MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015666	CCG	2	6	352136	352141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_015666	CGGTCG	2	12	352149	352160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015666	TCG	2	6	352164	352169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015666	TCG	2	6	352201	352206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015666	CT	3	6	352236	352241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_015666	AT	3	6	354515	354520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015666	GAAC	2	8	354543	354550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_015666	AAT	2	6	356157	356162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015666	AAC	2	6	356207	356212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015666	ACG	2	6	356222	356227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015666	CGA	2	6	356320	356325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015666	CGT	2	6	356342	356347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015666	GGA	2	6	359761	359766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015666	GCCGA	2	10	359844	359853	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_015666	CGC	2	6	359877	359882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_015666	CGTC	2	8	359912	359919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_015666	TAT	2	6	360346	360351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015666	CCG	2	6	360885	360890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_015666	GTGGTT	2	12	362221	362232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015666	CGTGGT	2	12	362238	362249	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1021	NC_015666	GCC	2	6	362299	362304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_015666	CGG	2	6	363037	363042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015666	TC	3	6	363902	363907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_015666	CGG	2	6	363910	363915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015666	GTC	2	6	364365	364370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015666	CGG	2	6	364375	364380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015666	GAC	2	6	364865	364870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015666	GC	3	6	364913	364918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_015666	GT	3	6	364929	364934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015666	GTA	2	6	365660	365665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015666	GCC	2	6	365702	365707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_015666	GTT	2	6	365781	365786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015666	CGA	2	6	367441	367446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015666	CCG	2	6	367480	367485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_015666	CAC	2	6	367515	367520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015666	CAA	2	6	367523	367528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015666	TCAA	2	8	372315	372322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_015666	ACC	2	6	372376	372381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_015666	TAC	2	6	372806	372811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015666	CTTCT	2	10	372839	372848	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_015666	ACG	2	6	372983	372988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015666	TCGAA	2	10	372993	373002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_015666	CCG	2	6	373027	373032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015666	CGG	2	6	373986	373991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015666	CGCAAC	2	12	374013	374024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_015666	CCG	2	6	374030	374035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_015666	CGA	2	6	374472	374477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015666	GCAG	2	8	374494	374501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_015666	CA	3	6	374513	374518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015666	CGG	2	6	374595	374600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015666	GCG	2	6	374697	374702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015666	GTGCGG	2	12	374710	374721	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1053	NC_015666	T	6	6	377029	377034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015666	T	6	6	377143	377148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015666	CGG	2	6	378614	378619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015666	GAG	2	6	378688	378693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015666	AAAT	2	8	378720	378727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015666	GCC	2	6	379605	379610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_015666	GCT	2	6	379671	379676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015666	CTG	2	6	379758	379763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015666	TAC	2	6	379786	379791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015666	ACGAG	2	10	379800	379809	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_015666	TCG	2	6	379894	379899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015666	CGA	2	6	379926	379931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015666	GAT	2	6	380037	380042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015666	GAA	2	6	380043	380048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015666	ATC	2	6	380074	380079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015666	AGCG	2	8	380247	380254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_015666	ACG	2	6	380273	380278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015666	TCGAA	2	10	380328	380337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_015666	CTAG	2	8	380377	380384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_015666	A	6	6	380410	380415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015666	TGA	2	6	381088	381093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015666	GCC	2	6	381166	381171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_015666	TCG	2	6	381174	381179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015666	GCT	2	6	381234	381239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015666	TCCC	2	8	381352	381359	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1078	NC_015666	CGTT	2	8	381385	381392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_015666	ACG	2	6	381709	381714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015666	ACG	3	9	381780	381788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015666	ACG	2	6	381804	381809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015666	TCG	2	6	383338	383343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015666	T	6	6	383378	383383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015666	CCGT	2	8	383385	383392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_015666	CG	3	6	383407	383412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_015666	AGCG	2	8	383425	383432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_015666	GAT	2	6	383438	383443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015666	ACG	2	6	383463	383468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015666	CG	3	6	383495	383500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_015666	CG	3	6	383502	383507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_015666	A	6	6	383517	383522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015666	TCG	2	6	383542	383547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_015666	GCG	2	6	383940	383945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_015666	GCG	2	6	384189	384194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_015666	CCGT	2	8	384211	384218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_015666	GAG	2	6	384977	384982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015666	GAG	2	6	384995	385000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015666	GCGGA	2	10	385005	385014	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_015666	ACGTGT	2	12	385805	385816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1100	NC_015666	CGA	2	6	385858	385863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015666	CGG	2	6	385864	385869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015666	GCG	2	6	385879	385884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015666	G	6	6	385897	385902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015666	ACGCC	2	10	386722	386731	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1105	NC_015666	CCG	2	6	386747	386752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_015666	TGC	2	6	388683	388688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015666	GCG	2	6	388702	388707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015666	CAC	2	6	389065	389070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_015666	GCAC	2	8	389082	389089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_015666	GCT	2	6	389091	389096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015666	ACCG	2	8	389111	389118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_015666	CCG	2	6	390832	390837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_015666	GCT	2	6	391740	391745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015666	GC	3	6	391753	391758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_015666	TCT	2	6	391759	391764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015666	GACCGA	2	12	391789	391800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015666	TCG	2	6	391811	391816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015666	CCA	2	6	391842	391847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015666	GA	3	6	392887	392892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015666	AG	3	6	392895	392900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015666	AGT	2	6	392954	392959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015666	GC	3	6	393005	393010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_015666	TTG	2	6	393040	393045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015666	CTC	2	6	393056	393061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_015666	GTC	2	6	393082	393087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015666	CCT	2	6	393120	393125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_015666	AGG	2	6	393134	393139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015666	ACC	2	6	393157	393162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_015666	CGT	2	6	393201	393206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_015666	ACT	2	6	397386	397391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015666	CGAA	2	8	397457	397464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_015666	GAC	2	6	397470	397475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015666	TGC	2	6	397699	397704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015666	GACA	2	8	397731	397738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1401	NC_015666	CGAA	2	8	451320	451327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1402	NC_015666	CGG	2	6	451330	451335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_015666	CG	3	6	451346	451351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1404	NC_015666	CCACGA	2	12	451382	451393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_015666	CGT	2	6	451401	451406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_015666	GGTC	2	8	451409	451416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1407	NC_015666	TCCA	2	8	451465	451472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1408	NC_015666	ACATAG	2	12	451482	451493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1410	NC_015666	CGT	2	6	454486	454491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_015666	CCG	2	6	454853	454858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1421	NC_015666	ACG	2	6	455731	455736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_015666	GCGG	2	8	458288	458295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1425	NC_015666	CGA	2	6	464934	464939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_015666	GTC	2	6	465924	465929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_015666	AGC	2	6	466016	466021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_015666	ACG	2	6	466057	466062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_015666	TA	3	6	467736	467741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_015666	GCGGGC	2	12	469203	469214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_015666	TTGC	2	8	469248	469255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1433	NC_015666	CGT	2	6	469301	469306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_015666	CTT	3	9	469340	469348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_015666	CG	3	6	469350	469355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_015666	CGG	2	6	469366	469371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_015666	CGC	2	6	469417	469422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_015666	CGG	2	6	469436	469441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_015666	CGC	2	6	469490	469495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_015666	CCTCG	2	10	472803	472812	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1443	NC_015666	CGAA	2	8	472843	472850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1444	NC_015666	GAGC	2	8	472853	472860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_015666	CGA	2	6	472865	472870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1448	NC_015666	CGA	2	6	472972	472977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_015666	AC	3	6	473310	473315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_015666	AGG	2	6	473322	473327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_015666	GCG	2	6	473340	473345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1472	NC_015666	CCG	2	6	482027	482032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1477	NC_015666	ACCG	2	8	482655	482662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1483	NC_015666	GTC	2	6	483639	483644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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