MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015666	CGG	2	6	2726240	2726245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_015666	GTC	2	6	2726277	2726282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_015666	CGCT	2	8	2726283	2726290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8504	NC_015666	ACCGAC	2	12	2726308	2726319	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_015666	AATCC	2	10	2726420	2726429	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8506	NC_015666	GAA	2	6	2726437	2726442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_015666	TCC	2	6	2726570	2726575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8508	NC_015666	CCGACA	2	12	2726588	2726599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8509	NC_015666	CCGA	2	8	2726687	2726694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8510	NC_015666	GCT	2	6	2726732	2726737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_015666	CCG	2	6	2726766	2726771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8512	NC_015666	AAC	2	6	2726795	2726800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_015666	GAC	2	6	2726821	2726826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_015666	ACG	2	6	2726865	2726870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_015666	CCGCG	2	10	2726878	2726887	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8516	NC_015666	AGGC	2	8	2726914	2726921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8517	NC_015666	TCCA	2	8	2726924	2726931	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8518	NC_015666	CCG	2	6	2726951	2726956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_015666	TCGAT	2	10	2726978	2726987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8520	NC_015666	TA	3	6	2726998	2727003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_015666	CCG	2	6	2727037	2727042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_015666	GGAT	2	8	2727098	2727105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_015666	GTC	2	6	2727143	2727148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_015666	GC	3	6	2727312	2727317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8525	NC_015666	AGTGTG	2	12	2727332	2727343	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_015666	GA	3	6	2727379	2727384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_015666	GCA	2	6	2727715	2727720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_015666	GGT	2	6	2727806	2727811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_015666	GCC	2	6	2727844	2727849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_015666	TGA	2	6	2727872	2727877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_015666	TAT	2	6	2727882	2727887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_015666	CG	3	6	2727935	2727940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_015666	CG	3	6	2727946	2727951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8534	NC_015666	GCTTG	2	10	2727969	2727978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8535	NC_015666	GGAC	2	8	2728033	2728040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8536	NC_015666	CTGTG	2	10	2728174	2728183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8537	NC_015666	GGA	2	6	2728270	2728275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_015666	CAG	2	6	2728323	2728328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_015666	TGA	2	6	2728344	2728349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_015666	CTG	2	6	2728361	2728366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_015666	AGG	2	6	2728369	2728374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_015666	GCC	2	6	2728381	2728386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8543	NC_015666	CGAG	2	8	2728426	2728433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_015666	GTG	2	6	2728465	2728470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_015666	AGG	2	6	2728483	2728488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_015666	GGA	2	6	2728506	2728511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_015666	GTA	2	6	2728676	2728681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_015666	CA	3	6	2728725	2728730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8549	NC_015666	CGC	2	6	2728905	2728910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_015666	TCG	2	6	2728913	2728918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_015666	CCT	2	6	2729019	2729024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8552	NC_015666	AGG	2	6	2729030	2729035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_015666	CAC	2	6	2729143	2729148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8554	NC_015666	GTGG	2	8	2729160	2729167	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_015666	CAGC	2	8	2729180	2729187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_015666	GT	3	6	2729213	2729218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_015666	TGG	2	6	2729312	2729317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_015666	GAA	2	6	2729337	2729342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_015666	GAA	2	6	2729387	2729392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_015666	AAG	2	6	2729594	2729599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_015666	CTC	2	6	2729732	2729737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_015666	ACG	2	6	2729829	2729834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_015666	AAG	2	6	2729882	2729887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_015666	CGT	2	6	2729906	2729911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_015666	GT	3	6	2729936	2729941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_015666	GCA	2	6	2729998	2730003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_015666	GCC	2	6	2730012	2730017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8568	NC_015666	GAT	2	6	2730060	2730065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_015666	CCGA	2	8	2730193	2730200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8570	NC_015666	GAG	2	6	2730273	2730278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_015666	C	6	6	2730283	2730288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8572	NC_015666	GGT	2	6	2730418	2730423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_015666	AGC	2	6	2730458	2730463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_015666	CCA	2	6	2730534	2730539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8575	NC_015666	TAG	2	6	2730651	2730656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8577	NC_015666	GCC	2	6	2730825	2730830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8578	NC_015666	CTG	2	6	2730832	2730837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_015666	AG	3	6	2730914	2730919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_015666	GGC	2	6	2730985	2730990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_015666	TGCC	2	8	2731066	2731073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_015666	AAC	2	6	2731121	2731126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_015666	CGG	2	6	2731225	2731230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_015666	GTA	2	6	2731258	2731263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8586	NC_015666	TAGG	2	8	2731441	2731448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_015666	GCA	2	6	2731487	2731492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8589	NC_015666	GGA	2	6	2731535	2731540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_015666	GC	3	6	2731594	2731599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_015666	ACG	2	6	2731677	2731682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8593	NC_015666	GTC	2	6	2731773	2731778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_015666	GTT	2	6	2731867	2731872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8597	NC_015666	GCT	2	6	2731925	2731930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_015666	CAC	2	6	2732046	2732051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8599	NC_015666	ACC	2	6	2732102	2732107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8600	NC_015666	CA	3	6	2732199	2732204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8601	NC_015666	GGC	2	6	2732336	2732341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_015666	GCG	2	6	2732346	2732351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_015666	TCC	2	6	2732356	2732361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8604	NC_015666	CGC	2	6	2732444	2732449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_015666	CAA	2	6	2732474	2732479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_015666	TCG	2	6	2732483	2732488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_015666	GTT	2	6	2732498	2732503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_015666	CGG	2	6	2732507	2732512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_015666	TGCTA	2	10	2732577	2732586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8610	NC_015666	GC	3	6	2732591	2732596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8611	NC_015666	GCC	2	6	2732636	2732641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8612	NC_015666	CCG	2	6	2732644	2732649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8613	NC_015666	TCA	2	6	2732675	2732680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8615	NC_015666	ACT	2	6	2732780	2732785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_015666	CGGGC	2	10	2732900	2732909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8617	NC_015666	TCT	2	6	2733019	2733024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_015666	A	6	6	2733778	2733783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_015666	GCC	2	6	2733787	2733792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8620	NC_015666	CCG	2	6	2733794	2733799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8621	NC_015666	ACTG	2	8	2733820	2733827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8622	NC_015666	CGA	2	6	2733849	2733854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_015666	GTC	2	6	2734144	2734149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_015666	GTG	2	6	2734214	2734219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_015666	AT	3	6	2734228	2734233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_015666	TCA	2	6	2734268	2734273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_015666	CGA	2	6	2734296	2734301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_015666	GGC	2	6	2734333	2734338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8630	NC_015666	CGAT	2	8	2734489	2734496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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