MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 9971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015954	GAG	2	6	2076322	2076327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_015954	CGA	2	6	2076373	2076378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_015954	CGCT	2	8	2076423	2076430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_015954	CTCGT	2	10	2076458	2076467	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7005	NC_015954	CCAG	2	8	2076524	2076531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_015954	AT	3	6	2076549	2076554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_015954	TCG	2	6	2077082	2077087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_015954	TCG	2	6	2077127	2077132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_015954	ACCG	2	8	2077216	2077223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_015954	CGTT	2	8	2077240	2077247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7011	NC_015954	GAC	2	6	2077254	2077259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_015954	GCT	2	6	2077260	2077265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_015954	ACT	2	6	2077313	2077318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_015954	GATCTG	2	12	2077366	2077377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7015	NC_015954	GAC	2	6	2077394	2077399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_015954	TCAA	2	8	2077947	2077954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7017	NC_015954	AG	4	8	2077972	2077979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_015954	AGA	2	6	2077986	2077991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_015954	ACC	2	6	2078022	2078027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_015954	ACG	2	6	2078081	2078086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_015954	GAT	2	6	2078126	2078131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_015954	CCA	2	6	2078589	2078594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_015954	CCG	2	6	2078616	2078621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_015954	GGCC	2	8	2078646	2078653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_015954	CTT	2	6	2079935	2079940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_015954	CGG	3	9	2079943	2079951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_015954	TCG	2	6	2080585	2080590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_015954	CGT	2	6	2080600	2080605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_015954	CT	3	6	2081238	2081243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_015954	CGC	2	6	2081278	2081283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_015954	CGAC	2	8	2081899	2081906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_015954	G	6	6	2082369	2082374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_015954	CGA	2	6	2082387	2082392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_015954	ACC	2	6	2082410	2082415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_015954	AG	4	8	2082422	2082429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_015954	GAA	2	6	2082438	2082443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_015954	CCA	2	6	2082450	2082455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_015954	ACT	2	6	2082456	2082461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_015954	ACT	2	6	2082473	2082478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_015954	TGCC	2	8	2083874	2083881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_015954	GATT	2	8	2083944	2083951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_015954	G	6	6	2084825	2084830	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_015954	CGG	2	6	2084847	2084852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_015954	CGG	2	6	2084856	2084861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_015954	TGA	2	6	2084993	2084998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_015954	GTTTC	2	10	2085046	2085055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7047	NC_015954	AAC	2	6	2085450	2085455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_015954	TGA	2	6	2085822	2085827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_015954	CCA	2	6	2085840	2085845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_015954	CA	3	6	2086173	2086178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_015954	CGG	2	6	2087219	2087224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_015954	TC	3	6	2087228	2087233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_015954	GAAG	2	8	2087237	2087244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_015954	GCTC	2	8	2087286	2087293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_015954	GGGC	2	8	2087515	2087522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7056	NC_015954	ACCA	2	8	2087576	2087583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_015954	CAA	2	6	2087884	2087889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_015954	ACA	2	6	2087924	2087929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_015954	AGC	2	6	2088540	2088545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_015954	ACG	2	6	2089479	2089484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_015954	GTC	2	6	2089496	2089501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_015954	CGT	2	6	2089516	2089521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_015954	CGAG	2	8	2089528	2089535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7064	NC_015954	CGA	2	6	2089551	2089556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_015954	GCGCT	2	10	2090178	2090187	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7066	NC_015954	CGC	2	6	2090211	2090216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_015954	CAG	3	9	2090252	2090260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_015954	GCC	2	6	2090266	2090271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7069	NC_015954	GTGGCC	2	12	2090272	2090283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_015954	GTG	2	6	2090284	2090289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_015954	TGCG	2	8	2090371	2090378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7072	NC_015954	AAC	2	6	2090387	2090392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_015954	CCGG	2	8	2090405	2090412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_015954	TCC	2	6	2091545	2091550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_015954	GCC	2	6	2091560	2091565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_015954	GTC	2	6	2091598	2091603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_015954	CGC	2	6	2091639	2091644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_015954	CGA	3	9	2091651	2091659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_015954	AGCC	2	8	2091670	2091677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7080	NC_015954	TACC	2	8	2091739	2091746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_015954	CGC	2	6	2093128	2093133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7082	NC_015954	AAG	2	6	2095147	2095152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_015954	GC	3	6	2095157	2095162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7084	NC_015954	ACC	2	6	2102311	2102316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7085	NC_015954	AAC	2	6	2102335	2102340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_015954	ACC	2	6	2103050	2103055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_015954	CGA	2	6	2103130	2103135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_015954	CGT	2	6	2103141	2103146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_015954	TCCC	2	8	2103148	2103155	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7090	NC_015954	CTC	2	6	2103175	2103180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7091	NC_015954	TCG	2	6	2103197	2103202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_015954	GGA	2	6	2103246	2103251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_015954	CGG	3	9	2104299	2104307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_015954	CGGG	2	8	2104370	2104377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7095	NC_015954	CGAA	2	8	2105274	2105281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7096	NC_015954	GAAG	2	8	2105348	2105355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_015954	GA	3	6	2105362	2105367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_015954	AT	3	6	2106409	2106414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_015954	TCAG	2	8	2106494	2106501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7100	NC_015954	TGC	2	6	2106522	2106527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_015954	CGG	2	6	2106561	2106566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_015954	CCT	2	6	2106572	2106577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_015954	GC	3	6	2106645	2106650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_015954	TC	3	6	2107639	2107644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_015954	GAC	2	6	2109105	2109110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_015954	GCA	2	6	2109944	2109949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_015954	GCG	2	6	2110887	2110892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_015954	GCTC	2	8	2110901	2110908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_015954	GT	3	6	2110912	2110917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_015954	GTC	2	6	2110929	2110934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_015954	AGCC	2	8	2110936	2110943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_015954	GA	3	6	2110949	2110954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_015954	GAC	2	6	2110959	2110964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7116	NC_015954	CGG	2	6	2112883	2112888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_015954	GGA	2	6	2112919	2112924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7119	NC_015954	GTG	2	6	2112962	2112967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_015954	GATC	2	8	2113005	2113012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7121	NC_015954	CAA	2	6	2113025	2113030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_015954	TCAAT	2	10	2113043	2113052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7123	NC_015954	ATC	2	6	2113093	2113098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_015954	TAAC	2	8	2113151	2113158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7125	NC_015954	AAG	2	6	2113174	2113179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_015954	TC	3	6	2113280	2113285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7127	NC_015954	GCCG	2	8	2113406	2113413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7128	NC_015954	CG	3	6	2113420	2113425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7129	NC_015954	ACGG	2	8	2113557	2113564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7130	NC_015954	CGG	2	6	2113572	2113577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_015954	CGG	3	9	2113592	2113600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7132	NC_015954	GCC	2	6	2113604	2113609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7133	NC_015954	TCC	2	6	2115275	2115280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7135	NC_015954	CGC	2	6	2115296	2115301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7254	NC_015954	CATC	2	8	2132127	2132134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7255	NC_015954	TCG	2	6	2132157	2132162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7261	NC_015954	GTT	2	6	2132596	2132601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7264	NC_015954	AGTG	2	8	2134485	2134492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7381	NC_015954	AT	3	6	2166734	2166739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7382	NC_015954	AT	3	6	2166798	2166803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7383	NC_015954	AAAT	2	8	2166844	2166851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7384	NC_015954	TGGG	2	8	2166878	2166885	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7385	NC_015954	C	6	6	2166914	2166919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7386	NC_015954	GAGC	2	8	2167016	2167023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7387	NC_015954	AAG	2	6	2167039	2167044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7388	NC_015954	CGA	2	6	2167086	2167091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7499	NC_015954	CGAG	2	8	2202459	2202466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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