MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015666	TCC	2	6	3361089	3361094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_015666	CGAT	2	8	3361121	3361128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10503	NC_015666	TTTC	2	8	3361137	3361144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10504	NC_015666	ACC	2	6	3361166	3361171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_015666	CCA	2	6	3361203	3361208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_015666	CGA	2	6	3361969	3361974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_015666	CGAG	2	8	3361986	3361993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10508	NC_015666	TC	3	6	3362659	3362664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10509	NC_015666	GTGA	2	8	3362741	3362748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_015666	CTCG	2	8	3362764	3362771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10511	NC_015666	GTCG	2	8	3362848	3362855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10512	NC_015666	GCGG	2	8	3362859	3362866	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10513	NC_015666	CGG	2	6	3362876	3362881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_015666	GCCG	2	8	3364173	3364180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10515	NC_015666	TTA	2	6	3364186	3364191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_015666	GAA	2	6	3364192	3364197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_015666	CTG	2	6	3364336	3364341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_015666	GTCCT	2	10	3364407	3364416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10519	NC_015666	CAG	2	6	3365114	3365119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_015666	CGAG	2	8	3365123	3365130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10521	NC_015666	CGGA	2	8	3365131	3365138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10522	NC_015666	ACG	2	6	3365139	3365144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_015666	CGAC	2	8	3365770	3365777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10524	NC_015666	GTG	2	6	3365785	3365790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10526	NC_015666	GCG	2	6	3365875	3365880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10531	NC_015666	CCG	2	6	3369760	3369765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_015666	TCT	2	6	3370312	3370317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10536	NC_015666	GTG	2	6	3375527	3375532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_015666	TA	3	6	3375588	3375593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10539	NC_015666	CAC	2	6	3377248	3377253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10541	NC_015666	CGG	2	6	3377755	3377760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_015666	CGGC	2	8	3378729	3378736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10543	NC_015666	CCG	2	6	3378737	3378742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10544	NC_015666	CCA	2	6	3379461	3379466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_015666	TCC	2	6	3379476	3379481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10546	NC_015666	AG	3	6	3383293	3383298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_015666	GAAC	2	8	3383307	3383314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10548	NC_015666	TCG	2	6	3384334	3384339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10551	NC_015666	GCCC	2	8	3384447	3384454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10552	NC_015666	GGA	2	6	3385186	3385191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10557	NC_015666	GGGGTC	2	12	3385722	3385733	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10558	NC_015666	CCG	2	6	3385774	3385779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_015666	GACT	2	8	3386651	3386658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10560	NC_015666	TTTC	2	8	3386659	3386666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10561	NC_015666	TCGA	2	8	3386676	3386683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10562	NC_015666	TCGC	2	8	3387456	3387463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10563	NC_015666	CGG	2	6	3387467	3387472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_015666	GTACG	2	10	3387508	3387517	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10565	NC_015666	GCG	2	6	3387528	3387533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_015666	TCGA	2	8	3388013	3388020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10567	NC_015666	GTC	2	6	3388030	3388035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10569	NC_015666	CCG	2	6	3388098	3388103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10570	NC_015666	GCGG	2	8	3388890	3388897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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10572	NC_015666	GAG	2	6	3388913	3388918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10574	NC_015666	T	6	6	3389003	3389008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_015666	GC	3	6	3389021	3389026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10579	NC_015666	CCCG	2	8	3389557	3389564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10580	NC_015666	AACG	2	8	3389565	3389572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10584	NC_015666	GAG	2	6	3391447	3391452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_015666	TCGT	2	8	3391691	3391698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10591	NC_015666	GC	5	10	3391833	3391842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_015666	GCC	2	6	3393643	3393648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10593	NC_015666	GCCG	2	8	3393665	3393672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10595	NC_015666	ATAGCT	2	12	3393699	3393710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10597	NC_015666	CT	3	6	3393737	3393742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10598	NC_015666	ACG	2	6	3394608	3394613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10601	NC_015666	GCGCG	2	10	3394687	3394696	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10602	NC_015666	CGTTC	2	10	3394710	3394719	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10603	NC_015666	CGG	2	6	3394769	3394774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_015666	GACCG	2	10	3397177	3397186	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10605	NC_015666	TAA	2	6	3397283	3397288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_015666	ATA	2	6	3397297	3397302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_015666	CGA	2	6	3397586	3397591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_015666	GTC	2	6	3397641	3397646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_015666	CTG	2	6	3397654	3397659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10610	NC_015666	CAG	2	6	3400090	3400095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_015666	CGAA	2	8	3401020	3401027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_015666	CGGC	2	8	3401058	3401065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10613	NC_015666	GCG	2	6	3401124	3401129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_015666	CGA	2	6	3401613	3401618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_015666	GGA	3	9	3401637	3401645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_015666	GAC	2	6	3401663	3401668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_015666	AC	3	6	3402095	3402100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_015666	TCC	2	6	3402122	3402127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10620	NC_015666	GATCC	2	10	3402171	3402180	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10621	NC_015666	CGC	2	6	3402181	3402186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_015666	GGCT	2	8	3402208	3402215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10623	NC_015666	A	6	6	3408350	3408355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_015666	TATATT	2	12	3408370	3408381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10626	NC_015666	GTT	2	6	3408404	3408409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_015666	TCG	2	6	3408421	3408426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10629	NC_015666	ATCG	2	8	3408473	3408480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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