MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015666	TC	3	6	2856711	2856716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9002	NC_015666	GTCT	2	8	2856720	2856727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9003	NC_015666	GGC	2	6	2856763	2856768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_015666	CCG	2	6	2858972	2858977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_015666	GCA	2	6	2859024	2859029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_015666	CGA	2	6	2859048	2859053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_015666	CG	3	6	2859055	2859060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9008	NC_015666	TTC	2	6	2859095	2859100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_015666	TAC	2	6	2859734	2859739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_015666	GTC	2	6	2859773	2859778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_015666	AGC	2	6	2859795	2859800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_015666	GCTGT	2	10	2859803	2859812	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9013	NC_015666	GTCACG	2	12	2859819	2859830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_015666	AG	3	6	2859969	2859974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_015666	TAT	2	6	2859977	2859982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_015666	GCC	2	6	2860014	2860019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9017	NC_015666	AGGG	2	8	2862758	2862765	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_015666	CCG	2	6	2862799	2862804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_015666	TCGC	2	8	2863071	2863078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9020	NC_015666	GTATC	2	10	2863152	2863161	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9021	NC_015666	GGAC	2	8	2863237	2863244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9022	NC_015666	CATT	2	8	2863251	2863258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_015666	TTA	2	6	2863303	2863308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_015666	GTC	2	6	2863392	2863397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_015666	CG	3	6	2863409	2863414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9026	NC_015666	ACT	2	6	2863415	2863420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_015666	GT	3	6	2863429	2863434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_015666	CCAC	2	8	2863458	2863465	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9029	NC_015666	GCC	2	6	2864030	2864035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9030	NC_015666	TC	3	6	2864037	2864042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9031	NC_015666	CGT	2	6	2864057	2864062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_015666	GTCT	2	8	2864079	2864086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9033	NC_015666	TCC	2	6	2864136	2864141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_015666	GTAC	2	8	2864605	2864612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9035	NC_015666	CGC	2	6	2865046	2865051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9036	NC_015666	CGG	2	6	2865105	2865110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_015666	GCC	2	6	2865115	2865120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9038	NC_015666	CTC	2	6	2865162	2865167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9039	NC_015666	TCGC	2	8	2865175	2865182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9040	NC_015666	GCG	2	6	2865185	2865190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_015666	CGC	2	6	2865191	2865196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_015666	GC	3	6	2865195	2865200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_015666	GTC	2	6	2865213	2865218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_015666	CGCT	2	8	2865223	2865230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9045	NC_015666	TCGC	2	8	2865238	2865245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_015666	CG	3	6	2865283	2865288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9047	NC_015666	AACGA	2	10	2865699	2865708	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9048	NC_015666	AGT	2	6	2865729	2865734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_015666	GCC	2	6	2866511	2866516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9050	NC_015666	CCGTCG	2	12	2867952	2867963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9051	NC_015666	AAC	2	6	2867996	2868001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_015666	ACG	2	6	2868022	2868027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_015666	G	6	6	2868044	2868049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_015666	CCG	2	6	2868492	2868497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_015666	G	6	6	2868506	2868511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_015666	CGG	2	6	2868541	2868546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_015666	GCGA	2	8	2870301	2870308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9058	NC_015666	GC	3	6	2870309	2870314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9059	NC_015666	CGT	2	6	2870358	2870363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_015666	GCCGTT	2	12	2870382	2870393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_015666	GTC	2	6	2870411	2870416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_015666	GTG	2	6	2870418	2870423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_015666	CG	3	6	2870901	2870906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_015666	CGC	2	6	2870925	2870930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_015666	TCG	2	6	2876264	2876269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_015666	C	6	6	2876270	2876275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9067	NC_015666	TGG	2	6	2876279	2876284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_015666	TCG	3	9	2876299	2876307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_015666	GGTC	2	8	2876325	2876332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9070	NC_015666	TCG	2	6	2876345	2876350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_015666	CGT	2	6	2876804	2876809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_015666	CGT	2	6	2876821	2876826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_015666	CGGT	2	8	2876842	2876849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9074	NC_015666	GC	3	6	2876876	2876881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9075	NC_015666	ACTGGT	2	12	2876895	2876906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9076	NC_015666	TC	3	6	2876929	2876934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9077	NC_015666	TGCG	2	8	2876986	2876993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9078	NC_015666	GTCGGC	2	12	2876994	2877005	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_015666	CCG	2	6	2877052	2877057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9080	NC_015666	GCC	2	6	2877066	2877071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9081	NC_015666	GTG	2	6	2877072	2877077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_015666	TTCGGG	2	12	2877144	2877155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9083	NC_015666	GGTCG	2	10	2877260	2877269	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9084	NC_015666	TCG	2	6	2877282	2877287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9085	NC_015666	GTTC	2	8	2877371	2877378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9086	NC_015666	AAG	2	6	2877513	2877518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_015666	GTT	2	6	2878612	2878617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_015666	TGG	2	6	2878627	2878632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_015666	TCG	2	6	2878674	2878679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_015666	TGG	2	6	2878765	2878770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_015666	CCGA	2	8	2878786	2878793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9092	NC_015666	CAG	2	6	2878801	2878806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9093	NC_015666	CGCC	2	8	2878908	2878915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9094	NC_015666	TCG	2	6	2878973	2878978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9095	NC_015666	CGAA	2	8	2879033	2879040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9096	NC_015666	ATT	2	6	2879077	2879082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_015666	GCG	2	6	2879946	2879951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_015666	GACGC	2	10	2879966	2879975	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9099	NC_015666	CGT	2	6	2881059	2881064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_015666	GATGTC	2	12	2882057	2882068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9101	NC_015666	CGGTC	2	10	2882099	2882108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9102	NC_015666	CGC	2	6	2882111	2882116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_015666	GCGA	2	8	2882126	2882133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9104	NC_015666	GTC	2	6	2883251	2883256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_015666	CGC	2	6	2883285	2883290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9106	NC_015666	A	6	6	2883358	2883363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_015666	AGC	2	6	2883373	2883378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_015666	CAG	2	6	2883383	2883388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_015666	CGTC	2	8	2885451	2885458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_015666	AGTA	2	8	2885472	2885479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_015666	GC	3	6	2885604	2885609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9112	NC_015666	ATCCG	2	10	2885617	2885626	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9113	NC_015666	GCT	2	6	2885698	2885703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_015666	GTC	2	6	2886212	2886217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_015666	TCG	2	6	2886236	2886241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_015666	TCG	2	6	2886264	2886269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_015666	TCG	2	6	2886292	2886297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_015666	CGTC	2	8	2886303	2886310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9119	NC_015666	TCG	2	6	2886313	2886318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_015666	CTC	2	6	2886962	2886967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9121	NC_015666	ACG	2	6	2886974	2886979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_015666	GCC	2	6	2887014	2887019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_015666	TCG	2	6	2887565	2887570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_015666	GTC	2	6	2887575	2887580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_015666	CGTTCA	2	12	2888154	2888165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_015666	CGTT	2	8	2888210	2888217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9127	NC_015666	GTC	2	6	2888233	2888238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_015666	TTC	2	6	2888241	2888246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_015666	TTC	2	6	2888251	2888256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_015666	GTC	2	6	2888263	2888268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9133	NC_015666	TCG	2	6	2889293	2889298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9143	NC_015666	GTG	2	6	2889553	2889558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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