MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 2066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015943	CA	3	6	474303	474308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_015943	GTA	2	6	475237	475242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_015943	AGCG	3	12	476720	476731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2004	NC_015943	G	6	6	476752	476757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_015943	TCC	2	6	477005	477010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_015943	CGGT	2	8	477046	477053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_015943	ATCGT	2	10	477072	477081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2008	NC_015943	CA	3	6	477123	477128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_015943	ACG	2	6	477140	477145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_015943	AAT	2	6	477175	477180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_015943	AG	3	6	478988	478993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_015943	TG	3	6	479038	479043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_015943	TCA	2	6	479047	479052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_015943	CGG	2	6	479060	479065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_015943	GAC	2	6	479079	479084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_015943	TGA	2	6	479133	479138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_015943	TCT	2	6	479144	479149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_015943	TGA	2	6	479169	479174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_015943	AAT	2	6	479213	479218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_015943	TA	3	6	484759	484764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_015943	ACC	2	6	484824	484829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_015943	CAG	2	6	484858	484863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_015943	GACCA	2	10	484940	484949	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2024	NC_015943	TGT	2	6	484958	484963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_015943	TTG	2	6	486460	486465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_015943	ACAG	2	8	486492	486499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2027	NC_015943	GCT	2	6	486519	486524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2028	NC_015943	CAT	2	6	486552	486557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_015943	ATG	2	6	486558	486563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_015943	CA	3	6	486628	486633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2031	NC_015943	AGA	2	6	486678	486683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_015943	CAT	2	6	486759	486764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_015943	ACT	2	6	486771	486776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_015943	AC	3	6	486791	486796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2035	NC_015943	ACC	2	6	486814	486819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2036	NC_015943	CAG	2	6	486823	486828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_015943	GTG	2	6	486853	486858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_015943	GCA	2	6	487744	487749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_015943	GCC	2	6	488064	488069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2040	NC_015943	ATG	2	6	488123	488128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_015943	AACA	2	8	488135	488142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_015943	TC	3	6	488172	488177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2043	NC_015943	GT	3	6	488190	488195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_015943	AAT	2	6	488202	488207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_015943	GGC	2	6	488288	488293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_015943	C	6	6	488344	488349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2047	NC_015943	TTG	2	6	488390	488395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_015943	C	6	6	488400	488405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2049	NC_015943	AGC	2	6	488429	488434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_015943	GAGCA	2	10	488464	488473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2051	NC_015943	TCA	2	6	488476	488481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_015943	GTA	2	6	488487	488492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_015943	AGTG	2	8	488519	488526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_015943	TC	3	6	488542	488547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2055	NC_015943	AGC	2	6	488564	488569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_015943	CTA	2	6	488597	488602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_015943	TTGT	2	8	488613	488620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_015943	GAC	2	6	488622	488627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_015943	AGA	2	6	488675	488680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_015943	C	6	6	488702	488707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2061	NC_015943	GAA	2	6	488737	488742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_015943	CTT	2	6	488756	488761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_015943	TCT	3	9	488834	488842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_015943	CT	3	6	488864	488869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_015943	CTC	2	6	488874	488879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2066	NC_015943	G	6	6	488904	488909	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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