MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015666	CG	3	6	2537065	2537070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_015666	CCG	2	6	2537128	2537133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_015666	CAG	2	6	2537837	2537842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_015666	T	6	6	2537900	2537905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_015666	CTT	2	6	2537910	2537915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_015666	CA	3	6	2539802	2539807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_015666	CAG	2	6	2539862	2539867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_015666	AG	3	6	2539906	2539911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015666	GCC	2	6	2539921	2539926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_015666	GCG	2	6	2540508	2540513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_015666	GAC	2	6	2540528	2540533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_015666	GCC	2	6	2540538	2540543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_015666	ACC	2	6	2546205	2546210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_015666	CGT	2	6	2546218	2546223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_015666	GCG	2	6	2546234	2546239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_015666	CGGT	2	8	2546304	2546311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8017	NC_015666	ACGCG	2	10	2546332	2546341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8018	NC_015666	CGA	2	6	2546419	2546424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_015666	GA	3	6	2546440	2546445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_015666	GC	3	6	2546450	2546455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_015666	CGGTC	2	10	2547789	2547798	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8022	NC_015666	TCG	2	6	2547810	2547815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_015666	CG	3	6	2547839	2547844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_015666	GGT	2	6	2547848	2547853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_015666	CTC	2	6	2547901	2547906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_015666	CAA	2	6	2547952	2547957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_015666	AACC	2	8	2549372	2549379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_015666	ATT	2	6	2549400	2549405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_015666	CGAGA	2	10	2549494	2549503	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8030	NC_015666	TC	3	6	2549560	2549565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_015666	ACC	2	6	2549567	2549572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_015666	AGT	2	6	2550841	2550846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_015666	CGAC	2	8	2550877	2550884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_015666	TGCA	2	8	2550921	2550928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_015666	ACGA	2	8	2550974	2550981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_015666	CAG	2	6	2551001	2551006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_015666	ATA	2	6	2551395	2551400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_015666	TCAAAA	2	12	2551530	2551541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8039	NC_015666	GTG	2	6	2551546	2551551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_015666	AC	3	6	2551577	2551582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_015666	CGGGC	2	10	2551691	2551700	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8042	NC_015666	CCG	2	6	2551844	2551849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_015666	CGGT	2	8	2551912	2551919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_015666	ACC	2	6	2551920	2551925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_015666	CGTT	2	8	2553390	2553397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_015666	TGC	2	6	2553409	2553414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_015666	GCG	2	6	2554080	2554085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_015666	CCG	2	6	2554156	2554161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_015666	CAG	2	6	2554183	2554188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_015666	TTG	2	6	2554598	2554603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_015666	AGA	2	6	2554667	2554672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_015666	CGG	2	6	2554674	2554679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_015666	CGGA	2	8	2557968	2557975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_015666	TCC	2	6	2558015	2558020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_015666	TTCG	2	8	2558106	2558113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_015666	GTG	2	6	2558118	2558123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_015666	CGT	3	9	2559270	2559278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_015666	ACCT	2	8	2560068	2560075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_015666	TTG	2	6	2561351	2561356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_015666	TAA	2	6	2561358	2561363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_015666	TGG	2	6	2561365	2561370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_015666	AACCG	2	10	2561393	2561402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8063	NC_015666	CGG	3	9	2561415	2561423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_015666	GACG	2	8	2562682	2562689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_015666	TCG	2	6	2562714	2562719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_015666	T	7	7	2562724	2562730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_015666	ACG	2	6	2562769	2562774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_015666	CAG	2	6	2562793	2562798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_015666	CGC	2	6	2563541	2563546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_015666	GAG	3	9	2563562	2563570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_015666	GA	3	6	2563576	2563581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_015666	TG	3	6	2563589	2563594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_015666	CGT	2	6	2563628	2563633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_015666	CGCC	2	8	2563942	2563949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8075	NC_015666	AATCGA	2	12	2565042	2565053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8076	NC_015666	GCG	2	6	2566123	2566128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_015666	CGG	2	6	2566929	2566934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_015666	TA	3	6	2567630	2567635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_015666	ACG	2	6	2571826	2571831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_015666	GCT	2	6	2573437	2573442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_015666	GACG	2	8	2573449	2573456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8082	NC_015666	AATA	2	8	2573462	2573469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_015666	CGG	2	6	2573487	2573492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_015666	TCGCG	2	10	2573509	2573518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8085	NC_015666	GCG	2	6	2573534	2573539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_015666	TA	3	6	2573756	2573761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_015666	CGA	2	6	2575181	2575186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_015666	GC	3	6	2575206	2575211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_015666	GGCC	2	8	2575726	2575733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_015666	CG	3	6	2575771	2575776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_015666	ATTA	2	8	2576043	2576050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_015666	AGA	2	6	2576119	2576124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_015666	GCC	2	6	2576130	2576135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_015666	CGAT	2	8	2576153	2576160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_015666	GCG	2	6	2576227	2576232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_015666	CGCC	2	8	2576263	2576270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8097	NC_015666	TCG	2	6	2576271	2576276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_015666	TA	3	6	2576505	2576510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_015666	TA	3	6	2576522	2576527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_015666	GGT	2	6	2576634	2576639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_015666	TCG	2	6	2576643	2576648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_015666	CGC	2	6	2577923	2577928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_015666	CGC	2	6	2577934	2577939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_015666	GACC	2	8	2578012	2578019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8105	NC_015666	ATT	2	6	2578037	2578042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_015666	TCTA	2	8	2578062	2578069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_015666	TA	3	6	2578086	2578091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_015666	AT	3	6	2578138	2578143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_015666	TCG	2	6	2578150	2578155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_015666	AC	3	6	2578168	2578173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_015666	GAA	2	6	2579766	2579771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_015666	ACG	2	6	2580108	2580113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_015666	CGA	2	6	2580117	2580122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_015666	GCC	2	6	2580151	2580156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_015666	CGGAG	2	10	2580473	2580482	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8116	NC_015666	GAG	2	6	2580501	2580506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_015666	TCGA	2	8	2580521	2580528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_015666	CGA	2	6	2580550	2580555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_015666	CCGTG	2	10	2581135	2581144	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8120	NC_015666	CGA	2	6	2581151	2581156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_015666	GCC	2	6	2581164	2581169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_015666	CGGC	2	8	2581174	2581181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_015666	GAT	2	6	2581234	2581239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_015666	ACCG	2	8	2581265	2581272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_015666	CGA	2	6	2581287	2581292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_015666	CGAG	2	8	2581341	2581348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_015666	CGC	2	6	2581365	2581370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_015666	ACG	2	6	2581989	2581994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_015666	TTGG	2	8	2582014	2582021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_015666	GAC	2	6	2582061	2582066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_015666	GGAC	2	8	2582141	2582148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8132	NC_015666	GAA	2	6	2582153	2582158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8134	NC_015666	TAC	2	6	2582249	2582254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8146	NC_015666	ACGA	2	8	2586544	2586551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8253	NC_015666	GACC	2	8	2636216	2636223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8254	NC_015666	CCG	2	6	2636272	2636277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8257	NC_015666	GCG	2	6	2636948	2636953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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