2218639	2218644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_015954	GCC	2	6	2218650	2218655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_015954	CG	3	6	2218662	2218667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7552	NC_015954	CACG	2	8	2218673	2218680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_015954	GTT	2	6	2218686	2218691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_015954	CCG	2	6	2219325	2219330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7555	NC_015954	TGC	2	6	2219352	2219357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_015954	TGC	2	6	2219908	2219913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_015954	TAC	2	6	2219940	2219945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_015954	CCT	2	6	2219972	2219977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7559	NC_015954	CA	3	6	2220001	2220006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7560	NC_015954	CCG	2	6	2220088	2220093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7561	NC_015954	CTCC	2	8	2220101	2220108	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7562	NC_015954	TTA	2	6	2220126	2220131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_015954	TC	4	8	2221135	2221142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7564	NC_015954	CGG	2	6	2224332	2224337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_015954	ACGA	2	8	2224355	2224362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7566	NC_015954	TG	3	6	2224381	2224386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_015954	CAC	2	6	2224397	2224402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7568	NC_015954	GCG	2	6	2224418	2224423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_015954	CG	3	6	2224532	2224537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7570	NC_015954	AAG	2	6	2224549	2224554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_015954	TG	3	6	2225611	2225616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_015954	TAA	2	6	2226512	2226517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_015954	GA	3	6	2226549	2226554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_015954	GCT	2	6	2226565	2226570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_015954	CT	4	8	2226647	2226654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7576	NC_015954	CGGT	2	8	2226802	2226809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7577	NC_015954	CGC	2	6	2226819	2226824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7578	NC_015954	GTT	2	6	2226978	2226983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_015954	AGA	2	6	2227024	2227029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_015954	ATGCCA	2	12	2227091	2227102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_015954	CAA	2	6	2227104	2227109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_015954	CGT	2	6	2227186	2227191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_015954	GGC	2	6	2227290	2227295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_015954	CGC	2	6	2227307	2227312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7585	NC_015954	TCG	2	6	2227390	2227395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_015954	CG	3	6	2227408	2227413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7587	NC_015954	TC	3	6	2227426	2227431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7588	NC_015954	CGG	2	6	2227455	2227460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_015954	CGC	2	6	2227462	2227467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7590	NC_015954	TCG	2	6	2227505	2227510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7591	NC_015954	TCG	2	6	2227553	2227558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_015954	CAC	2	6	2227588	2227593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_015954	ACG	2	6	2227598	2227603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_015954	GACGGC	2	12	2227639	2227650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_015954	GC	3	6	2227652	2227657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7596	NC_015954	TGT	2	6	2227688	2227693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_015954	ACCG	2	8	2227740	2227747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7598	NC_015954	C	6	6	2227756	2227761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7599	NC_015954	CCG	2	6	2227797	2227802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7600	NC_015954	GTC	2	6	2230551	2230556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_015954	CCAC	2	8	2232403	2232410	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7602	NC_015954	GCGTC	2	10	2233556	2233565	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7603	NC_015954	GCCG	2	8	2233580	2233587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7604	NC_015954	CGCA	2	8	2234444	2234451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7605	NC_015954	GC	3	6	2234454	2234459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7606	NC_015954	GGC	2	6	2235466	2235471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7607	NC_015954	GCC	2	6	2235475	2235480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7608	NC_015954	CCT	2	6	2235505	2235510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7609	NC_015954	TCG	2	6	2235527	2235532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_015954	TCGT	2	8	2235539	2235546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7611	NC_015954	GTT	2	6	2235570	2235575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_015954	CGAC	3	12	2235648	2235659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7613	NC_015954	GC	4	8	2235673	2235680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7614	NC_015954	CGAC	2	8	2235704	2235711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7615	NC_015954	TCGG	2	8	2238400	2238407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7616	NC_015954	CTT	2	6	2238756	2238761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_015954	GCT	2	6	2243938	2243943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_015954	CT	3	6	2243946	2243951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_015954	CGA	2	6	2243997	2244002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_015954	GCA	2	6	2246598	2246603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7621	NC_015954	T	6	6	2246657	2246662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_015954	GCA	2	6	2246663	2246668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_015954	ACC	2	6	2246717	2246722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7624	NC_015954	CGG	2	6	2246753	2246758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_015954	CGT	2	6	2246777	2246782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_015954	AGC	2	6	2247594	2247599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_015954	CGG	2	6	2247620	2247625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_015954	GC	3	6	2247641	2247646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7629	NC_015954	AAG	2	6	2247683	2247688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7631	NC_015954	CCG	2	6	2247786	2247791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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