MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015666	GGA	2	6	494683	494688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015666	CGG	2	6	494730	494735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015666	GACA	2	8	495053	495060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_015666	CAT	2	6	495072	495077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_015666	CGT	2	6	495097	495102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_015666	CT	3	6	495182	495187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_015666	GAGT	2	8	495208	495215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015666	ACG	2	6	495231	495236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015666	CA	3	6	495278	495283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_015666	CTG	2	6	495345	495350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015666	CCG	2	6	495367	495372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_015666	CGG	2	6	496006	496011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_015666	CGA	2	6	496027	496032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_015666	CGGG	2	8	496859	496866	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_015666	CGTC	2	8	496873	496880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_015666	GCG	3	9	496893	496901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015666	ACC	2	6	496906	496911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_015666	GAA	2	6	496943	496948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015666	CGA	2	6	496950	496955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_015666	CGG	2	6	497465	497470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015666	TGG	3	9	497471	497479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015666	CGG	2	6	497480	497485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015666	TCGG	2	8	497492	497499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_015666	GGT	2	6	497942	497947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015666	CGA	2	6	497954	497959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015666	GCGT	2	8	498011	498018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_015666	GCG	2	6	498047	498052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015666	CGA	2	6	499589	499594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_015666	AT	3	6	504041	504046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015666	CAT	2	6	504048	504053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_015666	TAA	2	6	504133	504138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015666	TCG	2	6	504197	504202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015666	GGT	2	6	504245	504250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015666	GAC	2	6	504278	504283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_015666	ACT	2	6	506535	506540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_015666	GA	3	6	506792	506797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015666	CGGGAA	2	12	506798	506809	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1538	NC_015666	GAAAC	2	10	506812	506821	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_015666	CGC	2	6	506844	506849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_015666	GCA	2	6	507885	507890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_015666	CGACG	2	10	507900	507909	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1542	NC_015666	CGCT	2	8	508439	508446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_015666	AGC	2	6	508449	508454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015666	GAACC	2	10	508488	508497	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1545	NC_015666	CCG	2	6	509193	509198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_015666	GCC	2	6	509220	509225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_015666	CG	3	6	509241	509246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_015666	GTCCG	2	10	509268	509277	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1549	NC_015666	CGG	2	6	509310	509315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_015666	GCG	2	6	509316	509321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015666	CGATC	2	10	509364	509373	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1552	NC_015666	GGT	2	6	509374	509379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015666	CGA	2	6	509480	509485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_015666	GCC	2	6	509495	509500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_015666	CGG	2	6	510348	510353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_015666	GCC	2	6	511169	511174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_015666	GCC	2	6	511176	511181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_015666	CGA	2	6	511207	511212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_015666	ACG	2	6	511223	511228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_015666	GAC	2	6	511307	511312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015666	TCG	2	6	512434	512439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_015666	TAC	2	6	515146	515151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_015666	GAG	2	6	515153	515158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015666	CCG	2	6	515184	515189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_015666	ATC	2	6	515200	515205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_015666	GGCC	2	8	515257	515264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_015666	CA	3	6	515283	515288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_015666	GCC	2	6	516524	516529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_015666	GC	3	6	516587	516592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_015666	CCG	2	6	517355	517360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_015666	GA	3	6	517365	517370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015666	GAACT	3	15	517378	517392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1573	NC_015666	TCCGC	2	10	518895	518904	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1574	NC_015666	CGA	2	6	518933	518938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_015666	CGC	2	6	518947	518952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_015666	GTCG	2	8	519794	519801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_015666	CGA	2	6	519811	519816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015666	GTGA	2	8	520601	520608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015666	GA	3	6	520620	520625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015666	AGCG	2	8	520669	520676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_015666	TAA	2	6	521059	521064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015666	GGT	2	6	521142	521147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015666	TACCG	2	10	522798	522807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1584	NC_015666	CGG	2	6	522879	522884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_015666	TCGG	2	8	522897	522904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_015666	GAG	2	6	522917	522922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015666	AACG	2	8	522953	522960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_015666	GTCG	2	8	523001	523008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_015666	GA	4	8	523837	523844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015666	CGGT	2	8	523866	523873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_015666	GAC	2	6	523877	523882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_015666	CCG	2	6	524538	524543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_015666	CCT	2	6	524587	524592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_015666	ACTG	2	8	526341	526348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_015666	CGG	2	6	526362	526367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_015666	CCGC	2	8	526381	526388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1597	NC_015666	T	6	6	528178	528183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015666	TCGAG	2	10	528206	528215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_015666	CGTCT	2	10	528220	528229	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1600	NC_015666	GCC	2	6	528232	528237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_015666	ACG	2	6	529197	529202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015666	AATCG	2	10	529244	529253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1603	NC_015666	ACCG	2	8	529261	529268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_015666	GGA	2	6	529296	529301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015666	GCG	2	6	530445	530450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_015666	CGT	2	6	530455	530460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_015666	CGA	2	6	530502	530507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_015666	CGC	2	6	532136	532141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_015666	CGCTCG	2	12	532165	532176	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_015666	GAC	2	6	532180	532185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_015666	CGG	2	6	532626	532631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015666	CGA	2	6	532669	532674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_015666	CG	3	6	533213	533218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_015666	CGG	3	9	533262	533270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_015666	CGGT	2	8	533277	533284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_015666	CAC	2	6	534753	534758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_015666	CGA	2	6	534794	534799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_015666	GCC	3	9	534837	534845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_015666	CGC	3	9	536424	536432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_015666	CGAA	2	8	536444	536451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_015666	CG	4	8	536464	536471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_015666	CGGT	2	8	537398	537405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_015666	GA	3	6	537413	537418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015666	CCG	2	6	537523	537528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_015666	CCG	2	6	537547	537552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_015666	GCC	2	6	540410	540415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_015666	CGAG	2	8	540450	540457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_015666	GAAA	2	8	540460	540467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015666	AGCG	2	8	540472	540479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_015666	ACGTG	2	10	543707	543716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_015666	AGGG	2	8	543771	543778	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015666	CGC	2	6	543785	543790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_015666	GCG	2	6	543801	543806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_015666	GAG	2	6	543818	543823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015666	CGT	2	6	543827	543832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1905	NC_015666	CCG	2	6	617133	617138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1906	NC_015666	TTC	2	6	617217	617222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1907	NC_015666	CCG	2	6	617230	617235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1908	NC_015666	CAC	2	6	617897	617902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1910	NC_015666	TCG	2	6	619470	619475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1927	NC_015666	GAG	2	6	625091	625096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1946	NC_015666	CGGT	2	8	630616	630623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1947	NC_015666	CTGCC	2	10	630650	630659	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2000	NC_015666	CATC	2	8	643369	643376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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