MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 10138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015717	GTTT	2	8	1387020	1387027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015717	GA	3	6	1389455	1389460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015717	ACCGC	2	10	1391289	1391298	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3004	NC_015717	GTC	2	6	1391361	1391366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_015717	GTA	2	6	1391367	1391372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015717	GTT	2	6	1391382	1391387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015717	T	6	6	1391685	1391690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015717	CTG	2	6	1391699	1391704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015717	CGG	2	6	1391747	1391752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_015717	TGC	2	6	1391764	1391769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_015717	GTC	2	6	1391827	1391832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_015717	TTCG	2	8	1391958	1391965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_015717	CCA	2	6	1392017	1392022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_015717	TGC	2	6	1392047	1392052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_015717	GCAA	2	8	1392275	1392282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_015717	CTG	2	6	1392314	1392319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015717	CTT	2	6	1392347	1392352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015717	TTC	2	6	1392452	1392457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015717	CGA	2	6	1392476	1392481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015717	CGA	2	6	1397592	1397597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015717	TGC	2	6	1398092	1398097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_015717	GAT	2	6	1398109	1398114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015717	ATC	2	6	1398152	1398157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015717	TTC	2	6	1398170	1398175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_015717	TCA	2	6	1398202	1398207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015717	GCC	2	6	1398212	1398217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_015717	ACCG	2	8	1398280	1398287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_015717	ACA	2	6	1398580	1398585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015717	TCAG	2	8	1398627	1398634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_015717	TAT	2	6	1398732	1398737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015717	GAT	2	6	1398756	1398761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015717	TAC	2	6	1398762	1398767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015717	CATTG	2	10	1398771	1398780	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_015717	GC	3	6	1398820	1398825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_015717	CGA	2	6	1398831	1398836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015717	TCG	2	6	1398872	1398877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015717	G	6	6	1398877	1398882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015717	TCGA	2	8	1399178	1399185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_015717	GCC	2	6	1399206	1399211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_015717	T	6	6	1399221	1399226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015717	T	7	7	1399228	1399234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015717	AAG	2	6	1399316	1399321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015717	AGCGG	2	10	1399347	1399356	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_015717	AAG	3	9	1399429	1399437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015717	A	6	6	1400310	1400315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015717	GC	3	6	1400609	1400614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_015717	AACA	2	8	1401356	1401363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_015717	GCA	2	6	1401422	1401427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_015717	AAT	2	6	1401459	1401464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015717	AT	3	6	1401500	1401505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015717	ACT	2	6	1401567	1401572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015717	GTC	2	6	1401589	1401594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015717	AGC	2	6	1401595	1401600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_015717	GGCG	2	8	1401696	1401703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_015717	CGG	2	6	1403033	1403038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015717	CGCGA	2	10	1403053	1403062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3057	NC_015717	ATC	2	6	1403607	1403612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_015717	GC	3	6	1403676	1403681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_015717	GGA	2	6	1403686	1403691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015717	CGA	2	6	1403723	1403728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015717	CAA	2	6	1403731	1403736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_015717	AAT	2	6	1403850	1403855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015717	CCGG	2	8	1403882	1403889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_015717	CAG	2	6	1403897	1403902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015717	GC	3	6	1403934	1403939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_015717	CGT	2	6	1405699	1405704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015717	GGC	2	6	1406705	1406710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015717	TGC	2	6	1409032	1409037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_015717	GC	3	6	1409056	1409061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_015717	G	6	6	1409113	1409118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015717	T	6	6	1409135	1409140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015717	TGC	2	6	1409164	1409169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_015717	CAAAAT	2	12	1409211	1409222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3074	NC_015717	TGCG	2	8	1409230	1409237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_015717	AGCG	2	8	1409289	1409296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_015717	CGG	3	9	1409348	1409356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_015717	CTT	2	6	1409371	1409376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015717	GC	3	6	1409678	1409683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_015717	T	6	6	1409705	1409710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015717	TGA	2	6	1409811	1409816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015717	CTG	2	6	1409860	1409865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015717	GCT	2	6	1409894	1409899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015717	TTC	2	6	1409917	1409922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_015717	GCT	2	6	1411375	1411380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_015717	T	6	6	1411394	1411399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015717	AC	3	6	1411411	1411416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_015717	GCT	2	6	1411445	1411450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_015717	AC	3	6	1411468	1411473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_015717	GTT	2	6	1411976	1411981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015717	CGT	2	6	1412024	1412029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015717	ACGG	2	8	1414400	1414407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_015717	GCG	2	6	1414487	1414492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015717	ACATG	2	10	1414500	1414509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3094	NC_015717	CGA	2	6	1414581	1414586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_015717	TG	3	6	1414596	1414601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015717	CGAG	2	8	1414602	1414609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_015717	AG	3	6	1414608	1414613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015717	GTCGG	2	10	1414615	1414624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3099	NC_015717	AACGC	2	10	1414656	1414665	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3100	NC_015717	CGG	2	6	1414696	1414701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_015717	GCC	2	6	1414707	1414712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_015717	CAGCG	2	10	1421648	1421657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_015717	AAT	2	6	1421698	1421703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015717	GATGT	2	10	1421776	1421785	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015717	AT	3	6	1421830	1421835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015717	ATGCC	2	10	1422855	1422864	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3107	NC_015717	CTTTTT	2	12	1422933	1422944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3108	NC_015717	TGC	2	6	1423015	1423020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015717	GCG	2	6	1424696	1424701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015717	CAAT	2	8	1424709	1424716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_015717	GCG	2	6	1424755	1424760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015717	ATC	2	6	1424791	1424796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_015717	GC	3	6	1424827	1424832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_015717	AGC	2	6	1424837	1424842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_015717	AGA	2	6	1424858	1424863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015717	ACC	2	6	1424875	1424880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_015717	TGT	2	6	1425261	1425266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015717	CAA	2	6	1425274	1425279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_015717	AATC	2	8	1425280	1425287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_015717	CGG	2	6	1425359	1425364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015717	TC	3	6	1425443	1425448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_015717	CGGT	2	8	1425467	1425474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_015717	GC	3	6	1425834	1425839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_015717	CCG	2	6	1432575	1432580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_015717	T	7	7	1432631	1432637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015717	T	6	6	1432658	1432663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015717	CGG	2	6	1432677	1432682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_015717	GTCC	2	8	1432687	1432694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_015717	CATCTC	2	12	1435630	1435641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_015717	CAGCT	2	10	1435673	1435682	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3131	NC_015717	GT	3	6	1435732	1435737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_015717	CTG	2	6	1477665	1477670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3259	NC_015717	TGGGCG	2	12	1478551	1478562	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3261	NC_015717	GATG	2	8	1478601	1478608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_015717	CAT	2	6	1480148	1480153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_015717	GC	3	6	1480186	1480191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3264	NC_015717	GCA	2	6	1480259	1480264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3265	NC_015717	CTC	2	6	1480296	1480301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3266	NC_015717	TTG	2	6	1480331	1480336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_015717	GAT	2	6	1485833	1485838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_015717	CTTG	2	8	1487016	1487023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3269	NC_015717	AT	4	8	1487068	1487075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_015717	TGAA	2	8	1487128	1487135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_015717	GGCG	2	8	1487235	1487242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3272	NC_015717	TATCTT	2	12	1487292	1487303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3273	NC_015717	AACG	2	8	1488839	1488846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3276	NC_015717	G	6	6	1488977	1488982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3279	NC_015717	GCG	2	6	1489196	1489201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3280	NC_015717	GGA	2	6	1489251	1489256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_015717	TCTT	2	8	1490420	1490427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3282	NC_015717	CGG	2	6	1490445	1490450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3283	NC_015717	CGA	2	6	1493415	1493420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3285	NC_015717	TCT	3	9	1495512	1495520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3286	NC_015717	CGCT	2	8	1496652	1496659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3289	NC_015717	GCCC	2	8	1498924	1498931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3290	NC_015717	AG	3	6	1499011	1499016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3291	NC_015717	CGG	2	6	1499035	1499040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3292	NC_015717	GC	3	6	1499091	1499096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3293	NC_015717	TCT	2	6	1499099	1499104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3294	NC_015717	GAC	2	6	1499143	1499148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3300	NC_015717	GCCG	2	8	1502980	1502987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3301	NC_015717	ACAA	2	8	1503859	1503866	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3302	NC_015717	A	6	6	1503874	1503879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3303	NC_015717	GCA	2	6	1503886	1503891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3306	NC_015717	GC	3	6	1508267	1508272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3307	NC_015717	CGA	2	6	1508875	1508880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3354	NC_015717	CTG	2	6	1536365	1536370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3360	NC_015717	CTTT	2	8	1542986	1542993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3361	NC_015717	AAAG	2	8	1544034	1544041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_015717	TTCC	2	8	1544463	1544470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3371	NC_015717	CGAA	2	8	1546461	1546468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3372	NC_015717	CGC	2	6	1546510	1546515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3374	NC_015717	CCAG	2	8	1546564	1546571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3381	NC_015717	GCC	2	6	1546754	1546759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3382	NC_015717	GCA	2	6	1546762	1546767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3385	NC_015717	CGG	2	6	1546847	1546852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3386	NC_015717	TTTTC	2	10	1546876	1546885	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3387	NC_015717	T	6	6	1547839	1547844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3388	NC_015717	CT	3	6	1547879	1547884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3389	NC_015717	GCG	2	6	1547910	1547915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3390	NC_015717	CCG	2	6	1547936	1547941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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