MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 10138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015717	GCG	2	6	2213033	2213038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_015717	CGG	2	6	2213045	2213050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_015717	CCTC	2	8	2213106	2213113	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5004	NC_015717	CCCG	2	8	2213145	2213152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5005	NC_015717	AAT	2	6	2214302	2214307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015717	GAC	2	6	2215977	2215982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015717	GAC	2	6	2215997	2216002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015717	GGC	2	6	2216006	2216011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_015717	CCT	2	6	2222871	2222876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_015717	TCC	2	6	2226566	2226571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_015717	GAT	2	6	2226572	2226577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015717	TGC	2	6	2226579	2226584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_015717	ATC	2	6	2226622	2226627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015717	GGT	2	6	2227483	2227488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015717	CGT	2	6	2227570	2227575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_015717	CGG	2	6	2227579	2227584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_015717	ACG	2	6	2227588	2227593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015717	AATT	2	8	2227604	2227611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015717	GC	3	6	2227649	2227654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_015717	CGG	2	6	2230573	2230578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_015717	GGGGC	2	10	2233450	2233459	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5022	NC_015717	CAG	2	6	2233475	2233480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015717	CGG	2	6	2234551	2234556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_015717	CGC	2	6	2234569	2234574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_015717	GCCT	2	8	2236268	2236275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_015717	TGC	2	6	2236295	2236300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_015717	GC	3	6	2241562	2241567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_015717	AGGC	2	8	2243175	2243182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_015717	GCA	2	6	2243225	2243230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015717	CGC	2	6	2247429	2247434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_015717	CG	3	6	2247468	2247473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_015717	TGC	2	6	2247554	2247559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_015717	CGC	2	6	2248076	2248081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_015717	CCA	2	6	2248150	2248155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015717	TGC	2	6	2248186	2248191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_015717	TCCC	2	8	2250266	2250273	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5037	NC_015717	AG	3	6	2250298	2250303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015717	GTCC	2	8	2250695	2250702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_015717	CGA	2	6	2252050	2252055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_015717	TGA	2	6	2252163	2252168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015717	GTC	2	6	2256155	2256160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015717	TTG	2	6	2259403	2259408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015717	GCCG	2	8	2259434	2259441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_015717	CG	3	6	2259445	2259450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_015717	TGGT	2	8	2259915	2259922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015717	GCC	2	6	2259950	2259955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_015717	GCGCT	2	10	2259988	2259997	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5048	NC_015717	GAA	2	6	2261503	2261508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015717	GCC	2	6	2261554	2261559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_015717	CAA	2	6	2261589	2261594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015717	CGGC	2	8	2261607	2261614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_015717	G	6	6	2261664	2261669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015717	CGCA	2	8	2261682	2261689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_015717	CGGG	2	8	2261697	2261704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_015717	GAA	2	6	2261721	2261726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015717	CGA	2	6	2261788	2261793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_015717	GTT	2	6	2261873	2261878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015717	GGC	2	6	2261954	2261959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015717	GC	3	6	2261962	2261967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_015717	CGT	2	6	2263271	2263276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_015717	CGA	2	6	2263352	2263357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015717	CG	4	8	2264234	2264241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_015717	TGG	2	6	2264250	2264255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015717	GAAG	2	8	2264299	2264306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015717	CGCGT	2	10	2264345	2264354	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5066	NC_015717	CCA	2	6	2264410	2264415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_015717	CGA	2	6	2264427	2264432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015717	GC	3	6	2264439	2264444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_015717	CGT	2	6	2264505	2264510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_015717	CAT	2	6	2264570	2264575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015717	CGC	2	6	2264580	2264585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_015717	GC	3	6	2264587	2264592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_015717	GGT	2	6	2264601	2264606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015717	CGCGT	2	10	2264640	2264649	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5075	NC_015717	CT	3	6	2264673	2264678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_015717	CTT	2	6	2265055	2265060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015717	CCG	2	6	2265118	2265123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_015717	ACC	2	6	2265126	2265131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_015717	GCC	3	9	2265441	2265449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_015717	GCC	3	9	2265462	2265470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_015717	TGGT	2	8	2265492	2265499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015717	CGA	2	6	2265519	2265524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_015717	TCG	2	6	2265532	2265537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015717	GCCG	2	8	2265539	2265546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_015717	CGC	2	6	2265561	2265566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_015717	AGGA	2	8	2265589	2265596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015717	TCT	2	6	2266319	2266324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_015717	CAT	2	6	2266383	2266388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_015717	CCG	2	6	2266400	2266405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_015717	GCC	3	9	2266426	2266434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_015717	CG	3	6	2266452	2266457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_015717	CAT	2	6	2266506	2266511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015717	CG	3	6	2266522	2266527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_015717	TCG	2	6	2266532	2266537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_015717	GTG	2	6	2266538	2266543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015717	AGGA	2	8	2266544	2266551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_015717	CAA	2	6	2266907	2266912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015717	CGG	2	6	2269964	2269969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_015717	CAG	2	6	2269997	2270002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_015717	TCG	2	6	2270031	2270036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_015717	GGT	2	6	2270044	2270049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015717	ATG	2	6	2272072	2272077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015717	GCG	2	6	2272765	2272770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_015717	GC	3	6	2272773	2272778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_015717	CCCTCA	2	12	2273251	2273262	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_015717	GCG	2	6	2273336	2273341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015717	AGG	2	6	2273379	2273384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015717	GC	3	6	2274176	2274181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_015717	GC	3	6	2274554	2274559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_015717	CG	3	6	2274560	2274565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_015717	CCG	2	6	2274585	2274590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_015717	CGA	2	6	2274611	2274616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015717	GAT	2	6	2274635	2274640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015717	GGC	2	6	2274644	2274649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_015717	GCGA	2	8	2274730	2274737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_015717	GCA	2	6	2274805	2274810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_015717	GCA	2	6	2274835	2274840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_015717	GAC	2	6	2274916	2274921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_015717	CG	3	6	2274974	2274979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_015717	CG	3	6	2275001	2275006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_015717	TGT	2	6	2278784	2278789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015717	CG	3	6	2278808	2278813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_015717	CCG	2	6	2278874	2278879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_015717	CGC	2	6	2278884	2278889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_015717	ACG	2	6	2279503	2279508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015717	ACC	2	6	2279539	2279544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_015717	GAT	3	9	2279594	2279602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015717	GC	3	6	2279645	2279650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_015717	CTT	2	6	2280698	2280703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_015717	T	7	7	2280826	2280832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_015717	CGG	2	6	2280855	2280860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_015717	TCG	2	6	2280888	2280893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_015717	CTGT	2	8	2280966	2280973	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_015717	CAT	2	6	2281082	2281087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_015717	ACGCG	2	10	2281187	2281196	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5137	NC_015717	CCG	2	6	2281735	2281740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5138	NC_015717	CGA	2	6	2281755	2281760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_015717	CCG	2	6	2281764	2281769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5140	NC_015717	CGA	2	6	2281795	2281800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5142	NC_015717	GGC	2	6	2281958	2281963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5144	NC_015717	CGG	2	6	2284196	2284201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5148	NC_015717	TTCC	2	8	2284658	2284665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5152	NC_015717	A	6	6	2286625	2286630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_015717	ATG	2	6	2286701	2286706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5158	NC_015717	A	6	6	2288171	2288176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5161	NC_015717	CGTT	2	8	2288264	2288271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5162	NC_015717	GCC	2	6	2288351	2288356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5163	NC_015717	CGC	2	6	2288394	2288399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5165	NC_015717	G	6	6	2288496	2288501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_015717	AGA	2	6	2288522	2288527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5174	NC_015717	CGG	2	6	2291337	2291342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5175	NC_015717	GCCG	2	8	2291379	2291386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5176	NC_015717	CG	3	6	2291439	2291444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5179	NC_015717	CGAAT	2	10	2291515	2291524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5231	NC_015717	CGG	2	6	2320411	2320416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_015717	CGG	2	6	2320459	2320464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5240	NC_015717	AAAG	2	8	2324514	2324521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_015717	TCC	2	6	2324770	2324775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5242	NC_015717	CGA	2	6	2324894	2324899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5245	NC_015717	TTC	2	6	2325118	2325123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_015717	GAA	2	6	2325127	2325132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_015717	CGT	2	6	2325156	2325161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_015717	CGG	2	6	2325167	2325172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_015717	AGGG	2	8	2325216	2325223	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_015717	CG	3	6	2325672	2325677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5251	NC_015717	GTG	2	6	2325926	2325931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_015717	TTC	2	6	2326000	2326005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_015717	A	6	6	2326231	2326236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_015717	CTGG	2	8	2326244	2326251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5255	NC_015717	G	6	6	2326250	2326255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_015717	CT	3	6	2328185	2328190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5257	NC_015717	GAA	2	6	2328218	2328223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_015717	CG	4	8	2328240	2328247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_015717	CTG	2	6	2328332	2328337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_015717	ACC	2	6	2329302	2329307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_015717	GC	3	6	2329376	2329381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_015717	GCG	2	6	2329856	2329861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_015717	GAC	2	6	2329869	2329874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_015717	ATG	2	6	2329893	2329898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_015717	ACC	2	6	2331587	2331592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5271	NC_015717	CGC	2	6	2331628	2331633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5281	NC_015717	CTTGG	2	10	2332892	2332901	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5282	NC_015717	CTT	2	6	2332922	2332927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5283	NC_015717	CG	3	6	2332962	2332967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5284	NC_015717	T	6	6	2332993	2332998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_015717	GCTT	2	8	2336552	2336559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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