MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 10138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015717	AAG	2	6	230910	230915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015717	GAT	3	9	231247	231255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015717	TCG	2	6	231267	231272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015717	CG	3	6	233040	233045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_015717	GA	3	6	233053	233058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015717	CG	3	6	234556	234561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015717	CTG	2	6	234592	234597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015717	CCA	2	6	237866	237871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_015717	GAT	2	6	237894	237899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015717	CGA	2	6	237922	237927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015717	TCT	2	6	238694	238699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015717	GATT	2	8	238704	238711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015717	AAT	2	6	238725	238730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015717	GC	3	6	238779	238784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_015717	AGTC	2	8	240567	240574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_015717	GA	4	8	242179	242186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015717	GCA	2	6	243539	243544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015717	CT	3	6	243564	243569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_015717	CAGTT	2	10	243577	243586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_015717	GAT	2	6	245129	245134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015717	CGA	2	6	245150	245155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015717	GAA	2	6	245204	245209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015717	CTT	2	6	245855	245860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015717	CGC	2	6	245955	245960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_015717	GGCG	2	8	245990	245997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
526	NC_015717	AAG	2	6	251458	251463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015717	CTT	2	6	253352	253357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015717	GA	3	6	253376	253381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015717	TA	3	6	254893	254898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015717	TGT	2	6	254905	254910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015717	GCG	2	6	254936	254941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015717	CCG	2	6	256409	256414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_015717	AG	3	6	256467	256472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015717	CCG	2	6	257092	257097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_015717	CGG	2	6	257106	257111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015717	T	6	6	257114	257119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015717	GCG	2	6	257130	257135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015717	TCGGC	2	10	258827	258836	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
539	NC_015717	G	6	6	258848	258853	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015717	TA	3	6	259529	259534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015717	AGC	2	6	259548	259553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015717	CGG	2	6	259594	259599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015717	ATG	2	6	259606	259611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015717	A	6	6	259637	259642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015717	GAC	2	6	259653	259658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015717	T	6	6	259663	259668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015717	GA	3	6	260808	260813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015717	TACA	2	8	260853	260860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_015717	GTTT	2	8	260869	260876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015717	GGC	2	6	260903	260908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015717	GTC	2	6	260958	260963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015717	TA	3	6	260998	261003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015717	TA	3	6	261005	261010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015717	TAT	2	6	261030	261035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015717	TGGC	2	8	264116	264123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_015717	CGG	2	6	268437	268442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015717	GGTGA	2	10	268453	268462	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015717	GAG	2	6	268463	268468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015717	GCG	3	9	268472	268480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015717	TAAT	2	8	270134	270141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015717	AT	3	6	270155	270160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015717	CGA	2	6	270287	270292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015717	AGGTAT	2	12	270752	270763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015717	CAG	2	6	270816	270821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015717	CCT	2	6	271478	271483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015717	ATA	2	6	271496	271501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015717	ATATA	2	10	271513	271522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015717	GGC	2	6	271524	271529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015717	TGC	2	6	272008	272013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015717	TCA	2	6	272039	272044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015717	CAT	2	6	272052	272057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015717	GGA	2	6	273414	273419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015717	TCG	2	6	273475	273480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015717	GCG	2	6	273605	273610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015717	CTT	2	6	273611	273616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015717	GCG	2	6	273650	273655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015717	GC	3	6	273931	273936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_015717	GGCG	2	8	276129	276136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
579	NC_015717	TCCCG	2	10	276162	276171	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
580	NC_015717	GAC	2	6	276813	276818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015717	CG	3	6	276883	276888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_015717	GA	3	6	277904	277909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015717	GT	3	6	277947	277952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015717	GCC	2	6	277986	277991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_015717	CTT	2	6	277993	277998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015717	GTC	2	6	278054	278059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015717	CAC	2	6	278177	278182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015717	CGG	2	6	278189	278194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015717	GA	3	6	278295	278300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015717	CGTC	2	8	278311	278318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_015717	GCT	2	6	278368	278373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015717	G	10	10	278411	278420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015717	TCGGA	2	10	278424	278433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
594	NC_015717	GCC	2	6	278450	278455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_015717	CCTT	2	8	278471	278478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_015717	GAT	2	6	278497	278502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015717	ATG	2	6	278534	278539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015717	GAA	2	6	278607	278612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015717	GAT	2	6	278631	278636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015717	GAT	2	6	278654	278659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015717	CGGA	2	8	278760	278767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_015717	GCA	2	6	278774	278779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015717	TTC	2	6	278797	278802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015717	GGCC	2	8	278804	278811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_015717	A	6	6	278819	278824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015717	GTC	2	6	278857	278862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015717	GCC	2	6	278905	278910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015717	AAGA	2	8	278911	278918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015717	GCGAGG	2	12	278923	278934	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
610	NC_015717	ATA	2	6	278935	278940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015717	AGG	2	6	278974	278979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015717	CGCA	2	8	279083	279090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_015717	CGA	2	6	279132	279137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015717	GCAATT	2	12	280147	280158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_015717	GC	3	6	283074	283079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_015717	CGC	2	6	283103	283108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_015717	AAGC	2	8	283138	283145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_015717	AGG	2	6	283152	283157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015717	GCG	2	6	283632	283637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015717	GC	3	6	285350	285355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_015717	TTC	2	6	285407	285412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015717	ATC	2	6	285928	285933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015717	TTCG	2	8	285937	285944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_015717	TGA	2	6	285949	285954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015717	GC	3	6	285959	285964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_015717	AGC	2	6	285970	285975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015717	CGA	2	6	286003	286008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015717	GAAA	2	8	286031	286038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015717	GGA	2	6	286045	286050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015717	TTC	2	6	286541	286546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015717	CGC	2	6	289385	289390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015717	TGG	2	6	289438	289443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015717	GCA	2	6	289542	289547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015717	GCT	2	6	289626	289631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015717	ACA	2	6	289632	289637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015717	GCTG	2	8	289645	289652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_015717	GAT	2	6	291258	291263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015717	CGG	2	6	291286	291291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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