MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 9971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015954	CG	3	6	1347719	1347724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_015954	ATA	2	6	1347992	1347997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015954	CGGAC	2	10	1348057	1348066	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4504	NC_015954	CGA	3	9	1349179	1349187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_015954	CGA	2	6	1349218	1349223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015954	TTC	2	6	1349354	1349359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015954	CTC	2	6	1349360	1349365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_015954	CGA	2	6	1349381	1349386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015954	CGG	2	6	1349402	1349407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_015954	AT	3	6	1349418	1349423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015954	AGGC	2	8	1349433	1349440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_015954	GTT	2	6	1349462	1349467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015954	CTT	2	6	1349624	1349629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_015954	CGT	2	6	1350461	1350466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_015954	AG	3	6	1350520	1350525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015954	TGGC	2	8	1350880	1350887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_015954	CGA	2	6	1350988	1350993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_015954	CTT	2	6	1351072	1351077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_015954	TGGGT	2	10	1351867	1351876	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015954	ATC	2	6	1351891	1351896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015954	TCCG	2	8	1351931	1351938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_015954	CT	3	6	1351960	1351965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_015954	GGC	2	6	1352242	1352247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_015954	G	6	6	1352248	1352253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015954	TCG	2	6	1353014	1353019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015954	CGC	2	6	1353077	1353082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_015954	CGC	2	6	1353102	1353107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_015954	GC	3	6	1356415	1356420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_015954	CGAG	2	8	1357376	1357383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_015954	AGT	2	6	1358747	1358752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015954	AG	3	6	1360033	1360038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015954	AAACG	2	10	1362917	1362926	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4533	NC_015954	GCGG	2	8	1367293	1367300	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_015954	GGTG	2	8	1367313	1367320	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015954	CT	3	6	1367352	1367357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_015954	GGTTT	2	10	1367374	1367383	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015954	AGT	2	6	1367397	1367402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015954	AAATT	2	10	1367405	1367414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015954	TAC	2	6	1367416	1367421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_015954	AACC	2	8	1367558	1367565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_015954	GCG	2	6	1367604	1367609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015954	G	6	6	1367627	1367632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015954	CG	3	6	1367646	1367651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_015954	TGC	2	6	1367658	1367663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_015954	CGC	2	6	1367708	1367713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_015954	CGA	2	6	1367740	1367745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_015954	CG	3	6	1367767	1367772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_015954	CGA	3	9	1367827	1367835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_015954	AC	3	6	1367851	1367856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_015954	TGGC	2	8	1367865	1367872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_015954	CGA	2	6	1367878	1367883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_015954	GC	4	8	1367901	1367908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_015954	TGGG	2	8	1367964	1367971	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015954	CGC	2	6	1368013	1368018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_015954	TCG	2	6	1368027	1368032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015954	ACT	2	6	1368064	1368069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_015954	GCT	2	6	1368130	1368135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_015954	AC	3	6	1368183	1368188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_015954	CGC	2	6	1368223	1368228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_015954	AGT	2	6	1368232	1368237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015954	CGA	2	6	1368241	1368246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_015954	GGCA	2	8	1368285	1368292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_015954	GAGC	2	8	1368426	1368433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_015954	GCGA	2	8	1368437	1368444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_015954	GGA	2	6	1368454	1368459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015954	GATC	2	8	1368672	1368679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_015954	CTTAA	2	10	1368702	1368711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_015954	ACC	2	6	1368785	1368790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_015954	AAC	2	6	1368845	1368850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_015954	TCA	2	6	1368878	1368883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_015954	CGAG	2	8	1370297	1370304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_015954	CGA	2	6	1370367	1370372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_015954	TCG	2	6	1370442	1370447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_015954	CGA	2	6	1370520	1370525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_015954	GTG	2	6	1375041	1375046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4577	NC_015954	TTC	2	6	1375511	1375516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015954	CCGC	2	8	1376229	1376236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4579	NC_015954	TAGA	2	8	1376275	1376282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015954	AAGC	2	8	1376288	1376295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_015954	TAGTC	2	10	1376309	1376318	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4582	NC_015954	CCT	2	6	1376330	1376335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_015954	GGA	2	6	1376342	1376347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015954	CGG	2	6	1376351	1376356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_015954	CGG	2	6	1376382	1376387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_015954	GAC	2	6	1376396	1376401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015954	GCC	2	6	1376437	1376442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_015954	GGA	2	6	1376458	1376463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_015954	CT	3	6	1376530	1376535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_015954	TAT	2	6	1376566	1376571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015954	AG	3	6	1376589	1376594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015954	AGA	2	6	1376616	1376621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015954	CGAG	2	8	1376730	1376737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_015954	TCG	2	6	1377757	1377762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4596	NC_015954	AAG	2	6	1377887	1377892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_015954	CTC	2	6	1377924	1377929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_015954	ACC	2	6	1378015	1378020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_015954	ACAG	2	8	1378027	1378034	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_015954	GTC	2	6	1378109	1378114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_015954	GAGT	2	8	1378118	1378125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015954	AG	3	6	1378144	1378149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015954	AT	3	6	1378169	1378174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015954	ACG	2	6	1379859	1379864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_015954	CT	3	6	1379969	1379974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_015954	AATA	2	8	1379992	1379999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015954	ATCG	2	8	1380058	1380065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_015954	GT	3	6	1380066	1380071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015954	TG	4	8	1380093	1380100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015954	T	6	6	1384664	1384669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015954	GA	3	6	1385973	1385978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015954	AG	3	6	1386044	1386049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015954	AAT	2	6	1386070	1386075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015954	AGT	2	6	1386145	1386150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015954	ACC	2	6	1386264	1386269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_015954	ACA	2	6	1386303	1386308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_015954	GCC	2	6	1386319	1386324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_015954	TTC	2	6	1386345	1386350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_015954	GAC	2	6	1386355	1386360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_015954	GC	3	6	1386440	1386445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_015954	TGC	2	6	1386515	1386520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_015954	CCGAAG	2	12	1386536	1386547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_015954	TCGT	2	8	1386562	1386569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_015954	TGG	2	6	1386591	1386596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_015954	GACCAA	2	12	1386621	1386632	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_015954	CCG	2	6	1386668	1386673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_015954	GC	4	8	1386718	1386725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_015954	CGA	2	6	1386726	1386731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_015954	CGA	2	6	1386735	1386740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_015954	CGA	2	6	1386768	1386773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4633	NC_015954	GA	3	6	1386811	1386816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_015954	GTG	2	6	1386847	1386852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_015954	GTC	2	6	1447758	1447763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4887	NC_015954	GAC	2	6	1477499	1477504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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