MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 2066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015943	TAA	2	6	273679	273684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015943	TAA	2	6	273710	273715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015943	ACC	2	6	273762	273767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_015943	TTCT	2	8	273824	273831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_015943	CCA	2	6	273886	273891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_015943	TTC	2	6	273924	273929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_015943	ACG	2	6	273992	273997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_015943	GCT	3	9	275960	275968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015943	TA	4	8	277957	277964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015943	GT	3	6	277985	277990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015943	TAG	2	6	278003	278008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015943	GT	3	6	278055	278060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015943	T	6	6	278114	278119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015943	TAA	2	6	278129	278134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015943	GAG	2	6	278146	278151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015943	A	6	6	279635	279640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015943	CA	3	6	284110	284115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_015943	CGT	2	6	284129	284134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_015943	CTA	2	6	284164	284169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_015943	TTC	2	6	285122	285127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015943	TATT	2	8	285135	285142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015943	ACG	2	6	285305	285310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015943	GT	3	6	285323	285328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015943	GTTTA	2	10	285413	285422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015943	GGT	2	6	285464	285469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015943	TCG	2	6	285474	285479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_015943	TA	3	6	285529	285534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015943	AGT	2	6	285541	285546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015943	TTG	2	6	285584	285589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015943	TG	3	6	285677	285682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015943	TGT	2	6	285686	285691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015943	CTT	2	6	285725	285730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015943	ACT	2	6	285816	285821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_015943	GGT	2	6	285826	285831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015943	AGG	2	6	285844	285849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015943	AT	3	6	285865	285870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015943	AGAA	2	8	285899	285906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015943	GTC	2	6	285912	285917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_015943	CAA	2	6	286005	286010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_015943	CTCG	2	8	286043	286050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_015943	CAG	2	6	286053	286058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_015943	CAC	2	6	286087	286092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_015943	ACT	2	6	286102	286107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015943	ATT	2	6	286140	286145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015943	TTA	2	6	287037	287042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015943	GACG	2	8	287162	287169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_015943	TGGG	2	8	287215	287222	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015943	TCC	2	6	287308	287313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_015943	CTC	2	6	287381	287386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_015943	ACT	2	6	287439	287444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015943	CCCG	2	8	287478	287485	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1552	NC_015943	ACG	2	6	287535	287540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_015943	GA	3	6	288344	288349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015943	GAG	2	6	288376	288381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015943	TCC	2	6	290774	290779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_015943	A	6	6	290790	290795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015943	TTG	2	6	290806	290811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015943	TTTA	2	8	290825	290832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015943	GA	3	6	290889	290894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015943	ACA	2	6	290895	290900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015943	TTCG	2	8	291933	291940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_015943	G	6	6	291952	291957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015943	GCG	2	6	291967	291972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_015943	CAT	2	6	292231	292236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_015943	GGT	2	6	292247	292252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015943	TTCG	2	8	292271	292278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_015943	TCG	2	6	292300	292305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015943	ACT	2	6	292319	292324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_015943	TGTAG	2	10	292416	292425	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015943	TA	3	6	292427	292432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015943	AGC	2	6	292473	292478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015943	AAG	2	6	292500	292505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015943	GT	3	6	292524	292529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015943	GAC	2	6	292540	292545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_015943	CCG	2	6	292547	292552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_015943	GTT	2	6	292620	292625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015943	TGA	2	6	292645	292650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_015943	TTG	2	6	292675	292680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015943	ACA	2	6	292724	292729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015943	GCG	2	6	292762	292767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_015943	CGA	2	6	292810	292815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_015943	CTA	2	6	293280	293285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015943	TCC	2	6	293324	293329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_015943	G	6	6	294245	294250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015943	TG	3	6	294264	294269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015943	TGG	2	6	294299	294304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015943	TG	3	6	294323	294328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015943	ATT	2	6	294371	294376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015943	CA	3	6	294398	294403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_015943	TAT	2	6	296227	296232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015943	CAGT	2	8	296252	296259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_015943	CTG	2	6	296531	296536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_015943	TTG	2	6	296538	296543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015943	ATG	2	6	296575	296580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015943	CCAG	2	8	296668	296675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_015943	TG	3	6	296693	296698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015943	TGG	2	6	296718	296723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015943	A	6	6	296753	296758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015943	TGCC	2	8	296813	296820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_015943	GCA	2	6	296965	296970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_015943	AC	3	6	297013	297018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_015943	CTG	2	6	297027	297032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_015943	CTA	2	6	297066	297071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_015943	GCTT	2	8	297074	297081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_015943	T	6	6	297241	297246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015943	TC	3	6	297253	297258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_015943	GGT	2	6	297315	297320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015943	CAA	2	6	297382	297387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015943	TA	3	6	297732	297737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015943	ACA	2	6	297763	297768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_015943	A	6	6	297829	297834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015943	TA	3	6	297842	297847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015943	CAAA	2	8	297867	297874	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_015943	AT	3	6	297907	297912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015943	CGG	2	6	297937	297942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_015943	GAA	2	6	298057	298062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015943	GAG	2	6	298063	298068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015943	AC	3	6	298180	298185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_015943	CGT	2	6	298198	298203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015943	CTA	2	6	298233	298238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015943	GGGT	2	8	298281	298288	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015943	TCGTT	2	10	298304	298313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1623	NC_015943	GAT	2	6	303540	303545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015943	T	6	6	303547	303552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015943	ACC	2	6	303656	303661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_015943	GCAGG	2	10	303764	303773	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_015943	TTGT	2	8	303827	303834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015943	AGT	2	6	303857	303862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015943	AGC	2	6	303909	303914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_015943	AAGTA	2	10	303915	303924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015943	ATA	2	6	303960	303965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015943	CGA	2	6	303996	304001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_015943	AT	3	6	304033	304038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015943	GTTG	2	8	304087	304094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015943	GCA	2	6	304157	304162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_015943	AC	4	8	308213	308220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1637	NC_015943	ACA	2	6	308229	308234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1995	NC_015943	CT	4	8	473876	473883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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