MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 1191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015944	AC	3	6	362603	362608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_015944	ATTT	2	8	362631	362638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015944	TATT	2	8	362639	362646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015944	GTA	2	6	362670	362675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015944	TA	3	6	362711	362716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015944	GAA	2	6	362736	362741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015944	ACG	2	6	362749	362754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015944	TA	3	6	362833	362838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015944	GCA	2	6	362870	362875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015944	CTGA	2	8	363453	363460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_015944	C	6	6	363466	363471	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1012	NC_015944	AC	3	6	363689	363694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015944	CGT	2	6	363707	363712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015944	CTA	2	6	363742	363747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015944	TGT	2	6	363805	363810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015944	CTG	2	6	363946	363951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015944	TGA	2	6	363967	363972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015944	TAAGTT	2	12	363975	363986	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015944	TTAG	2	8	364012	364019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015944	A	6	6	364067	364072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015944	GA	3	6	364137	364142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015944	G	6	6	364188	364193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015944	CCA	2	6	364240	364245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_015944	AGC	2	6	364324	364329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015944	GTG	2	6	364375	364380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015944	AG	3	6	364438	364443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015944	GA	3	6	364481	364486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015944	TCC	2	6	364567	364572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_015944	TAT	2	6	364667	364672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015944	G	6	6	364674	364679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015944	GTAA	2	8	364698	364705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015944	ATG	2	6	364717	364722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015944	AG	3	6	364801	364806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015944	AC	3	6	364871	364876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_015944	GGC	2	6	364918	364923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015944	AAC	2	6	365131	365136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015944	TGG	2	6	365154	365159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015944	TAG	2	6	365185	365190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015944	ACG	2	6	365996	366001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015944	TA	3	6	366032	366037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015944	ACC	2	6	366180	366185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015944	TAG	3	9	366202	366210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015944	ATTG	2	8	366235	366242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015944	CTA	2	6	366540	366545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015944	AGA	2	6	366593	366598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015944	AGC	2	6	367451	367456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015944	AG	4	8	367478	367485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015944	AT	3	6	367491	367496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015944	CGA	2	6	367729	367734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015944	ACG	2	6	367762	367767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015944	TGC	2	6	367804	367809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015944	CTA	2	6	367855	367860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015944	AT	3	6	367911	367916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015944	AAG	2	6	367923	367928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015944	TGG	2	6	367966	367971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015944	AGT	2	6	368006	368011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015944	CT	3	6	368071	368076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015944	AT	3	6	368101	368106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015944	CCAG	2	8	368128	368135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015944	TAC	2	6	368171	368176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015944	CTA	2	6	368185	368190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015944	AACA	2	8	369432	369439	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_015944	GAA	2	6	369506	369511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015944	CA	3	6	369552	369557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_015944	ACG	2	6	369575	369580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015944	GACA	2	8	371096	371103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_015944	AATC	2	8	371109	371116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_015944	CTG	2	6	371734	371739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015944	CAA	2	6	371752	371757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015944	GTTT	2	8	371759	371766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015944	AGC	2	6	371850	371855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015944	GCT	2	6	371867	371872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015944	CCA	2	6	372020	372025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015944	CTG	2	6	372108	372113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015944	GTA	2	6	372140	372145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015944	AAC	2	6	372298	372303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015944	ACA	2	6	374505	374510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015944	ATA	2	6	375797	375802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015944	TGT	2	6	377152	377157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015944	CT	3	6	377160	377165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_015944	CTA	2	6	379658	379663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015944	CAA	2	6	379664	379669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015944	AC	3	6	379680	379685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_015944	A	6	6	379709	379714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015944	GACGG	2	10	379726	379735	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1086	NC_015944	CTG	2	6	380765	380770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015944	TTA	2	6	382563	382568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015944	ACC	2	6	382703	382708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_015944	T	6	6	384037	384042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015944	TGG	2	6	384080	384085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015944	CA	3	6	386002	386007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_015944	CCCT	2	8	386044	386051	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1093	NC_015944	TGAA	2	8	386155	386162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015944	CA	3	6	386255	386260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_015944	TAG	2	6	387446	387451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015944	GAC	2	6	387480	387485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015944	GT	3	6	387499	387504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015944	CCAT	2	8	387541	387548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_015944	GTT	2	6	387584	387589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015944	C	6	6	389481	389486	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1101	NC_015944	GAGTG	2	10	389494	389503	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015944	CCA	2	6	389638	389643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_015944	CT	3	6	389652	389657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_015944	TAC	2	6	389787	389792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_015944	ATT	2	6	391674	391679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015944	GCT	2	6	391686	391691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015944	AGGT	2	8	391744	391751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015944	ACC	2	6	391775	391780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_015944	TCG	2	6	391836	391841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015944	AC	3	6	391884	391889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_015944	TCGAA	2	10	391969	391978	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_015944	GA	4	8	391985	391992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015944	GTC	2	6	392215	392220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015944	ACG	2	6	392229	392234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015944	CGG	2	6	392258	392263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015944	CTT	2	6	392366	392371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015944	TTC	2	6	392509	392514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015944	CAA	2	6	392574	392579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015944	CT	3	6	392664	392669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015944	AC	4	8	392850	392857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_015944	TAT	2	6	392871	392876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015944	ACT	2	6	392930	392935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015944	CGG	2	6	392944	392949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015944	GCTG	2	8	393021	393028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_015944	G	6	6	393056	393061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015944	TG	3	6	393063	393068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015944	GCA	2	6	393098	393103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015944	CA	3	6	393102	393107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_015944	CG	3	6	393780	393785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_015944	TAC	2	6	395031	395036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015944	TGT	2	6	395093	395098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015944	CAA	2	6	395171	395176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015944	TACA	2	8	395239	395246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_015944	TA	3	6	395280	395285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015944	ATA	2	6	395357	395362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015944	T	6	6	395411	395416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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