MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015667	GAC	2	6	86783	86788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015667	ACT	2	6	86806	86811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015667	CAC	2	6	87576	87581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_015667	ACT	2	6	87632	87637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015667	GCTC	2	8	87690	87697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_015667	TCG	2	6	87715	87720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015667	GAT	2	6	87790	87795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015667	GTCC	2	8	87990	87997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015667	ACG	2	6	88075	88080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015667	GCG	2	6	88115	88120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015667	CT	3	6	88125	88130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_015667	GCG	2	6	88176	88181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015667	TC	3	6	89080	89085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_015667	CGA	2	6	89743	89748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015667	ACGA	2	8	89750	89757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_015667	ATCGT	2	10	89790	89799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
517	NC_015667	ACG	2	6	89826	89831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015667	GAC	2	6	89898	89903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015667	GAAC	2	8	89910	89917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_015667	CCT	2	6	89918	89923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_015667	CTC	2	6	89934	89939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015667	GC	3	6	90774	90779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_015667	CGG	3	9	90800	90808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015667	CGC	2	6	90848	90853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_015667	ACG	2	6	91767	91772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015667	GCG	2	6	93014	93019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015667	CG	3	6	93038	93043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_015667	GAC	2	6	94006	94011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015667	CGAG	2	8	94770	94777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
530	NC_015667	CTCG	2	8	94785	94792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_015667	TCC	2	6	95305	95310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_015667	CGA	2	6	95311	95316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015667	GT	3	6	95341	95346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015667	CT	3	6	95392	95397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_015667	AGA	2	6	95455	95460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015667	ACGG	2	8	95462	95469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_015667	AGC	2	6	95489	95494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015667	CCGT	2	8	95506	95513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015667	GGT	2	6	95518	95523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015667	ACG	2	6	96018	96023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015667	TCG	2	6	96134	96139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015667	GAC	2	6	96153	96158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015667	GGGA	2	8	96163	96170	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015667	GCT	2	6	96737	96742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015667	GAA	2	6	96746	96751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015667	CAT	2	6	97721	97726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015667	CGA	2	6	97728	97733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015667	GTC	2	6	97766	97771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015667	CG	3	6	98441	98446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015667	AAC	2	6	99053	99058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015667	CCT	2	6	99079	99084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_015667	CATCGA	2	12	99621	99632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015667	AGTC	2	8	99655	99662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_015667	A	6	6	99730	99735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015667	GGT	2	6	99804	99809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015667	CGA	2	6	101647	101652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015667	CTATT	2	10	101796	101805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
558	NC_015667	AC	3	6	103556	103561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015667	TCCG	2	8	103584	103591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_015667	CTCG	2	8	103595	103602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_015667	CGT	2	6	103605	103610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015667	GA	3	6	103646	103651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015667	TAT	2	6	104201	104206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015667	CGCGAC	2	12	105609	105620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
565	NC_015667	TC	3	6	105622	105627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_015667	TCAA	2	8	105696	105703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_015667	ACC	2	6	105743	105748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015667	GTG	2	6	105752	105757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015667	GA	3	6	105783	105788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015667	CAG	2	6	105861	105866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015667	GGAC	2	8	105885	105892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_015667	CAG	2	6	106892	106897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015667	CCT	2	6	107815	107820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_015667	GTCG	2	8	107845	107852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_015667	CGC	2	6	109138	109143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015667	ACG	2	6	109145	109150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015667	GGT	2	6	109154	109159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015667	CGG	2	6	109181	109186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015667	CGC	2	6	109196	109201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015667	GAAC	2	8	109244	109251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_015667	CGA	2	6	109267	109272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015667	GGA	2	6	109281	109286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015667	CGC	2	6	109334	109339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_015667	GAA	2	6	109347	109352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015667	CCG	2	6	109375	109380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_015667	TC	3	6	109434	109439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_015667	AGCA	2	8	109445	109452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_015667	CGG	2	6	109473	109478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015667	G	6	6	109506	109511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015667	CGT	2	6	109557	109562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015667	GAAA	2	8	109600	109607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015667	GTC	2	6	109619	109624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015667	GTC	2	6	109669	109674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015667	CGC	2	6	109692	109697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_015667	CCG	2	6	109715	109720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_015667	ATCG	2	8	110220	110227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_015667	CGG	2	6	110242	110247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015667	CGGG	2	8	110309	110316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
599	NC_015667	ATCA	2	8	111289	111296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_015667	CA	3	6	111295	111300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_015667	CGC	2	6	111309	111314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015667	TCA	3	9	111378	111386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015667	TCG	2	6	111391	111396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015667	TCG	2	6	112588	112593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015667	GAT	2	6	112615	112620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015667	GGC	2	6	112631	112636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015667	CG	3	6	112637	112642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_015667	CGA	2	6	112860	112865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015667	TGG	2	6	114011	114016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015667	CGCAG	2	10	114155	114164	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
611	NC_015667	CAG	2	6	114173	114178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015667	ACG	2	6	115195	115200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015667	GGT	2	6	116177	116182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015667	AGCG	2	8	116225	116232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
615	NC_015667	TCG	2	6	116234	116239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015667	CGA	2	6	116352	116357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015667	CAC	2	6	117058	117063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015667	TC	3	6	117069	117074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_015667	GAT	2	6	117101	117106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015667	TGA	2	6	117113	117118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015667	ATA	2	6	117269	117274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015667	TTA	2	6	117275	117280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015667	TCGA	2	8	117304	117311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_015667	AATT	2	8	117378	117385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015667	ATC	2	6	117436	117441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015667	TGC	2	6	117912	117917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015667	GAAC	2	8	118006	118013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
628	NC_015667	ACG	2	6	118044	118049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015667	CGA	2	6	118072	118077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015667	TCG	2	6	118080	118085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015667	TCG	2	6	118113	118118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015667	TCG	2	6	118125	118130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_015667	CGA	2	6	118131	118136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015667	CGG	2	6	118189	118194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015667	TCGA	2	8	118204	118211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_015667	TACA	2	8	118284	118291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_015667	A	6	6	118300	118305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015667	CGC	2	6	118822	118827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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