MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1

Total Repeats: 2596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015674	TCT	2	6	1668167	1668172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_015674	ACCA	2	8	1668247	1668254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_015674	ACT	2	6	1668258	1668263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_015674	TATG	2	8	1668264	1668271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015674	T	7	7	1668349	1668355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_015674	TG	3	6	1668541	1668546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015674	CGC	2	6	1668690	1668695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_015674	A	6	6	1668707	1668712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015674	TTGGGG	2	12	1669437	1669448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_015674	T	6	6	1669593	1669598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_015674	TGT	2	6	1669602	1669607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015674	CAC	3	9	1669675	1669683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_015674	A	10	10	1669753	1669762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_015674	CAC	2	6	1669844	1669849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_015674	AAC	2	6	1669887	1669892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_015674	GAA	2	6	1670348	1670353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015674	ACT	2	6	1672545	1672550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_015674	A	6	6	1672579	1672584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_015674	ATG	2	6	1672604	1672609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015674	GAGTG	2	10	1672831	1672840	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_015674	TCAA	2	8	1673151	1673158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_015674	GAT	2	6	1673240	1673245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_015674	GAA	2	6	1673272	1673277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015674	G	6	6	1673396	1673401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_015674	AGG	2	6	1673405	1673410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_015674	CTTG	2	8	1673458	1673465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_015674	ATTA	2	8	1673532	1673539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_015674	A	6	6	1673539	1673544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_015674	TAAA	2	8	1673589	1673596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_015674	ACC	2	6	1673656	1673661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_015674	TGGCG	2	10	1673694	1673703	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2532	NC_015674	TC	3	6	1673868	1673873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_015674	TCC	2	6	1673876	1673881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_015674	AT	3	6	1673899	1673904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_015674	CTT	2	6	1673998	1674003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_015674	TGA	2	6	1674105	1674110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_015674	GAAGC	2	10	1675197	1675206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2538	NC_015674	AGT	2	6	1675241	1675246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_015674	TCT	2	6	1675537	1675542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_015674	ACC	2	6	1675597	1675602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_015674	A	7	7	1675771	1675777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015674	TC	3	6	1675910	1675915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_015674	ATG	2	6	1675926	1675931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015674	TAA	2	6	1676075	1676080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015674	ACA	2	6	1676380	1676385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_015674	ATCTGT	2	12	1676412	1676423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2547	NC_015674	AAG	2	6	1676445	1676450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_015674	GT	3	6	1676511	1676516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_015674	GACA	2	8	1676559	1676566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_015674	T	7	7	1676708	1676714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_015674	GGA	2	6	1676717	1676722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_015674	TG	3	6	1676774	1676779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_015674	TGGC	2	8	1676840	1676847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2554	NC_015674	A	6	6	1676863	1676868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_015674	TA	3	6	1677258	1677263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_015674	ACC	2	6	1677306	1677311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2557	NC_015674	TGT	2	6	1677409	1677414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_015674	G	15	15	1677437	1677451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_015674	GTGC	2	8	1677544	1677551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2560	NC_015674	CTT	2	6	1677603	1677608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_015674	CTAG	2	8	1680986	1680993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2562	NC_015674	AG	3	6	1680992	1680997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_015674	AAGAT	2	10	1681012	1681021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_015674	CAT	2	6	1681088	1681093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_015674	A	6	6	1681118	1681123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_015674	C	6	6	1681296	1681301	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2567	NC_015674	GCCC	2	8	1681333	1681340	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2568	NC_015674	T	6	6	1682007	1682012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_015674	A	6	6	1682018	1682023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_015674	TGC	2	6	1682191	1682196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_015674	TGA	2	6	1687072	1687077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_015674	TC	3	6	1689177	1689182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_015674	CT	3	6	1693676	1693681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_015674	ATC	2	6	1693685	1693690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_015674	CAC	2	6	1693696	1693701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_015674	CAA	2	6	1695820	1695825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_015674	TGG	2	6	1703328	1703333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_015674	A	6	6	1703352	1703357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_015674	GGAT	2	8	1703361	1703368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_015674	TAA	2	6	1710599	1710604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_015674	CATG	2	8	1710700	1710707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_015674	A	6	6	1710708	1710713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_015674	ATC	2	6	1716079	1716084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_015674	AAG	2	6	1727695	1727700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_015674	A	6	6	1727712	1727717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_015674	GGT	3	9	1729463	1729471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_015674	AGG	2	6	1729588	1729593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015674	ATC	2	6	1732242	1732247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_015674	CAAG	2	8	1737998	1738005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_015674	TGG	2	6	1738054	1738059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_015674	CAAA	2	8	1753356	1753363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2592	NC_015674	TGG	2	6	1753460	1753465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_015674	A	6	6	1753591	1753596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_015674	TGC	2	6	1754893	1754898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_015674	TG	3	6	1754930	1754935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_015674	AC	3	6	1755262	1755267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.