MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015666	ACC	2	6	2402272	2402277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_015666	CTG	2	6	2402291	2402296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_015666	GTGTCC	2	12	2402301	2402312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_015666	CAT	2	6	2402318	2402323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_015666	CAG	2	6	2402324	2402329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_015666	CGAG	2	8	2402344	2402351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7507	NC_015666	CGA	2	6	2402377	2402382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_015666	CGT	2	6	2402389	2402394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_015666	GGC	2	6	2402486	2402491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_015666	TCG	2	6	2402526	2402531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_015666	GAG	2	6	2402537	2402542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_015666	CGG	2	6	2402559	2402564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_015666	CGA	2	6	2402565	2402570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_015666	TTC	2	6	2402571	2402576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_015666	TCG	2	6	2402610	2402615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_015666	TCG	2	6	2402619	2402624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_015666	CCGA	2	8	2402625	2402632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7518	NC_015666	TCG	2	6	2402643	2402648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_015666	ATCG	2	8	2402660	2402667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7520	NC_015666	CAC	2	6	2402745	2402750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7521	NC_015666	AC	3	6	2402811	2402816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7522	NC_015666	GAC	2	6	2402892	2402897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_015666	CGACC	2	10	2402933	2402942	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7524	NC_015666	CGC	2	6	2402943	2402948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_015666	CGG	2	6	2402996	2403001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_015666	TCGGT	2	10	2403108	2403117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7527	NC_015666	CGC	2	6	2403155	2403160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7528	NC_015666	GGC	2	6	2403163	2403168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_015666	CACGTT	2	12	2403195	2403206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_015666	GCGACC	2	12	2403224	2403235	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7531	NC_015666	CGAT	2	8	2403254	2403261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7532	NC_015666	GCCG	2	8	2403282	2403289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7533	NC_015666	CGA	2	6	2403321	2403326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_015666	TCTCC	2	10	2403331	2403340	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7535	NC_015666	CGG	2	6	2403353	2403358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_015666	GGC	2	6	2403407	2403412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_015666	CAG	2	6	2404636	2404641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_015666	GCG	2	6	2404737	2404742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_015666	CGA	2	6	2404781	2404786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_015666	CGG	2	6	2405197	2405202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_015666	GCG	2	6	2405203	2405208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_015666	CGC	2	6	2405222	2405227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7543	NC_015666	GGA	2	6	2405245	2405250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_015666	CGC	2	6	2405279	2405284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7545	NC_015666	GGTCAC	2	12	2407716	2407727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_015666	GAG	2	6	2407795	2407800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_015666	GCG	2	6	2407836	2407841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_015666	CGCGG	2	10	2407850	2407859	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7549	NC_015666	CGAC	2	8	2407910	2407917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7550	NC_015666	CG	3	6	2407929	2407934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7551	NC_015666	GGT	3	9	2408033	2408041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_015666	TCGG	2	8	2408044	2408051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7553	NC_015666	ATA	2	6	2408082	2408087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_015666	ACA	2	6	2408109	2408114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_015666	ACG	2	6	2408194	2408199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_015666	TTC	2	6	2410410	2410415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_015666	AAG	2	6	2410429	2410434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_015666	GCGA	2	8	2410443	2410450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7559	NC_015666	GGC	2	6	2411727	2411732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_015666	GTA	2	6	2411750	2411755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_015666	GAC	2	6	2415892	2415897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_015666	GCTC	2	8	2416282	2416289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7563	NC_015666	TA	3	6	2416291	2416296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_015666	GGC	2	6	2416338	2416343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_015666	CGC	2	6	2416410	2416415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7566	NC_015666	ACG	2	6	2417835	2417840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_015666	TCG	2	6	2417858	2417863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_015666	CAG	2	6	2417897	2417902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_015666	GTCG	2	8	2417908	2417915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7570	NC_015666	GCC	2	6	2418407	2418412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_015666	GTT	2	6	2418558	2418563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_015666	CGT	2	6	2419780	2419785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_015666	TA	3	6	2419848	2419853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_015666	TTCCGA	2	12	2419918	2419929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_015666	CGT	2	6	2419930	2419935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7576	NC_015666	TCGT	2	8	2419946	2419953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7577	NC_015666	GAC	2	6	2419966	2419971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_015666	GAC	2	6	2420021	2420026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_015666	CCGT	2	8	2420090	2420097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7580	NC_015666	ACG	2	6	2420175	2420180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_015666	CCG	2	6	2420229	2420234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7582	NC_015666	GGC	2	6	2422083	2422088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_015666	GTCG	2	8	2422117	2422124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7584	NC_015666	CG	3	6	2422168	2422173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7585	NC_015666	GGC	2	6	2422211	2422216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_015666	GC	3	6	2422361	2422366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7587	NC_015666	ACAG	2	8	2422379	2422386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7588	NC_015666	TAATT	2	10	2422387	2422396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_015666	CGT	2	6	2422755	2422760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_015666	TTA	2	6	2422762	2422767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_015666	TCG	2	6	2422780	2422785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_015666	C	6	6	2424973	2424978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7593	NC_015666	GCG	2	6	2425000	2425005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_015666	CGT	2	6	2425215	2425220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_015666	TCGG	2	8	2425325	2425332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7596	NC_015666	TCG	2	6	2425362	2425367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_015666	CTC	2	6	2425377	2425382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7598	NC_015666	ACT	2	6	2425388	2425393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_015666	GGT	2	6	2425395	2425400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_015666	CGA	2	6	2425420	2425425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_015666	GAC	2	6	2426247	2426252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_015666	TA	3	6	2426333	2426338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_015666	GTC	2	6	2426358	2426363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_015666	CGT	2	6	2426378	2426383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7605	NC_015666	GAAA	2	8	2426404	2426411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_015666	CGG	2	6	2426430	2426435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7607	NC_015666	TCG	2	6	2426457	2426462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_015666	TCG	2	6	2429891	2429896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_015666	C	6	6	2429899	2429904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7610	NC_015666	CGG	2	6	2429909	2429914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_015666	CGG	2	6	2429941	2429946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_015666	CCG	2	6	2429993	2429998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7613	NC_015666	CGG	2	6	2430002	2430007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_015666	GATCG	2	10	2430019	2430028	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7615	NC_015666	CGA	2	6	2430031	2430036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_015666	GACG	2	8	2430477	2430484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7617	NC_015666	CGC	2	6	2430521	2430526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7618	NC_015666	AC	3	6	2430725	2430730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_015666	CGTT	2	8	2430744	2430751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7620	NC_015666	CCG	2	6	2432942	2432947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7621	NC_015666	GTC	2	6	2432970	2432975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_015666	CGC	2	6	2433006	2433011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7623	NC_015666	CGA	2	6	2433053	2433058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_015666	ACG	2	6	2433064	2433069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_015666	TCG	2	6	2433105	2433110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_015666	TCT	3	9	2433355	2433363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7628	NC_015666	GCG	2	6	2433399	2433404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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