MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015666	CCG	2	6	1249899	1249904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_015666	ACGGG	2	10	1249949	1249958	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4003	NC_015666	CGG	2	6	1249994	1249999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_015666	TG	3	6	1250041	1250046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015666	AC	3	6	1252210	1252215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_015666	CGT	2	6	1252240	1252245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_015666	CGCGGT	2	12	1252276	1252287	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015666	GCG	2	6	1252292	1252297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015666	CGC	2	6	1252315	1252320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_015666	ACG	2	6	1253470	1253475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_015666	CGGG	2	8	1253504	1253511	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_015666	CGC	2	6	1253522	1253527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_015666	CGT	2	6	1253528	1253533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015666	CGCT	2	8	1254583	1254590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_015666	CGC	2	6	1254591	1254596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_015666	CGGC	2	8	1254603	1254610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_015666	GCCG	2	8	1254623	1254630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_015666	CCG	2	6	1254640	1254645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_015666	CGG	2	6	1255712	1255717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_015666	CGC	2	6	1255727	1255732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_015666	CACAG	2	10	1255760	1255769	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4022	NC_015666	GAC	2	6	1256516	1256521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015666	CCG	2	6	1256542	1256547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_015666	CGAA	2	8	1256574	1256581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_015666	GT	3	6	1256620	1256625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015666	GGGC	2	8	1256629	1256636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_015666	GAGACG	2	12	1256640	1256651	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4028	NC_015666	CGA	2	6	1256657	1256662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_015666	CGG	2	6	1256677	1256682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015666	TGT	2	6	1257473	1257478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015666	CGA	3	9	1257494	1257502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_015666	CGGCCG	2	12	1257573	1257584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_015666	TCG	2	6	1257585	1257590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015666	CG	3	6	1260455	1260460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_015666	CGG	2	6	1260524	1260529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_015666	CGG	2	6	1260533	1260538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_015666	GCA	2	6	1260553	1260558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015666	CGT	2	6	1260879	1260884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015666	TCGG	2	8	1260906	1260913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_015666	CGA	2	6	1264017	1264022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015666	GACG	2	8	1264044	1264051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_015666	AAG	2	6	1264052	1264057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015666	GAC	2	6	1264077	1264082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_015666	CCG	2	6	1264102	1264107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_015666	TCG	2	6	1264123	1264128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015666	CG	3	6	1264135	1264140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_015666	CTCGAG	2	12	1264141	1264152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015666	GAAGC	2	10	1264167	1264176	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_015666	GC	3	6	1264175	1264180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_015666	GTG	3	9	1264201	1264209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015666	TCCC	2	8	1264210	1264217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4052	NC_015666	ATC	2	6	1264220	1264225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_015666	CGG	2	6	1264640	1264645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015666	CGG	2	6	1264690	1264695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_015666	GCG	2	6	1264696	1264701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_015666	AG	3	6	1264729	1264734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015666	TTC	2	6	1264759	1264764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015666	GAGC	2	8	1264853	1264860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_015666	CTC	2	6	1264889	1264894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_015666	GAC	2	6	1264908	1264913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015666	GTT	2	6	1264937	1264942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015666	GTTC	2	8	1264968	1264975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_015666	AT	3	6	1265100	1265105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015666	TTAT	2	8	1265118	1265125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015666	TGT	2	6	1265766	1265771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015666	AGC	2	6	1265873	1265878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_015666	CGAGA	2	10	1265939	1265948	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_015666	TGG	2	6	1265980	1265985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015666	TCGCG	2	10	1267168	1267177	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4070	NC_015666	CGACG	2	10	1267178	1267187	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4071	NC_015666	GGT	2	6	1267494	1267499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015666	GT	3	6	1267511	1267516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015666	GCC	2	6	1267546	1267551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_015666	ACC	2	6	1267567	1267572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_015666	GC	3	6	1267597	1267602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_015666	TCG	2	6	1270297	1270302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015666	ACG	2	6	1271240	1271245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015666	TCGT	2	8	1271287	1271294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_015666	GCC	2	6	1271295	1271300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_015666	CGC	2	6	1271892	1271897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_015666	CAC	2	6	1271914	1271919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_015666	CGAG	2	8	1271943	1271950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_015666	CAG	3	9	1271959	1271967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015666	AAC	2	6	1271972	1271977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_015666	CCG	2	6	1272062	1272067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_015666	CGA	2	6	1272072	1272077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_015666	TTA	2	6	1272099	1272104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015666	CGG	2	6	1272698	1272703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015666	CTA	2	6	1272806	1272811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_015666	TCT	2	6	1272823	1272828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015666	TCC	2	6	1272858	1272863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_015666	TG	3	6	1273847	1273852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015666	CT	3	6	1273857	1273862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_015666	TC	3	6	1273869	1273874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_015666	ACGA	2	8	1273900	1273907	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_015666	C	7	7	1273915	1273921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4097	NC_015666	AAG	2	6	1273958	1273963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015666	ACT	2	6	1273975	1273980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_015666	CG	3	6	1275826	1275831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_015666	CCG	2	6	1275853	1275858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_015666	AACG	2	8	1275864	1275871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_015666	CGG	2	6	1275906	1275911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_015666	CGG	2	6	1275952	1275957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015666	CCGG	2	8	1277595	1277602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_015666	GAC	2	6	1277613	1277618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_015666	TCC	2	6	1277780	1277785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_015666	CAC	2	6	1277835	1277840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_015666	TC	3	6	1277881	1277886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_015666	CTC	2	6	1278935	1278940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_015666	GGC	2	6	1279014	1279019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_015666	TCG	2	6	1279035	1279040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_015666	CGA	2	6	1279101	1279106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015666	CCT	2	6	1279107	1279112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_015666	TCG	2	6	1279148	1279153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_015666	CTT	2	6	1279161	1279166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015666	CGTCCG	2	12	1279167	1279178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_015666	TCG	3	9	1279214	1279222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015666	TCA	2	6	1279285	1279290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015666	TCA	2	6	1279304	1279309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015666	CCGAA	2	10	1279340	1279349	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4121	NC_015666	CCGA	2	8	1279373	1279380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_015666	GCC	2	6	1279878	1279883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_015666	GGA	2	6	1279972	1279977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015666	GTCG	2	8	1279987	1279994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_015666	CTG	2	6	1280016	1280021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_015666	CCA	2	6	1281535	1281540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_015666	CGTC	2	8	1281544	1281551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_015666	CGG	2	6	1281556	1281561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_015666	CGAG	2	8	1282012	1282019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_015666	TAC	2	6	1282032	1282037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_015666	G	6	6	1282080	1282085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015666	CCT	2	6	1284039	1284044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_015666	TCGG	2	8	1284136	1284143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_015666	GCC	2	6	1284160	1284165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_015666	CGC	2	6	1284186	1284191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4137	NC_015666	CGC	2	6	1284275	1284280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4138	NC_015666	CTG	2	6	1284285	1284290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4140	NC_015666	GC	3	6	1284357	1284362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4141	NC_015666	CGT	2	6	1284468	1284473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_015666	GAT	2	6	1284507	1284512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_015666	CGG	2	6	1284540	1284545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_015666	TCG	2	6	1284638	1284643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_015666	TCG	2	6	1284713	1284718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4152	NC_015666	CAG	2	6	1285759	1285764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4161	NC_015666	GTC	2	6	1288542	1288547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4162	NC_015666	GAC	2	6	1288656	1288661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4171	NC_015666	CGG	2	6	1292638	1292643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4207	NC_015666	AGTGTG	2	12	1299980	1299991	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4214	NC_015666	GCTTG	2	10	1300617	1300626	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4215	NC_015666	GGAC	2	8	1300681	1300688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4216	NC_015666	CTGTG	2	10	1300822	1300831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4232	NC_015666	AGG	2	6	1301678	1301683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_015666	CAC	2	6	1301791	1301796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4235	NC_015666	CAGC	2	8	1301828	1301835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4236	NC_015666	GT	3	6	1301861	1301866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_015666	TGG	2	6	1301960	1301965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_015666	GAA	2	6	1302035	1302040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_015666	AAG	2	6	1302242	1302247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_015666	CTC	2	6	1302380	1302385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4242	NC_015666	ACG	2	6	1302477	1302482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_015666	AAG	2	6	1302530	1302535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_015666	CGT	2	6	1302554	1302559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4245	NC_015666	GT	3	6	1302584	1302589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_015666	GCA	2	6	1302646	1302651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_015666	GCC	2	6	1302660	1302665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4248	NC_015666	GAT	2	6	1302708	1302713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_015666	GAG	2	6	1302921	1302926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_015666	C	6	6	1302931	1302936	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4252	NC_015666	GGT	2	6	1303066	1303071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_015666	AGC	2	6	1303106	1303111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_015666	CCA	2	6	1303182	1303187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_015666	TAG	2	6	1303299	1303304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_015666	ACA	2	6	1303413	1303418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_015666	GCC	2	6	1303473	1303478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4258	NC_015666	CTG	2	6	1303480	1303485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4260	NC_015666	GGC	2	6	1303633	1303638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4264	NC_015666	GTA	2	6	1303906	1303911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4377	NC_015666	GCCG	2	8	1334660	1334667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4385	NC_015666	CGA	2	6	1334792	1334797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4386	NC_015666	CGG	2	6	1334798	1334803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4387	NC_015666	CGCT	2	8	1334827	1334834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4388	NC_015666	GC	3	6	1334920	1334925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4389	NC_015666	CGTC	2	8	1334948	1334955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4390	NC_015666	TCGG	2	8	1336202	1336209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4391	NC_015666	CGT	2	6	1336211	1336216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4392	NC_015666	TGG	2	6	1336291	1336296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_015666	ACT	2	6	1336324	1336329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4395	NC_015666	GAGT	2	8	1336379	1336386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4480	NC_015666	TGAGT	2	10	1362725	1362734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4491	NC_015666	CGAGC	2	10	1364713	1364722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4492	NC_015666	CGC	2	6	1365750	1365755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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