MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015666	ACG	2	6	956000	956005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_015666	TAC	2	6	956013	956018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015666	CCGTCT	2	12	957118	957129	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015666	CTT	2	6	958432	958437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_015666	CGC	2	6	959312	959317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_015666	TCG	2	6	960366	960371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015666	TCGC	2	8	961403	961410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_015666	CG	3	6	962520	962525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_015666	CGCTC	2	10	963285	963294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3010	NC_015666	AGC	2	6	964286	964291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_015666	TCT	2	6	964317	964322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_015666	CGG	2	6	964409	964414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015666	CCA	2	6	964430	964435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_015666	GA	3	6	965191	965196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015666	GC	3	6	965212	965217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_015666	CACAG	2	10	966047	966056	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3017	NC_015666	GTGGGG	2	12	966090	966101	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015666	TTC	2	6	966138	966143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015666	GATC	2	8	968344	968351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_015666	ATG	2	6	968378	968383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015666	TCG	2	6	968417	968422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_015666	GCG	2	6	968470	968475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_015666	ACT	2	6	968510	968515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015666	CTCA	2	8	968568	968575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_015666	GTT	2	6	968580	968585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015666	GAA	2	6	968590	968595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015666	ATG	2	6	968645	968650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015666	ACC	2	6	968660	968665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_015666	CGT	2	6	968679	968684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015666	GA	3	6	968693	968698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015666	CGC	2	6	968720	968725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_015666	CG	3	6	968767	968772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_015666	G	6	6	971228	971233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015666	CGG	2	6	971276	971281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_015666	GAA	2	6	971313	971318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015666	GTCG	2	8	971349	971356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_015666	CGT	2	6	971357	971362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015666	GAA	2	6	971472	971477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015666	ATG	2	6	971527	971532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015666	ACC	2	6	971542	971547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_015666	CGT	2	6	971561	971566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015666	GA	3	6	971575	971580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015666	TC	3	6	971684	971689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_015666	AAC	2	6	971707	971712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015666	GCA	2	6	971728	971733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015666	ATG	2	6	971786	971791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015666	ACC	2	6	971801	971806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_015666	TAT	2	6	971839	971844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015666	ATCG	2	8	971854	971861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_015666	TCCG	2	8	971899	971906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_015666	CGA	2	6	971994	971999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015666	ACC	2	6	972068	972073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_015666	GC	3	6	972075	972080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_015666	CAC	2	6	972133	972138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_015666	CGAAC	2	10	972199	972208	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_015666	GT	3	6	973659	973664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015666	GGT	2	6	973671	973676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015666	GTC	2	6	973731	973736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_015666	ACG	2	6	973746	973751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_015666	CGGTC	2	10	973753	973762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3061	NC_015666	ACG	2	6	973769	973774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_015666	CCT	2	6	973799	973804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_015666	CGT	2	6	973806	973811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015666	C	6	6	973814	973819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3065	NC_015666	TCGG	2	8	974681	974688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_015666	GTG	2	6	974743	974748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015666	GC	3	6	974825	974830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_015666	TC	3	6	974923	974928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_015666	CTG	2	6	974938	974943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_015666	AAT	3	9	974968	974976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015666	AGC	2	6	974993	974998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_015666	AAG	2	6	975012	975017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015666	CAA	2	6	975022	975027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_015666	GTA	2	6	975060	975065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015666	CGAT	2	8	975893	975900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_015666	AC	3	6	975956	975961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_015666	GGT	2	6	975986	975991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015666	GTGC	2	8	977017	977024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_015666	GACG	2	8	977544	977551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_015666	AGC	2	6	978573	978578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_015666	CCG	2	6	978596	978601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_015666	CGA	2	6	980753	980758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015666	GGA	2	6	980814	980819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015666	CCGA	2	8	981800	981807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_015666	TCGG	2	8	981860	981867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_015666	TTC	2	6	982407	982412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_015666	GACC	2	8	982419	982426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_015666	ACCG	2	8	982431	982438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_015666	GCC	2	6	982456	982461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_015666	TCG	2	6	982565	982570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015666	CGAA	2	8	982590	982597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_015666	GCAC	2	8	983869	983876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_015666	TCC	2	6	983915	983920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_015666	CAT	2	6	983954	983959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_015666	TGA	2	6	985583	985588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015666	CGGC	2	8	985863	985870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_015666	GC	3	6	985922	985927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_015666	ACCG	2	8	987282	987289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_015666	ACG	2	6	988280	988285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_015666	CGGGA	2	10	988622	988631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3102	NC_015666	GGC	2	6	991315	991320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015666	GGGT	2	8	991354	991361	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015666	GCC	2	6	992552	992557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_015666	CTGC	2	8	993993	994000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_015666	CGA	2	6	994013	994018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_015666	CGG	2	6	994043	994048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015666	ACA	2	6	994088	994093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015666	CGACG	2	10	994391	994400	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3110	NC_015666	CCG	2	6	994446	994451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_015666	CT	3	6	995346	995351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_015666	ATC	2	6	995409	995414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_015666	ACT	2	6	995421	995426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015666	CGTT	2	8	995457	995464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_015666	TGGT	2	8	995541	995548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015666	ACT	2	6	995572	995577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_015666	CGA	2	6	995929	995934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_015666	GTT	2	6	995966	995971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015666	CCCG	2	8	996718	996725	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3120	NC_015666	CGG	2	6	996739	996744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015666	GT	3	6	997883	997888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015666	CGA	2	6	998756	998761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015666	ACG	2	6	999683	999688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_015666	TA	3	6	999728	999733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015666	GA	3	6	999780	999785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015666	GGCG	2	8	1000095	1000102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_015666	CGG	2	6	1000132	1000137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_015666	GCG	2	6	1000138	1000143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015666	GCG	2	6	1000174	1000179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015666	CG	3	6	1000192	1000197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_015666	CCG	2	6	1000198	1000203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_015666	GTTCC	2	10	1000216	1000225	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3133	NC_015666	TGC	2	6	1000233	1000238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_015666	T	6	6	1000251	1000256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_015666	AACG	2	8	1001270	1001277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_015666	GC	3	6	1001299	1001304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3137	NC_015666	CTG	2	6	1002581	1002586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_015666	GCG	2	6	1003539	1003544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_015666	GTC	2	6	1003640	1003645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3142	NC_015666	GGC	2	6	1004445	1004450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_015666	TGG	2	6	1005234	1005239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_015666	CGGA	2	8	1005254	1005261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3145	NC_015666	CG	3	6	1006343	1006348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3146	NC_015666	A	6	6	1008483	1008488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_015666	CGTA	2	8	1008618	1008625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3154	NC_015666	CGC	2	6	1008680	1008685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3156	NC_015666	TGT	2	6	1012832	1012837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3166	NC_015666	CG	3	6	1015170	1015175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_015666	CCCGC	2	10	1015213	1015222	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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3225	NC_015666	CGAGA	2	10	1029290	1029299	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3243	NC_015666	CCGAT	2	10	1031732	1031741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3254	NC_015666	CGGC	2	8	1032941	1032948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3269	NC_015666	CGG	2	6	1033526	1033531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3270	NC_015666	TCG	2	6	1033615	1033620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_015666	TCG	2	6	1033624	1033629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3274	NC_015666	CTG	3	9	1033761	1033769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3380	NC_015666	GTC	2	6	1058484	1058489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3383	NC_015666	GTATTT	2	12	1058561	1058572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3389	NC_015666	T	6	6	1059284	1059289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_015666	AGC	2	6	1060551	1060556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3391	NC_015666	CG	3	6	1060837	1060842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3392	NC_015666	G	6	6	1060882	1060887	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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