MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015666	GCC	2	6	2995549	2995554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9502	NC_015666	CG	3	6	2995616	2995621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9503	NC_015666	ACGCA	2	10	2995641	2995650	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9504	NC_015666	CCGTC	2	10	2996214	2996223	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9505	NC_015666	GCC	2	6	2996257	2996262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9506	NC_015666	TGT	2	6	2997249	2997254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_015666	GACGGC	2	12	2997257	2997268	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_015666	CGG	2	6	2997302	2997307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_015666	ATC	2	6	2997352	2997357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_015666	TTA	2	6	2997372	2997377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_015666	CGA	2	6	2998869	2998874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9512	NC_015666	CTTC	2	8	3000484	3000491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9513	NC_015666	CCGT	2	8	3000497	3000504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9514	NC_015666	GCTCG	2	10	3000553	3000562	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9515	NC_015666	GCTC	2	8	3000604	3000611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9516	NC_015666	CGAA	2	8	3000679	3000686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9517	NC_015666	TCGT	2	8	3000732	3000739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9518	NC_015666	TC	3	6	3000754	3000759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9519	NC_015666	GCG	2	6	3001437	3001442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9520	NC_015666	CGAC	2	8	3001473	3001480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9521	NC_015666	TCGG	2	8	3001557	3001564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9522	NC_015666	GCT	2	6	3002367	3002372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_015666	CGA	2	6	3003523	3003528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9524	NC_015666	CGA	2	6	3003532	3003537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9525	NC_015666	GCG	2	6	3003545	3003550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9526	NC_015666	GAC	2	6	3003570	3003575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_015666	GAGGTT	2	12	3003659	3003670	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_015666	CGGG	2	8	3004340	3004347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9529	NC_015666	TCG	2	6	3004367	3004372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_015666	CCGAA	2	10	3004380	3004389	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9531	NC_015666	GCC	2	6	3004418	3004423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9532	NC_015666	TGGTCG	2	12	3004440	3004451	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9533	NC_015666	GCG	2	6	3004517	3004522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_015666	GGT	2	6	3004540	3004545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_015666	GAA	3	9	3005150	3005158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_015666	GC	3	6	3007826	3007831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9537	NC_015666	CG	3	6	3007836	3007841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9538	NC_015666	CG	3	6	3007851	3007856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9539	NC_015666	GT	3	6	3007865	3007870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_015666	TCC	2	6	3011717	3011722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9541	NC_015666	CCG	2	6	3011779	3011784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9542	NC_015666	GTG	2	6	3011823	3011828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_015666	GCC	2	6	3013427	3013432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9544	NC_015666	CGG	2	6	3013440	3013445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9545	NC_015666	GAC	2	6	3013446	3013451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9546	NC_015666	CGC	2	6	3013458	3013463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9547	NC_015666	CGG	2	6	3013477	3013482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9548	NC_015666	CGT	2	6	3013919	3013924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_015666	ACG	2	6	3013925	3013930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9550	NC_015666	GGAC	2	8	3013966	3013973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9551	NC_015666	CCGC	2	8	3013992	3013999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9552	NC_015666	CCG	2	6	3014046	3014051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9553	NC_015666	CT	3	6	3014890	3014895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9554	NC_015666	GATA	2	8	3015227	3015234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_015666	CGT	2	6	3015666	3015671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_015666	AC	3	6	3017316	3017321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9557	NC_015666	CTT	2	6	3017339	3017344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9558	NC_015666	GCA	2	6	3017357	3017362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_015666	CGG	2	6	3017468	3017473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_015666	GGC	2	6	3017484	3017489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_015666	TAGT	2	8	3017494	3017501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_015666	TTG	2	6	3017516	3017521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_015666	GGT	3	9	3018449	3018457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_015666	GAA	2	6	3018460	3018465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_015666	CGG	2	6	3018475	3018480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_015666	GTC	3	9	3018490	3018498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9567	NC_015666	CGG	2	6	3019339	3019344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9568	NC_015666	GGACGG	2	12	3019382	3019393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9569	NC_015666	CGT	2	6	3019413	3019418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_015666	CG	3	6	3019419	3019424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9571	NC_015666	CG	3	6	3019450	3019455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9572	NC_015666	TGG	2	6	3019458	3019463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9573	NC_015666	CGATCC	2	12	3019483	3019494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9574	NC_015666	TCG	2	6	3019514	3019519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9575	NC_015666	GTC	2	6	3019586	3019591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_015666	CTC	2	6	3019657	3019662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9577	NC_015666	CGG	2	6	3020090	3020095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9578	NC_015666	CCGG	2	8	3020527	3020534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9579	NC_015666	AATG	2	8	3020537	3020544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_015666	CGGT	2	8	3021090	3021097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9581	NC_015666	TCG	3	9	3021101	3021109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9582	NC_015666	CGAC	2	8	3021120	3021127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9583	NC_015666	CCAAC	2	10	3021245	3021254	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9584	NC_015666	GC	3	6	3023992	3023997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9585	NC_015666	CGC	2	6	3024335	3024340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9586	NC_015666	GCG	2	6	3025715	3025720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9587	NC_015666	CGG	2	6	3025758	3025763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9588	NC_015666	GCGA	2	8	3025833	3025840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9589	NC_015666	GGC	2	6	3025855	3025860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9590	NC_015666	CCGA	2	8	3025861	3025868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9591	NC_015666	GCG	2	6	3025887	3025892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9592	NC_015666	TCG	2	6	3025902	3025907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9593	NC_015666	GCA	2	6	3025916	3025921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9594	NC_015666	CGGAA	2	10	3025934	3025943	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9595	NC_015666	ACT	2	6	3025950	3025955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9596	NC_015666	CGC	2	6	3026355	3026360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9597	NC_015666	CGAT	2	8	3026371	3026378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9598	NC_015666	CGAC	2	8	3026426	3026433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9599	NC_015666	TCT	2	6	3026451	3026456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9600	NC_015666	CGCT	2	8	3026465	3026472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9601	NC_015666	CCT	2	6	3026522	3026527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9602	NC_015666	CGA	2	6	3026540	3026545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NC_015666	TGA	2	6	3026561	3026566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_015666	CGTC	2	8	3026634	3026641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9605	NC_015666	CAA	2	6	3029254	3029259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9606	NC_015666	CGC	2	6	3029296	3029301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9607	NC_015666	GTC	2	6	3029307	3029312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9608	NC_015666	TG	3	6	3029628	3029633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_015666	CGC	2	6	3030370	3030375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9610	NC_015666	GT	3	6	3030383	3030388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_015666	CGGAAG	2	12	3030411	3030422	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9612	NC_015666	CCGG	2	8	3031615	3031622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9613	NC_015666	CCG	2	6	3031685	3031690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9614	NC_015666	GGC	2	6	3031712	3031717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9615	NC_015666	CCG	2	6	3032263	3032268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9616	NC_015666	CGAA	2	8	3032295	3032302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9617	NC_015666	TCG	2	6	3032337	3032342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9618	NC_015666	TCGG	2	8	3032411	3032418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9619	NC_015666	ATG	2	6	3032426	3032431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_015666	CGA	2	6	3032448	3032453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9621	NC_015666	C	6	6	3032459	3032464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9622	NC_015666	CGG	2	6	3032468	3032473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9623	NC_015666	CCG	3	9	3034400	3034408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9624	NC_015666	CCG	2	6	3036545	3036550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9625	NC_015666	GCC	2	6	3037505	3037510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9626	NC_015666	CACC	2	8	3038577	3038584	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9627	NC_015666	CGGA	2	8	3038594	3038601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9628	NC_015666	CTT	2	6	3038619	3038624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9629	NC_015666	GTCG	2	8	3038644	3038651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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9631	NC_015666	GC	3	6	3038739	3038744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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