MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 10138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015717	CTT	2	6	1999463	1999468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_015717	CG	4	8	1999580	1999587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_015717	CTG	2	6	1999590	1999595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_015717	GC	3	6	1999627	1999632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_015717	ATC	2	6	1999635	1999640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015717	GTC	2	6	1999656	1999661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015717	CGA	2	6	1999688	1999693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_015717	CGG	2	6	1999694	1999699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015717	CGA	2	6	1999721	1999726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_015717	CAT	2	6	1999748	1999753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015717	TTC	2	6	1999762	1999767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_015717	TTG	2	6	1999783	1999788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015717	TCAG	2	8	1999789	1999796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_015717	GAA	2	6	1999833	1999838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015717	CGTG	2	8	1999890	1999897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_015717	CG	3	6	1999958	1999963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_015717	TTCG	2	8	1999995	2000002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_015717	TCT	2	6	2000060	2000065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_015717	ACA	2	6	2000075	2000080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_015717	ACG	2	6	2000089	2000094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015717	CG	3	6	2000100	2000105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_015717	GAT	2	6	2000138	2000143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015717	TCG	3	9	2000180	2000188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_015717	CAG	2	6	2000199	2000204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_015717	CGG	2	6	2000234	2000239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015717	CAA	2	6	2000240	2000245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015717	TCG	2	6	2000254	2000259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_015717	TGA	2	6	2000270	2000275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_015717	TCTT	2	8	2000305	2000312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_015717	GTT	2	6	2000370	2000375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015717	GAA	2	6	2000381	2000386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015717	CGA	2	6	2000393	2000398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_015717	CGG	3	9	2000453	2000461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_015717	TCT	2	6	2000486	2000491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_015717	TCA	2	6	2000531	2000536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015717	CG	4	8	2000537	2000544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_015717	CAC	2	6	2000550	2000555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_015717	CGA	2	6	2000594	2000599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_015717	CTT	2	6	2000663	2000668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_015717	TCTTTC	2	12	2000755	2000766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_015717	TTG	2	6	2000839	2000844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015717	CGG	2	6	2000876	2000881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015717	TAG	2	6	2000950	2000955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015717	CGC	2	6	2001023	2001028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_015717	TCT	2	6	2001050	2001055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_015717	GC	3	6	2001066	2001071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_015717	GAT	2	6	2001147	2001152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_015717	G	6	6	2001160	2001165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015717	TCA	2	6	2001247	2001252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_015717	GAC	3	9	2001261	2001269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015717	GC	3	6	2001294	2001299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_015717	CCTT	2	8	2001322	2001329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_015717	CTTGC	2	10	2001354	2001363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4554	NC_015717	GC	3	6	2001521	2001526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_015717	CTG	2	6	2001537	2001542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015717	GC	3	6	2001543	2001548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_015717	TGA	2	6	2001635	2001640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015717	TCA	2	6	2001665	2001670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_015717	AGA	2	6	2001694	2001699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015717	GCA	2	6	2002538	2002543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_015717	CCA	2	6	2002545	2002550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_015717	ACG	2	6	2002551	2002556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_015717	GCCA	2	8	2002572	2002579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_015717	CCG	2	6	2002786	2002791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_015717	CGGT	2	8	2002818	2002825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_015717	CGG	2	6	2002894	2002899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_015717	GAT	2	6	2002937	2002942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015717	CCG	2	6	2002950	2002955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_015717	TTG	2	6	2003028	2003033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015717	CAA	2	6	2003083	2003088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_015717	TCT	2	6	2003107	2003112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_015717	CCG	2	6	2003125	2003130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_015717	CG	3	6	2003129	2003134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_015717	GC	3	6	2003135	2003140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_015717	GAT	2	6	2003234	2003239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015717	GC	3	6	2003250	2003255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_015717	GAT	2	6	2003279	2003284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015717	CGC	2	6	2003353	2003358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_015717	CTG	2	6	2003384	2003389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_015717	ATC	2	6	2003391	2003396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_015717	GAT	2	6	2003414	2003419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015717	TCGC	2	8	2003430	2003437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_015717	TTG	2	6	2006231	2006236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015717	GAC	2	6	2006325	2006330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_015717	TCG	2	6	2007845	2007850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_015717	GCCG	2	8	2007852	2007859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_015717	GCCG	2	8	2010517	2010524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_015717	GC	3	6	2012418	2012423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_015717	TCAA	2	8	2014082	2014089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_015717	AC	3	6	2014107	2014112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_015717	GCG	2	6	2017467	2017472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_015717	TGGA	2	8	2017519	2017526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015717	ACG	2	6	2017527	2017532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_015717	TTC	2	6	2017599	2017604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_015717	GCG	2	6	2019692	2019697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_015717	TCC	2	6	2020333	2020338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_015717	T	6	6	2020343	2020348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015717	TGA	2	6	2020401	2020406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015717	AGC	2	6	2020425	2020430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015717	GAGC	2	8	2021493	2021500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_015717	GTC	2	6	2022706	2022711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_015717	TCG	2	6	2022740	2022745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015717	CGG	2	6	2022746	2022751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015717	GC	3	6	2022832	2022837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_015717	ACAT	2	8	2023333	2023340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_015717	CAA	2	6	2023432	2023437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015717	AAG	2	6	2023500	2023505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015717	GCG	2	6	2023508	2023513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_015717	TTA	2	6	2023537	2023542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015717	GC	3	6	2025568	2025573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_015717	GGCA	2	8	2025577	2025584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_015717	GCG	2	6	2025629	2025634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_015717	GAC	2	6	2025637	2025642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_015717	TGC	2	6	2027755	2027760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_015717	TTCG	2	8	2027772	2027779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_015717	CTA	2	6	2027780	2027785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_015717	CTT	2	6	2027807	2027812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_015717	GCG	2	6	2027861	2027866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_015717	GGA	2	6	2027924	2027929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015717	TCC	2	6	2029422	2029427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_015717	GCA	2	6	2030684	2030689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_015717	ATCGA	2	10	2030738	2030747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4623	NC_015717	AG	3	6	2031210	2031215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_015717	GCCG	2	8	2031857	2031864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_015717	ATT	2	6	2031871	2031876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015717	GCCG	2	8	2031908	2031915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_015717	CTTC	2	8	2032863	2032870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_015717	T	6	6	2032885	2032890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_015717	GCCG	2	8	2032919	2032926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_015717	ATGA	2	8	2033743	2033750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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