MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015666	A	6	6	2242841	2242846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_015666	CGAG	2	8	2242873	2242880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_015666	CGC	2	6	2242887	2242892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_015666	TGG	2	6	2244641	2244646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_015666	AAC	2	6	2244739	2244744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_015666	AT	3	6	2244760	2244765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_015666	TAA	2	6	2244781	2244786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_015666	GTCT	2	8	2244809	2244816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_015666	AACC	2	8	2244841	2244848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_015666	AGC	2	6	2244949	2244954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_015666	GGA	2	6	2244955	2244960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_015666	AGC	2	6	2244978	2244983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_015666	TCT	2	6	2244989	2244994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_015666	TCT	2	6	2245002	2245007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_015666	TG	3	6	2245021	2245026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_015666	CGG	2	6	2245062	2245067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_015666	GCG	2	6	2247294	2247299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_015666	CCGTCC	2	12	2247301	2247312	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_015666	CAAC	2	8	2247452	2247459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_015666	ACT	2	6	2248582	2248587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_015666	TCA	2	6	2248660	2248665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_015666	CGC	2	6	2248677	2248682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_015666	ACC	2	6	2248954	2248959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_015666	ACG	2	6	2248966	2248971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_015666	CGCGC	2	10	2248981	2248990	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7026	NC_015666	CGT	2	6	2249887	2249892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_015666	TC	3	6	2249908	2249913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_015666	CGGGC	2	10	2249914	2249923	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7029	NC_015666	GTC	2	6	2251010	2251015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_015666	GCT	2	6	2251032	2251037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_015666	CAT	2	6	2253256	2253261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_015666	GC	3	6	2253269	2253274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_015666	ACC	2	6	2253338	2253343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7034	NC_015666	GCCG	2	8	2253348	2253355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_015666	A	6	6	2253371	2253376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_015666	CGG	2	6	2253383	2253388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_015666	CGAT	2	8	2253392	2253399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7038	NC_015666	GTG	2	6	2255150	2255155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_015666	GTTG	2	8	2255181	2255188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_015666	TCG	2	6	2256455	2256460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_015666	AGTG	2	8	2257456	2257463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_015666	TGC	2	6	2260463	2260468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_015666	GA	4	8	2260479	2260486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_015666	CTCC	2	8	2260494	2260501	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7045	NC_015666	CGA	2	6	2260611	2260616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_015666	GAA	2	6	2260625	2260630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_015666	CCT	2	6	2260654	2260659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7048	NC_015666	AAG	2	6	2260661	2260666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_015666	ACCG	2	8	2262019	2262026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_015666	CCT	2	6	2262062	2262067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_015666	TGT	2	6	2262146	2262151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_015666	CAG	2	6	2262239	2262244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_015666	TGCT	2	8	2262248	2262255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7054	NC_015666	TGA	2	6	2262270	2262275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_015666	CGT	2	6	2267978	2267983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_015666	CGGTA	2	10	2267990	2267999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7057	NC_015666	TA	3	6	2267998	2268003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_015666	GGT	2	6	2271753	2271758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_015666	CGA	2	6	2271770	2271775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_015666	CG	3	6	2272974	2272979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_015666	TACG	2	8	2274132	2274139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7062	NC_015666	CGG	2	6	2274153	2274158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_015666	GCG	2	6	2274670	2274675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_015666	TCGAG	2	10	2274686	2274695	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7065	NC_015666	TCT	2	6	2275736	2275741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_015666	CGG	2	6	2275765	2275770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_015666	GC	3	6	2275786	2275791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7068	NC_015666	GCCGTC	2	12	2275800	2275811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_015666	CGG	2	6	2275839	2275844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_015666	GTA	2	6	2278775	2278780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_015666	GTC	2	6	2278801	2278806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_015666	ACG	2	6	2278875	2278880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_015666	TCT	2	6	2278888	2278893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_015666	GGTGG	2	10	2278936	2278945	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_015666	GGC	2	6	2278958	2278963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_015666	ACGA	2	8	2279030	2279037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7077	NC_015666	CAA	2	6	2279455	2279460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_015666	GTTT	2	8	2279462	2279469	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_015666	CCG	2	6	2279481	2279486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_015666	CG	3	6	2279958	2279963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_015666	CTCGTC	2	12	2279973	2279984	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_015666	TCG	3	9	2280498	2280506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_015666	GAC	2	6	2280528	2280533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_015666	GTT	2	6	2280621	2280626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_015666	GC	4	8	2280733	2280740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_015666	GC	3	6	2280743	2280748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_015666	CGT	2	6	2280765	2280770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_015666	A	6	6	2280788	2280793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_015666	CTG	2	6	2280850	2280855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_015666	ACTC	2	8	2280894	2280901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7091	NC_015666	CGTC	2	8	2280945	2280952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_015666	ACG	2	6	2280996	2281001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_015666	GTG	2	6	2281003	2281008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_015666	CA	3	6	2281015	2281020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7095	NC_015666	GACAC	2	10	2281022	2281031	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7096	NC_015666	CGC	2	6	2281034	2281039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7097	NC_015666	GAG	2	6	2281074	2281079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_015666	GAC	2	6	2281081	2281086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_015666	CGT	2	6	2281094	2281099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_015666	CGGG	2	8	2281104	2281111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7101	NC_015666	CGA	2	6	2281129	2281134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_015666	GCGG	2	8	2281136	2281143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7103	NC_015666	CCG	2	6	2281150	2281155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7104	NC_015666	CG	3	6	2281169	2281174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_015666	CTG	2	6	2281192	2281197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_015666	ACG	2	6	2281206	2281211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_015666	CG	3	6	2281219	2281224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_015666	CTT	2	6	2289012	2289017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_015666	ACAG	2	8	2289037	2289044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7110	NC_015666	CCG	2	6	2289055	2289060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7111	NC_015666	CCG	2	6	2289793	2289798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_015666	C	6	6	2290913	2290918	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7113	NC_015666	TAC	2	6	2291049	2291054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_015666	TCC	2	6	2291080	2291085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_015666	ACCG	2	8	2291587	2291594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_015666	TCGA	2	8	2291597	2291604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7117	NC_015666	AATCG	2	10	2291611	2291620	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7118	NC_015666	GCC	2	6	2291622	2291627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7119	NC_015666	TCCGTT	2	12	2291631	2291642	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_015666	GCC	2	6	2291682	2291687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_015666	TCG	2	6	2292793	2292798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_015666	TA	3	6	2292930	2292935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_015666	GTTC	2	8	2292946	2292953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_015666	CGA	2	6	2293267	2293272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_015666	A	6	6	2293299	2293304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_015666	TGCGAG	2	12	2293360	2293371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7127	NC_015666	CGA	2	6	2293391	2293396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_015666	TCG	2	6	2293409	2293414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_015666	CTA	2	6	2294871	2294876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_015666	TGT	2	6	2294889	2294894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_015666	TGG	2	6	2295013	2295018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_015666	CGAG	2	8	2295081	2295088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7133	NC_015666	TGA	2	6	2295431	2295436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7135	NC_015666	CGC	2	6	2295558	2295563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7138	NC_015666	CGATAT	2	12	2295584	2295595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7139	NC_015666	CCCT	2	8	2295607	2295614	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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7161	NC_015666	CGT	2	6	2298632	2298637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7163	NC_015666	CGTT	2	8	2299401	2299408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7242	NC_015666	CCGG	2	8	2322720	2322727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7243	NC_015666	GTC	2	6	2322737	2322742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7252	NC_015666	TATCG	2	10	2324396	2324405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7253	NC_015666	CGG	2	6	2324535	2324540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7256	NC_015666	CGAC	2	8	2324589	2324596	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7257	NC_015666	G	6	6	2328171	2328176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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7259	NC_015666	CCG	2	6	2328267	2328272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7260	NC_015666	TCGAG	2	10	2328342	2328351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7261	NC_015666	CAG	2	6	2329583	2329588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7262	NC_015666	TAA	2	6	2329628	2329633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7263	NC_015666	GAC	2	6	2329637	2329642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7266	NC_015666	CG	3	6	2332321	2332326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7374	NC_015666	ACGCG	2	10	2369690	2369699	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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7378	NC_015666	TCG	2	6	2370006	2370011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7379	NC_015666	ACCG	2	8	2370018	2370025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7380	NC_015666	GCG	2	6	2370064	2370069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7383	NC_015666	TGG	2	6	2370443	2370448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7385	NC_015666	CGC	2	6	2370481	2370486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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